ラット舌癌におけるmiRNAの発現プロファイルとエピジェネティクス機構の解明

2009 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21592393
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: 田沼 順一 Kagoshima University, 大学院・医歯学総合研究科, 准教授 (20305139)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 仙波 伊知郎 鹿児島大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (60145505)
• Keywords: 舌癌 / siRNA / メチル化 / Real-time PCR / miRNA

Research Abstract

本研究はmiRNA発現プロファイルによるmiRNAの選抜、miRNAのエピジェネティクスな発現調節の解明、siRNAのラットおよび培養細胞へ導入よる制御機構の解明を目的としたものである。
miRNA検出と定量の解析にはTaqMan Assayと定量リアルタイムPCRを用います。Appiled Biosytems Step One plus Fast : Real time PCR機器を使用し、miRNAに対して特異性を持つ逆転写プライマーを用いて、個々のmiRNAごとに逆転写反応を行い、この反応により成熟型miRNAを特異的に逆転写する。Loop構造を持つ逆転写プライマー由来の配列が、特異性を持つリバースプライマーとして機能するため、特異性を高めることが出来る。さらにTaqMan PreAmp Master MixによりターゲットとするmiRNAを特異的に解析実行中であります。
また、新規に選抜されたmiRNAと今までに報告されたmiRNAを用いて解析を同時に行う予定であります。方法は、舌がん発生細胞または舌癌細胞株を用いて、DNAメチル化阻害剤である5-Aza-Cdやヒストン脱アセチル化酵素阻害剤で処理し、高発現するmiRNAを選択して、CpCアイランド領域に存在するmiRNAは、異常によりその発現が抑制されていたのかを個々RT-PCR法により解析する。なお解析する遺伝子は以下の通りである。
癌遺伝子:miR-17-92,miR-21,miR-106a,nmiR-155/BIC,mir-221/222,miR-372/373
癌抑制遺伝子:let-7 family,miR-15a/16,miR-29,miR-34,mir=122a,miR-125b,miR-127

Research Products

• [Journal Article] FGFR4 Gly388Arg polymorphism, TP53 mutation, and their combinations are prognostic factors for oral squamous cell carcinoma (2010)
  • Author(s): Tanuma J, Izumo T, Hirano M, Oyazato Y, Hori F, Umemura E, Shisa H, Hiai H, Kitano M.
  • Journal Title: Oncology Reports 23 Pages: 739-744
  • Peer Reviewed