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2009 Fiscal Year Annual Research Report

アーキアハンティング・純粋分離で解明する未知アーキア(古細菌)の新生物機能

Research Project

Project/Area Number 21687006
Research InstitutionJapan Agency for Marine-Earth Science and Technology

Principal Investigator

井町 寛之  Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 海洋・極限環境生物圏領域, 主任研究員 (20361933)

Keywordsアーキア / 分離 / メタン
Research Abstract

本年度はメタンの生成および酸化に関与する未培養アーキアの培養を試みた。これらのアーキアは従来のバッチ式の集積培養法では培養が困難であると考え、微生物学的廃水処理で用いられている散水ろ床方式の下降流懸垂型スポンジリアクターを参考にした新規なバイオリアクターを考案し、その培養を試みた。深海底堆積物を植種源として、メタン生成アーキアおよびメタン酸化アーキアの培養を行った結果、水質およびガス分析の結果は生物学的にメタンの生成および酸化がされていることが強く示唆していた。続いて、リアクター内部に培養されたきた微生物種を特定するために、リアクターからサンプリングを行い、DNAおよびRNAを鋳型とした16S rRNA遺伝子に基づいたクローン解析を行った。その結果、メタン生成アーキアの培養を狙ったリアクター内部には既知のメタン生成アーキア群に近縁なクローンも検出された一方で、深海底堆積物環境中に優占的かつ普遍的に存在する未培養アーキアであるDeep-Sea Archaeal Groupに属するクローンも検出された。また、メタン酸化アーキアの培養を狙ったリアクターからは過去の分子生物学的手法を用いた研究から嫌気的メタン酸化を担っていると推定されているANMEと呼ばれるアーキアが培養されてきていることがクローン解析により強く示唆された。さらにこれらリアクターで培養されてきた微生物群集に対してFISH法を適用したところ、リアクターを用いて培養を行うことで未培養アーキアの代謝活性が高められていることが判明した。

  • Research Products

    (14 results)

All 2010 2009

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Methanoregula formicica sp. nov., a novel methane-producing archaeon isolated from methanogenic sludge2010

    • Author(s)
      Yashiro, Y.
    • Journal Title

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbilogy (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Peptide nucleic acids (PNAs) antisense effect to bacterial growth and their application potentiality in biotechnology2010

    • Author(s)
      Hatamoto, M.
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 86

      Pages: 397-402

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of single copy genes by two-pass tyramide signal amplification fluorescence in situ hybridization(two-pass TSA-FISH) with single olig onucleotide probes2010

    • Author(s)
      Kawakami, S.
    • Journal Title

      Microbes and Environments 25

      Pages: 15-21

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methanocella arvoryzae sp. nov., a hydrogenotrophic methanogen, isolated from Italian rice field soil2010

    • Author(s)
      Sakai, S
    • Journal Title

      Intemational Journal of Systematic and Evolutionary Microbilogy (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of 16S rRNA gene-targeted primers for detection of archaeal anaerobic methanotrophs (ANMEs)2009

    • Author(s)
      Miyashita, A.
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters 297

      Pages: 31-37

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cultivation of methanogens under low hydrogen conditions by using coculture method2009

    • Author(s)
      Sakai, S.
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 75

      Pages: 4892-4896

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sequence specific bacterial growth inhibition by peptide nucleic acid tareted to the mRNA binding site of 16S rRNA2009

    • Author(s)
      Hatamoto, M.
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 84

      Pages: 1161-1168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular characterization of potential nitrogen fixation by anaerobic methane oxidizing archaea in the methane-seep sediments at the No. 8 Kumano Knoll in the Kumano Basin, offshore of Japan2009

    • Author(s)
      Miyazaki, J.
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 75

      Pages: 7153-7162

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 排水処理リアクターを利用した難培養性深海底メタン生成菌の培養2009

    • Author(s)
      井町寛之
    • Journal Title

      用水と廃水 51

      Pages: 53-76

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 有新規微生物間共生培養法によるメタン生成古細菌の分離培養と系統分類2009

    • Author(s)
      井町寛之
    • Journal Title

      IFO Research Communications 23

      Pages: 39-56

  • [Presentation] 微生物学的廃水処理リアクターを利用した難培養性深海メタン生成アーキアの培養2010

    • Author(s)
      青井健
    • Organizer
      第44回日本水環境学会年会
    • Place of Presentation
      福岡大学七隈キャンパス
    • Year and Date
      2010-03-16
  • [Presentation] 嫌気的メタシ酸化アーキアの培養の試み2009

    • Author(s)
      井町寛之
    • Organizer
      第25回日本微生物生態学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学東広島キャンパス
    • Year and Date
      2009-11-21
  • [Presentation] 微生物学的廃水処理リアクターを利用した深海底メタン生成菌の培養の試み2009

    • Author(s)
      青井健
    • Organizer
      第25回日本微生物生態学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学東広島キャンパス
    • Year and Date
      2009-11-21
  • [Presentation] 深海底堆積物からの難培養性メタン生成アーキアの培養-石の上にも3年物語-2009

    • Author(s)
      井町寛之
    • Organizer
      日本Archaea研究会第22回大会
    • Place of Presentation
      産業技術総合研究所北海道センター
    • Year and Date
      2009-07-11

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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