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2011 Fiscal Year Final Research Report

Design of a bioreductively-activated fluorescent probe for tumor hypoxia imaging

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 21710232
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Living organism molecular science
Research InstitutionKyoto University (2010-2011)
The University of Tokushima (2009)

Principal Investigator

NAKATA Eiji  京都大学, エネルギー理工学研究所, 講師 (70467827)

Project Period (FY) 2009 – 2011
Keywordsケミカルバイオロジー / バイオイメージングプローブ
Research Abstract

Rational design methodology of the novel fluorescent probe to detect the enzymatic activity not only in test tube but also in cell was developed. For example, the fluorescent probe which could be activated in the bioreductive condition can detect the tumor hypoxia. The fluorescent probe showed clear differences in fluorescence behavior between hypoxic and aerobic conditions in the live cell.

  • Research Products

    (66 results)

All 2012 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (19 results) Presentation (41 results) Book (2 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results)

  • [Journal Article] Positional effects of phosphorylation on the stability and morphology of tau-related amyloid fibrils2012

    • Author(s)
      Masafumi Inoue, Takashi Konno, Kazuki Tainaka, Eiji Nakata, Hiro-o Yoshida, Takashi Morii
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: Vol.51, No.7 Pages: 1396-1406

    • DOI

      DOI:10.1021/bi201451z

  • [Journal Article] Zinc-Finger Proteins for Site-Specific Protein Positioning on DNA-Origami Structures2012

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Fong Fong Liew, Chisana Uwatoko, Shigeki Kiyonaka, Yasuo Mori, Yousuke Katsuda, Masayuki Endo, Hiroshi Sugiyama and Takashi Morii
    • Journal Title

      Angew Chem. Int. Ed

      Volume: Vol.51, No.10 Pages: 2421-2424

    • DOI

      DOI:10.1002/anie.201108199

  • [Journal Article] Effect of the Gc-derived Macrophage-activating Factor Precursor(preGcMAF) on Phagocytic Activation of Mouse Peritoneal Macrophages2011

    • Author(s)
      Yoshihiro Uto, Syota Yamamoto, Ryota Takeuchi, Yoshinori Nakagawa, KeijiHirota, Hiroshi Terada, Shinya Onizuka, Eiji Nakata and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: Vol.31 Pages: 2489-2492

    • URL

      http://ar.iiarjournals.org/content/31/7/2489.abstract

  • [Journal Article] Design Synthesis and Destructive Dynamic Effects of BODIPY-containing and Curcuminoid Boron Traced rugs for Neutron Dynamic Therapy2011

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Masato Koizumi, Yohei Yamashita, Kenta Onaka, Yoshinori Sakurai, Natsuko Kondo, Koji Ono, Yoshihiro Uto and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: Vol.31 Pages: 2477-2482

    • URL

      http://ar.iiarjournals.org/content/31/7/2477.abstract

  • [Journal Article] A ribonucleopeptide module for effective conversion of an RNA a tamer to a fluorescent sensor2011

    • Author(s)
      Fong Fong Liew, Hironori Hayashi, ShunNakano, Eiji Nakata, Takashi Morii
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: Vol.19, No.19 Pages: 5771-5775

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bmc.2011.08.031

  • [Journal Article] Construction of Dopamine Sensors by Using Fluorescent Ribonucleopeptide Complexes2011

    • Author(s)
      Fong Fong Liew, Tetsuya Hasegawa, Masatora Fukuda, Eiji Nakata, Takashi Morii
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: Vol.19, No.15 Pages: 4473-4481

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bmc.2011.06.031

  • [Journal Article] Facile conversion of RNA aptamers to modular fluorescent sensors with tunable detection wavelengths2011

    • Author(s)
      Shun Nakano, Eiji Nakata and Takashi Morii
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: Vol.21, No.15 Pages: 4503-4506

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bmcl.2011.05.120

  • [Journal Article] Formation and regulation of fullerene-incorporation in liposomes under the phase transition temperature2011

    • Author(s)
      Atsushi Ikeda, Yoshihiko Kawai, Jun-ichi Kikuchi, Motofusa Akiyama, Eiji Nakata, Yoshihiro Uto and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Org. Biomol. Chem

      Volume: Vol.9 Pages: 2622-2627

    • DOI

      DOI:10.1039/c0ob01030h

  • [Journal Article] Evaluation of In Vivo Radiosensitizing Activity of Etanidazole as Hypoxic Cell Radiosensitizer Using Tumor-bearing Chick Embryo2011

    • Author(s)
      Chiaki Abe, Yoshihiro Uto, Takashi Nakae, Yuuya Shinmoto, Keiichiro Sano, Hiroko Nakata, Mizue Teraoka, Yoshio Endo, Hiroshi Maezawa, Shin-ichiro Masunaga, Eiji Nakata and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      J. Radiat. Res

      Volume: Vol.52 Pages: 208-214

    • DOI

      DOI:10.1269/jrr.10122

  • [Journal Article] Synthesis and photo physical properties of new SNARF derivatives as dual emission pH sensors2011

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Yukimachi, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto, and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: Vol.21, No.6 Pages: 1663-1666

    • DOI

      DOI:10.1246/cl.2010.734

  • [Journal Article] がんの特異的な検出を目指した蛍光イメージング法の最近の展開2011

    • Author(s)
      中田栄司, 森井孝, 宇都義浩, 堀均
    • Journal Title

      放射線生物研究

      Volume: 46(2) Pages: 145-157

  • [Journal Article] Design of a SNARF-based ratiometric fluorescent probe for esterase2010

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Uto, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto, and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: Vol.39, No.7 Pages: 734-735

    • DOI

      DOI:10.1246/cl.2010.734

  • [Journal Article] A newly designed cell-permeable SNARF derivative as an effective intracellular pH indicator2010

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Yoshijiro Nazumi, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: Vol.46, No.20 Pages: 3526-3528

    • DOI

      DOI:10.1039/c003167d

  • [Journal Article] Medicinal electronomics bricolage design of hypoxia-targeting antineoplastic drugs and invention of boron trace drugs as innovative future-architectural drugs2010

    • Author(s)
      Hitoshi Hori, Yoshihiro Uto, Eiji Nakata
    • Journal Title

      Anticancer Res

      Volume: 30 Pages: 3233-3242

  • [Journal Article] Design of a bioreductively-activated fluorescent pH probe for tumor hypoxia imaging2009

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Yoshihiro Yukimachi, Hirokazu Kariyazono, Seongwang Im, Chiaki Abe, Yoshihiro Uto, Hiroshi Maezawa, Toshihiro Hashimoto, Yasuko Okamoto and Hitoshi Hori
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: Vol.17, No.19 Pages: 6592-6958

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bmc.2009.08.037

  • [Journal Article] Semisynthetic fluorescent sensor proteins based on self-labeling protein tags2009

    • Author(s)
      Matthias A. Brun, Kui-Thong Tan, Eiji Nakata, Marlon J. Hinner and Kai Johnsson
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: Vol.131, No.16 Pages: 5873-5884

    • DOI

      DOI:10.1021/ja900149e

  • [Journal Article] Selective cross-linking of interacting proteins using self-labeling tags2009

    • Author(s)
      Arnaud Gautier, Eiji Nakata, Grazvydas Lukinavicius, Kui-Thong Tan and Kai Johnsson
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: Vol.131, No.49 Pages: 17954-17962

    • DOI

      DOI:10.1021/ja907818q

  • [Journal Article] Recent Progress in Strategies for Creation of Protein-based Fluorescent Biosensors2009

    • Author(s)
      Hangxiang Wang, Eiji Nakata and Itaru Hamachi
    • Journal Title

      Chem BioChem

      Volume: Vol.10, No.16 Pages: 2560-2577

  • [Journal Article] 次世代動物実験系としての腫瘍移植鶏卵の構築と放射線照射による腫瘍成長阻害活性2009

    • Author(s)
      安部千秋, 宇都義浩, 遠藤良夫, 新元優也, 中島宏一郎, 佐野圭一郎, 佐々木有紀, 皆巳和賢, 前澤博, 増永慎一郎, 中田栄司, 堀均
    • Journal Title

      放射線生物研究

      Volume: Vol.44, No.2 Pages: 233. 241

  • [Presentation] タウタンパク質由来の凝集性ペプチドによるアミロイド線維形成能の評価2012

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学
    • Year and Date
      20120325-28
  • [Presentation] 準安定複合体を利用したRNA検出蛍光プローブの開発2012

    • Author(s)
      松本桂彦・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学
    • Year and Date
      20120325-28
  • [Presentation] Zinc Finger proteinを介したDNA origami上への機能性タンパク質の配置2012

    • Author(s)
      西口泰裕・LIEW Fong Fong・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学
    • Year and Date
      20120325-28
  • [Presentation] RNAアプタマーを用いた機能性リボヌクレオペプチドの段階的構築2012

    • Author(s)
      田村友樹・仲野瞬・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学
    • Year and Date
      20120325-28
  • [Presentation] バイオイメージングを指向した蛍光プローブの新しい設計法の開発2012

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      第2回分子ナノテクノロジーセンターシンポジウム
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      2012-03-13
  • [Presentation] RNA高精度検出用蛍光プローブ2012

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      大学シーズ説明発表会
    • Place of Presentation
      京都リサーチパーク
    • Year and Date
      2012-01-27
  • [Presentation] Sequence selective RNA detection by metastable PNA/RNA fluorescence probe2011

    • Author(s)
      Matsumoto K., Nakata E., Saito I., Morii T.
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Year and Date
      20111109-11
  • [Presentation] Facile conversion of RNA aptamers to modular fluorescent sensors2011

    • Author(s)
      Tamura T., Nakano S., Nakata E., Morii T.
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Hokkaido
    • Year and Date
      20111109-11
  • [Presentation] Development of the immobilization technology of functional proteins on DNA origami2011

    • Author(s)
      Nakata E., 他
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      Hokkaido
    • Year and Date
      20111109-11
  • [Presentation] 準安定二重鎖を用いたRNA配列認識PNA蛍光センサー2011

    • Author(s)
      松本桂彦, 中田栄司, 森井孝
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      20110912-14
  • [Presentation] DNA origami上への機能性タンパク質固定化技術の開発2011

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第5回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      20110912-14
  • [Presentation] 高いDNA/RNA配列認識能を有するPNA蛍光センサー2011

    • Author(s)
      松本桂彦・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      20110722-23
  • [Presentation] RNPを用いたモジュール型蛍光センサーの作製2011

    • Author(s)
      田村友樹・仲野瞬・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      20110722-23
  • [Presentation]2011

    • Author(s)
      西口泰裕・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      生体関連化学部会若手の会23回サマースクール
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      20110722-23
  • [Presentation] RNA高精度検出用蛍光プローブ2011

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      グローバルCOE「地球温暖化時代のエネルギー科学拠点」産学連携シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都テルサ
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] 細胞内pH計測用自己集合型蛍光プローブ2011

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      グローバルCOE「地球温暖化時代のエネルギー科学拠点」産学連携シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都テルサ
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Development of the attachment technology of functional proteins on DNA origami2011

    • Author(s)
      Ngo T. A., Nakata E., Liew F. F., Nishiguchi Y., Morii T.
    • Organizer
      11th iCeMS International Symposium
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2011-12-06
  • [Presentation] 高い配列認識能をもつPNA蛍光センサーによるRNA検出2011

    • Author(s)
      松本桂彦・中田栄司・森井孝
    • Organizer
      生体関連化学部会第26回若手フォーラム
    • Place of Presentation
      筑波大学
    • Year and Date
      2011-09-11
  • [Presentation] SNARFを基本骨格とした蛍光プローブの設計戦略2011

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      日本化学会第91春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-03-28
  • [Presentation] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発2011

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      「医工連携をめざした生体光計測」フォーラム
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      2011-03-04
  • [Presentation] 細胞内pH計測により適合した新規SNARF誘導体の設計2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第12回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      福井県芦原温泉清風荘
    • Year and Date
      20100108-09
  • [Presentation] Development of novel cell-permeable SNARF derivative as an intracellular fluorescent pH indicator2010

    • Author(s)
      Eiji Nakata, 他
    • Organizer
      Pasific Chem 2010
    • Place of Presentation
      Hawai
    • Year and Date
      2010-12-20
  • [Presentation] ダイナミックドラッグ創生へのアプローチ-ボロントレースドラッグ仕様BODIPY含有抗酸化物質のメディシナルケミストリー2010

    • Author(s)
      堀均, 中田栄司, 他
    • Organizer
      第14回バイオ治療法研究会学術集会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] SNARFを基本骨格とした蛍光プローブの合理的設計戦略2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-25
  • [Presentation] がん細胞内pHを検出するための蛍光性pHインジケーターの開発2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] Design of boron tracedrug phenolic BODIPY-containing antioxidants as autopsy/virtopsy imaging agents2010

    • Author(s)
      Hitoshi Hori, Eiji Nakata and Yoshihiro Uto
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発2010

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      第10回エンジニアリングフェスティバル
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      2010-09-17
  • [Presentation] 蛍光プローブの合理的設計を目指したSNARF誘導体の自己集合化能についての検討2010

    • Author(s)
      那住善治郎, 中田栄司, 他
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学若手の会サマースクール
    • Place of Presentation
      愛知
    • Year and Date
      2010-07-16
  • [Presentation] 新しい蛍光制御機能に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発2010

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      第9回国際バイオEXPO
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-07-01
  • [Presentation] 新しい蛍光制御機構に基づく酵素応答性蛍光プローブの開発2010

    • Author(s)
      中田栄司
    • Organizer
      第1回徳島大学研究者との集い
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Presentation] 外部刺激応答型蛍光プローブの開発と低酸素細胞の選択的可視化への応用2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第16回国際癌治療増感研究会
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2010-06-19
  • [Presentation] 新規な細胞膜透過性SNARF誘導体による細胞内pHの効果的な計測2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第5回年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-05-19
  • [Presentation] 細胞内pHの計測に適した改良型SNARFの設計とその評価2010

    • Author(s)
      行待芳浩, 中田栄司, 他
    • Organizer
      日本薬学会第130年会
    • Place of Presentation
      岡山県桃太郎アリーナ
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] 細胞内pH計測に適した新規SNARF誘導体の設計とその機能評価2010

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      日本化学会第90春季年会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] Bioreductively-Activated Fluorescent pH Probe for Tumor Hypoxia Imaging2009

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      第7回がんとハイポキシア研究会
    • Place of Presentation
      京都大学吉田キャンパス本部構内百周年時計台記念館
    • Year and Date
      20091205-06
  • [Presentation] Design of a Bioreductively-Activated Fluorescent pH Probe for Tumor Hypoxia Imaging2009

    • Author(s)
      Eiji Nakata, et. al.
    • Organizer
      2^<nd> Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium 2009
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20090911-12
  • [Presentation] 合理的にデザインされた蛍光プローブの開発2009

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      分子化学研究会
    • Place of Presentation
      大阪府箕面市みのお山荘
    • Year and Date
      2009-10-17
  • [Presentation] 効果的な細胞内pHの計測を目指した改良型SNARFの設計とその評価2009

    • Author(s)
      行待芳浩, 中田栄司, 他
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学若手フォーラム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] がん低酸素環境を標的とした蛍光性pHプローブの開発2009

    • Author(s)
      中田栄司他
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム第12回バイオテクノロジーシンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      2009-09-15
  • [Presentation] 細胞内pHの計測を志向した改良型SNARFの設計とその評価2009

    • Author(s)
      行待芳浩, 中田栄司, 他
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム第12回バイオテクノロジーシンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      2009-09-15
  • [Presentation] 癌低酸素環境で選択的に機能する蛍光性pHプローブの開発2009

    • Author(s)
      中田栄司, 他
    • Organizer
      生体機能関連若手の会サマースクール2009
    • Place of Presentation
      関西セミナーハウス
    • Year and Date
      2009-07-13
  • [Book] レクチンチップ"バイオチップ実用化ハンドブック"2010

    • Author(s)
      浜地格, 中田栄司
    • Total Pages
      187-195
    • Publisher
      株式会社NTS
  • [Book] Recent progress in the construction methodology of fluorescent biosensors based on biomolecules

    • Author(s)
      Eiji Nakata, Fong Fong Liew, Shun Nakano and Takashi Morii
    • Publisher
      Environment and Biosecurity
  • [Remarks] 京都大学・エネルギー理工学研究所・生物機能科学研究分野・森井研究室

    • URL

      http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/material/a-12_j.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)]2011

    • Inventor(s)
      森井孝,中田栄司,松本桂彦
    • Industrial Property Rights Holder
      京都大学
    • Industrial Property Number
      特許、特願2011-244709
    • Filing Date
      2011-11-08
  • [Patent(Industrial Property Rights)] ナノ集合体2010

    • Inventor(s)
      中田栄司,掘均,宇都義浩・行待芳浩
    • Industrial Property Rights Holder
      徳島大学
    • Industrial Property Number
      特許、特願2010-129211
    • Filing Date
      2010-06-04
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 蛍光プローブ2010

    • Inventor(s)
      中田栄司,掘均,宇都義浩
    • Industrial Property Rights Holder
      徳島大学
    • Industrial Property Number
      特許、特願2010-27884
    • Filing Date
      2010-02-10

URL: 

Published: 2013-07-31  

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