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2011 Fiscal Year Final Research Report

Transcriptome analysis of Brassica rapa in response to soil-borne pathogen infection using information gained from Arabidopsis research.

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 21780038
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Plant pathology
Research Institution岡山県農林水産総合センター (2011)
Research Institute for Biological Science Okayama (2009-2010)

Principal Investigator

NARUSAKA Mari  岡山県農林水産総合センター, 生物科学研究所, 研究員 (80376847)

Project Period (FY) 2009 – 2011
Keywordsマイクロアレイ / 植物 / ストレス / 植物免疫 / 土壌病害 / シグナル伝達 / ハクサイ / 遺伝子発現解析
Research Abstract

To perform comparative sequence and transcriptome analyses between Brassica rapa and Arabidopsis thaliana, we prepared a B. rapa cDNA microarray using cDNA clones. The gene expression during infection with fungal pathogen Plasmodiophora brassicae and treatments with signaling molecules was analyzed using 10 K B. rapa and Arabidopsis cDNA microarrays. The expressed sequence tag(EST) and microarray data provide a valuable resource for functional genomics on the crops.

  • Research Products

    (34 results)

All 2012 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (21 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Development of full-length cDNAs from Chinese cabbage(Brassica rapa subsp. pekinensis) and identification of marker genes for defence response2011

    • Author(s)
      Abe H., Narusaka Y., Sasaki I., Hatakeyama K., Shin-I S., Narusaka M., Fukami-Kobayashi K., Matsumoto S., Kobayashi M
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 18 Pages: 277-289

    • DOI

      DOI:10.1093/dnares/dsr018

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] rpoD gene expression as an indicator of bacterial pathogens in host plants2011

    • Author(s)
      Narusaka M., Shiraishi T., Iwabuchi M., Narusaka Y
    • Journal Title

      Journal of General Plant Pathology

      Volume: 77 Pages: 75-80

    • DOI

      DOI:10.1007/s10327-011-0298-x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The floral inoculating protocol : a simplified Arabidopsis thaliana transformation method modified from floral dipping2010

    • Author(s)
      Narusaka M., Shiraishi T., Iwabuchi M., Narusaka Y
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 27 Pages: 349-351

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Monitoring fungal viability and development in plants infected with Colletotrichum higginsianum by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction2010

    • Author(s)
      Narusaka M., Shiraishi T., Iwabuchi M., Narusaka Y
    • Journal Title

      Journal of General Plant Pathology

      Volume: 76 Pages: 1-6

    • DOI

      DOI:10.1007/s10327-009-0211-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] プラントアクティベーターを利用したハクサイ炭疽病および黒斑病の防除の可能性2010

    • Author(s)
      鳴坂義弘、鳴坂真理
    • Journal Title

      植物防疫

      Volume: 3月号, vol.64 Pages: 156-161

  • [Journal Article] ABA hypersensitive germination2-1 causes the activation of both abscisic acid and salicylic acid responses in Arabidopsis2009

    • Author(s)
      Nishimura N., Okamoto M., Narusaka M., Yasuda M., Nakashita H., Shinozaki K., Narusaka Y., Hirayama T
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 50 Pages: 2112-2122

    • DOI

      DOI:10.1093/pcp/pcp146

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A dual resistance gene system prevents infection by three distinct pathogens2009

    • Author(s)
      Narusaka M., Kubo Y., Shiraishi T., Iwabuchi M., Narusaka Y
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 4(10) Pages: 954-955

    • URL

      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2801359/?tool=pubmed

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A locus conferring resistance to Colletotrichum higginsianum is shared by four geographically distinct Arabidopsis accessions2009

    • Author(s)
      Birker D., Heidrich K., Takahara H., Narusaka M., Deslandes L., Narusaka Y., Reymond M., Parker JE., O' Connell R
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 60 Pages: 602-613

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2009.03984.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RRS1 and RPS4 provide a dual Resistance-gene system against fungal and bacterial pathogens2009

    • Author(s)
      Narusaka M., Shirasu K., Noutoshi Y., Kubo Y., Shiraishi T., Iwabuchi M., Narusaka Y
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 60 Pages: 218-226

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2009.03949.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Jasmonate-dependent plant defense restricts thrips performance and preference2009

    • Author(s)
      Abe H., Shimoda T., Ohnishi J., Kugimiya S., Narusaka M., Seo S., Narusaka Y., Tsuda S., Kobayashi M
    • Journal Title

      BMC Plant Biology

      Volume: 9(97) Pages: 1-12

    • DOI

      DOI:10.1186/1471-2229-9-97

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナのキチン認識におけるLysM型受容体の役割2012

    • Author(s)
      新屋友規,元山記子,早船真広,神谷光太,谷本匠,鳴坂真理,鳴坂義弘,賀来華江,渋谷直人
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-18
  • [Presentation] Floral inoculation法によるシロイヌナズナ簡易形質転換法の開発2012

    • Author(s)
      山崎識知,鳴坂真理,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-18
  • [Presentation] デュアル抵抗性蛋白質システムによる病原体認識機構の解明:RPS4とRRS1遺伝子の作物への導入2012

    • Author(s)
      鳴坂真理,白須賢,久保康之,白石友紀,畠山勝徳,平井正良,河本晃一,江面浩,高野義孝,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-18
  • [Presentation] デュアル抵抗性蛋白質システムによる病原体認識機構の解明:RPS4とRRS1蛋白質の構造と機能の解明2012

    • Author(s)
      鳴坂義弘,鳴坂真理,白須賢,高野義孝,白石友紀,岩渕雅樹
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-18
  • [Presentation] The floral inoculating protocol : a simplified Arabidopsis thaliana transformation method modified from floral dipping2011

    • Author(s)
      Yamasaki, S., Narusaka, M., Shiraishi, T., Iwabuchi, M., Narusaka, Y
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20111213-16
  • [Presentation] A dual Resistance-gene system confers resistance against fungal and bacterial pathogens in transgenic Brassica rapa2011

    • Author(s)
      Narusaka, M., Shirasu, K., Kubo, Y., Shiraishi, T., Hatakeyama, K., Hirai, T., Kawamoto, K., Ezura, H., Mukaihara, T., Iwabuchi, M., Narusaka, Y
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20111213-16
  • [Presentation] RRS1 and RPS4 provide a dual Resistance-gene system against fungal and bacterial pathogens2011

    • Author(s)
      Narusaka, Y., Narusaka, M., Shirasu, K., Kubo, Y., Shiraishi, T., Iwabuchi, M
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20111213-16
  • [Presentation] デュアルR-遺伝子による病原体認識機構:RPS4とRRS1遺伝子の作物への導入2011

    • Author(s)
      鳴坂真理,白須賢,久保康之,白石友紀,畠山勝徳,平井正良, Seung Won Kang,河本晃一,江面浩,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20110320-22
  • [Presentation] シロイヌナズナ簡易形質転換法の開発2011

    • Author(s)
      鳴坂義弘,鳴坂真理,白石友紀,岩渕雅樹
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20110320-22
  • [Presentation] シロイヌナズナゲノム情報を用いたハクサイcDNAリソース整備とデータベース開発2011

    • Author(s)
      安部洋,佐々木一誠,畠山勝徳,鳴坂真理,田村卓郎,深海-小林薫,鳴坂義弘,小林正智
    • Organizer
      日本育種学会平成23年度秋季大会
    • Place of Presentation
      福井
    • Year and Date
      2011-09-23
  • [Presentation] デュアルR遺伝子システムの発見と分子育種への応用技術開発2011

    • Author(s)
      鳴坂真理,鳴坂義弘
    • Organizer
      シンポジウム「植物機能の包括的理解を目指して」
    • Place of Presentation
      倉敷
    • Year and Date
      2011-02-28
  • [Presentation] デュアルR-遺伝子システムによる病原菌認識機構の解明2010

    • Author(s)
      鳴坂真理,白須賢,久保康之,豊田和広,白石友紀,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      平成22年度日本植物病理学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20100418-20
  • [Presentation] 定量RT-PCR法による病原菌の簡易定量および生物活性評価法の開発2010

    • Author(s)
      鳴坂義弘,鳴坂真理,白石友紀,岩渕雅樹
    • Organizer
      平成22年度日本植物病理学会大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20100418-20
  • [Presentation] シロイヌナズナゲノム情報を用いたハクサイcDNAリソース整備とデータベース開発2010

    • Author(s)
      安部洋,佐々木一誠,畠山勝徳,鳴坂真理,深海-小林薫,鳴坂義弘,小林正智
    • Organizer
      第229回日本作物学会講演会
    • Year and Date
      20100330-31
  • [Presentation] 難防除微小害虫の食害に対するシロイヌナズナの防御応答2010

    • Author(s)
      安部洋,下田武志,立石剣,大西純,釘宮聡一,鳴坂真理,瀬尾茂美,鳴坂義弘,津田新哉,小林正智
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-21
  • [Presentation] Analysis of suppressor mutants of a PARN deficient mutant, ABA hypersensitive germination2-12010

    • Author(s)
      Hirayama T., Ushiyama S., Narusaka M., Nakashita H., Narusaka Y., Hayashi S
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-21
  • [Presentation] 新説デュアルR-遺伝子システムによる病原体認識機構:RPS4とRRS1による異なる3種の病原体の認識2010

    • Author(s)
      鳴坂真理,白須賢,久保康之,白石友紀,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-21
  • [Presentation] 新説デュアルR-遺伝子システムによる病原体認識機構:2つのR蛋白質による3種の病原体の攻撃の認識2010

    • Author(s)
      鳴坂義弘,鳴坂真理,白須賢,能年義輝,白石友紀,久保康之,岩渕雅樹
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-21
  • [Presentation] シロイヌナズナゲノム情報を用いたハクサイcDNAリソース整備とデータベース開発2010

    • Author(s)
      安部洋,佐々木一誠,畠山勝徳,鳴坂真理,田村卓郎,深海-小林薫,鳴坂義弘,小林正智
    • Organizer
      日本育種学会平成22年度秋季大会
    • Place of Presentation
      秋田
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] Development of Full-length cDNAs from Brassica rapa and expression analyses of Brassica immune responses2010

    • Author(s)
      Abe H., Sasaki I., Narusaka M., Hatakeyama K., Tamura T., Fukami-Kobayashi K., Narusaka Y., Kobayashi M
    • Organizer
      21st International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      Arabidopsis Research
    • Year and Date
      2010-06-08
  • [Presentation] 新説デュアルR-遺伝子システムによる病原体認識機構:RPS4とRRS1による異なる3種の病原体の認識2009

    • Author(s)
      鳴坂真理,白須賢,能年義輝,久保康之,白石友紀,岩渕雅樹,鳴坂義弘
    • Organizer
      第26回岡山植物病理セミナー
    • Place of Presentation
      倉敷
    • Year and Date
      2009-12-19
  • [Book] Methods to Transfer Foreign Genes to Plants, In Transgenic Plants-Advances and Limitations2012

    • Author(s)
      Narusaka Y., Narusaka M., Yamasaki S., Iwabuchi M
    • Total Pages
      478
    • Publisher
      InTech
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.kibi.ne.jp/.narusaka/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 複数の病害に対して抵抗性を示す植物及びその作出法2009

    • Inventor(s)
      鳴坂義弘、鳴坂真理、白須賢
    • Industrial Property Rights Holder
      岡山県、理化学研究所
    • Industrial Property Number
      特許、PCT/JP2009/063474
    • Filing Date
      2009-07-29
    • Overseas

URL: 

Published: 2013-07-31  

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