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2009 Fiscal Year Annual Research Report

トランス翻訳の分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 21880009
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)

Research InstitutionHirosaki University

Principal Investigator

栗田 大輔  Hirosaki University, 農学生命科学部, 研究員 (60552651)

KeywordstmRNA / SmpB / リボソーム / 翻訳 / トランス翻訳 / 分子擬態
Research Abstract

当初の計画通り、翻訳因子およびトランス・トランスレーション関連因子を用いた反応中間体の形成をin vitroで行った。翻訳の停滞したリボソームとして、従来のpoly-U-dependent poly-phe合成系に加えて、AcPhe-tRNAを用いた系の確立を行った。薄層クロマトグラフィによってPhe-tRNAのアセチル化を、限外濾過によってリボソームへの結合活性を測定した。前者は90%以上の効率でアセチル化されており、今後の複合体形成を行う上で十分な収量であると考えられる。リボソーム結合活性については、反応条件の最適化によって50%程度にまで効率をあげることに成功した。
以上の結果を踏まえた上で、トランス・トランスレーション反応の最初の中間体であるPre-translocation stateの複合体形成の条件検討を行った。複合体は、ペプチド転移反応活性を測定することで評価を行った。その結果、最大80%程度の複合体が形成していることを確認した。今後、この複合体に対して部位特異的ラジカルプロービングおよび化学修飾剤によるフットプリンティングを行う予定である。
平行して、複合体解析に必要な部位特異的クロスリンク法の確立を行った。現在までに基礎的な条件検討はほぼ終了し、リボソームとSmpB複合体の解析を行った。その結果、SmpBのある部位とリボソームタンパク質の複合体を確認し、質量分析によってタンパク質の同定に成功している。今後はさらに発展させ、上述のトランス・トランスレーション反応中間体に対しても同様の解析を行っていく予定である。

  • Research Products

    (6 results)

All 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Role of the C-terminal tail of SmpB in the early stage of trans-translation2010

    • Author(s)
      Kurita D, Muto A, Himeno H.
    • Journal Title

      RNA 16巻

      Pages: 980-990

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Trans-translation by tmRNA and SmpB2009

    • Author(s)
      Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series 53巻

      Pages: 305-306

  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      姫野俵太、栗田大輔、武藤〓
    • Journal Title

      2つのtRNA/mRNAハイブリッド-トランス・トランスレーション-(共立出版)

      Pages: 2201-2206

  • [Presentation] Role of the C-terminal tail of SmpB during trans-translation2010

    • Author(s)
      Kurita D, Une M, Muto A, Himeno H.
    • Organizer
      23rd tRNA workshop
    • Place of Presentation
      Aveiro(Portugal)
    • Year and Date
      2010-02-01
  • [Presentation] Trans-translation by tmRNA and SmpB.2009

    • Author(s)
      Une M, Kurita D, Muto A, Himeno H.
    • Organizer
      6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      Takayama Public Cultural Hall(Gifu)
    • Year and Date
      2009-09-29
  • [Presentation] 部位特異的ヒドロキシラジカルプロービングを用いたRsgAとリボソームの相互作用の解析2009

    • Author(s)
      菊地岳志、平田侑也、栗田大輔、長谷要一、木村天胤、武藤〓、姫野俵太
    • Organizer
      第11回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      新潟コンベンションセンター(新潟県)
    • Year and Date
      2009-07-28

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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