• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanism of bidirectional signalings between nuclear epigenome and mitochondria and their biological significance

Research Project

Project/Area Number 21H02686
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中尾 光善  熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsエピゲノム / ミトコンドリア / 遺伝子 / クロマチン / 代謝
Outline of Annual Research Achievements

核エピゲノムはミトコンドリア由来の代謝物(アセチルCoAやS-アデノシルメチオニンなど)を用いて化学修飾されており、他方、ミトコンドリアのタンパク質の殆どは核ゲノムにコードされている。このため、両者のコミュニケーションが細胞機能の恒常性維持に不可欠である。細胞核からミトコンドリアへの順行性経路、ミトコンドリアから細胞核への逆行性経路の2つのシグナリングがあるが、その分子機序には不明な点が多い。本研究では、エピゲノムとミトコンドリアの相互作用に着目し、両向性シグナリングの機構を明らかにすることを目的とした。具体的には、上記のエピゲノム・転写因子の解析から、順行性経路を明らかにする。また、ミトコンドリアストレスのシグナルが集約する核エピゲノムと標的遺伝子座を特定したので、逆行性経路の解明に挑む。生命現象における両向性シグナリングの生物学的な意義について理解を目指した。とくに、核内のZHX3転写因子のノックダウン阻害によって、線維芽細胞の細胞老化が生じて、核小体とミトコンドリアの形態が顕著に変化した。ZHX3の標的遺伝子として、細胞老化に関わるp16遺伝子が発現誘導された。プロテオーム解析によってRNAプロセシングに関わる共役因子を同定し、ZHX3-KOマウスの代謝表現型を報告した。また、リボソームタンパク質群がrDNAクラスターの構造と核小体の形成を促進することで、核エピゲノムを制御するという新たな役割を果たすことを報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

エピゲノムとミトコンドリアを機能的に連結する因子について、新知見を得ている。とくに、核内のZHX3転写因子、リボソームタンパク質、LSD1脱メチル化酵素がミトコンドリアの構造・機能を制御するという最先端の研究成果が出ているため。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、当初の計画以上に進展してきたため、今後も引き続き研究を推進する。

  • Research Products

    (23 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 11 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学
  • [Int'l Joint Research] 国立衛生学研究所NIH/Texas大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      国立衛生学研究所NIH/Texas大学
  • [Int'l Joint Research] Novartis Pharma AG(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      Novartis Pharma AG
  • [Int'l Joint Research] Khon Kaen大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Khon Kaen大学
  • [Int'l Joint Research] Paris大学(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Paris大学
  • [Journal Article] Biosynthesis of S-adenosyl-methionine enhances aging-related defects in Drosophila oogenesis2022

    • Author(s)
      Hayashi Yoshiki、Kashio Soshiro、Murotomi Kazutoshi、Hino Shinjiro、Kang Woojin、Miyado Kenji、Nakao Mitsuyoshi、Miura Masayuki、Kobayashi Satoru、Namihira Masakazu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 5593

    • DOI

      10.1038/s41598-022-09424-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Loss of the transcription repressor ZHX3 induces senescence-associated gene expression and mitochondrial-nucleolar activation2022

    • Author(s)
      Igata Tomoka、Tanaka Hiroshi、Etoh Kan、Hong Seonghyeon、Tani Naoki、Koga Tomoaki、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0262488

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0262488

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ribosomal protein L5 facilitates rDNA-bundled condensate and nucleolar assembly2022

    • Author(s)
      Matsumori Haruka、Watanabe Kenji、Tachiwana Hiroaki、Fujita Tomoko、Ito Yuma、Tokunaga Makio、Sakata-Sogawa Kumiko、Osakada Hiroko、Haraguchi Tokuko、Awazu Akinori、Ochiai Hiroshi、Sakata Yuka、Ochiai Koji、Toki Tsutomu、Ito Etsuro、Goldberg Ilya G、Tokunaga Kazuaki、Nakao Mitsuyoshi、Saitoh Noriko
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 5 Pages: e202101045

    • DOI

      10.26508/lsa.202101045

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Bivalent-histone-marked immediate-early gene regulation is vital for VEGF-responsive angiogenesis2022

    • Author(s)
      Kanki Yasuharu、Muramatsu Masashi、Miyamura Yuri、Kikuchi Kenta、Higashijima Yoshiki、Nakaki Ryo、Suehiro Jun-ichi、Sasaki Yuji、Kubota Yoshiaki、Koseki Haruhiko、Morioka Hiroshi、Kodama Tatsuhiko、Nakao Mitsuyoshi、Kurotaki Daisuke、Aburatani Hiroyuki、Minami Takashi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 38 Pages: 110332~110332

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110332

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Histone deacetylation regulates nucleotide excision repair through an interaction with the XPC protein2022

    • Author(s)
      Kusakabe Masayuki、Kakumu Erina、Kurihara Fumika、Tsuchida Kazuki、Maeda Takumi、Tada Haruto、Kusao Kanako、Kato Akari、Yasuda Takeshi、Matsuda Tomonari、Nakao Mitsuyoshi、Yokoi Masayuki、Sakai Wataru、Sugasawa Kaoru
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104040~104040

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104040

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] LSD1 defines erythroleukemia metabolism by controlling the lineage-specific transcription factors GATA1 and C/EBPα2021

    • Author(s)
      Kohrogi Kensaku、Hino Shinjiro、Sakamoto Akihisa、Anan Kotaro、Takase Ryuta、Araki Hirotaka、Hino Yuko、Araki Kazutaka、Sato Tetsuya、Nakamura Kimitoshi、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Blood Advances

      Volume: 5 Pages: 2305~2318

    • DOI

      10.1182/bloodadvances.2020003521

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] High glucose‐ROS conditions enhance the progression in cholangiocarcinoma via upregulation of MAN2A2 and CHD82021

    • Author(s)
      Thonsri Unchalee、Wongkham Sopit、Wongkham Chaisiri、Hino Shinjiro、Nakao Mitsuyoshi、Roytrakul Sittiruk、Koga Tomoaki、Seubwai Wunchana
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 112 Pages: 254~264

    • DOI

      10.1111/cas.14719

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Expression of leukotriene B4 receptor 1 defines functionally distinct DCs that control allergic skin inflammation2021

    • Author(s)
      Koga Tomoaki、Sasaki Fumiyuki、Saeki Kazuko、Tsuchiya Soken、Okuno Toshiaki、Ohba Mai、Ichiki Takako、Iwamoto Satoshi、Uzawa Hirotsugu、Kitajima Keiko、Meno Chikara、Nakamura Eri、Tada Norihiro、Fukui Yoshinori、Kikuta Junichi、Ishii Masaru、Sugimoto Yukihiko、Nakao Mitsuyoshi、Yokomizo Takehiko
    • Journal Title

      Cellular & Molecular Immunology

      Volume: 18 Pages: 1437~1449

    • DOI

      10.1038/s41423-020-00559-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Murine neonatal ketogenesis preserves mitochondrial energetics by preventing protein hyperacetylation2021

    • Author(s)
      Arima Yuichiro, Nakao Mitsuyoshi, Tsujita Kenichi, et al.
    • Journal Title

      Nature Metabolism

      Volume: 3 Pages: 196~210

    • DOI

      10.1038/s42255-021-00342-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lysine Demethylase 5A Is Required for MYC-Driven Transcription in Multiple Myeloma2021

    • Author(s)
      Ohguchi Hiroto, Nakao Mitsuyoshi, Qi Jun, et al.
    • Journal Title

      Blood Cancer Discovery

      Volume: 2 Pages: 370~387

    • DOI

      10.1158/2643-3230.BCD-20-0108

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sexual fate of murine external genitalia development: Conserved transcriptional competency for male-biased genes in both sexes2021

    • Author(s)
      Kajioka Daiki、Suzuki Kentaro、Matsushita Shoko、Hino Shinjiro、Sato Tetsuya、Takada Shuji、Isono Kyoichi、Takeo Toru、Kajimoto Mizuki、Nakagata Naomi、Nakao Mitsuyoshi、Suyama Mikita、DeFalco Tony、Miyagawa Shinichi、Yamada Gen
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Pages: e2024067118

    • DOI

      10.1073/pnas.2024067118

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] エピゲノム制御による表現型バリエーションの分子基盤2021

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第125回日本眼科学会総会
    • Invited
  • [Presentation] エピゲノム制御によるがんのエネルギー代謝型の分子基盤2021

    • Author(s)
      日野信次朗、興梠健作、坂元顕久、中尾光善
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Invited
  • [Presentation] エピゲノム制御によるがんの代謝型と細胞特性の分子基盤2021

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第80回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] 代謝メモリー(エピゲノム)からDOHaD説を科学する2021

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第25回鹿児島県小児内分泌研究会
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic basis of endocrine therapy-resistance and emerging therapeutic strategy in breast cancer2021

    • Author(s)
      M. Nakao
    • Organizer
      The 21th Annual Meeting of the East Asian Union of Human Genetics Societies
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 実験医学増刊(個人差の理解へ向かう肥満症研究)2021

    • Author(s)
      日野信次朗、荒木裕貴、中尾光善
    • Total Pages
      228
    • Publisher
      羊土社
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi