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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanism of bidirectional signalings between nuclear epigenome and mitochondria and their biological significance

Research Project

Project/Area Number 21H02686
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中尾 光善  熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsエピゲノム / ミトコンドリア / 遺伝子 / クロマチン / 代謝
Outline of Annual Research Achievements

核エピゲノムはミトコンドリア由来の代謝物(アセチルCoAやS-アデノシルメチオニンなど)を用いて化学修飾されており、他方、ミトコンドリアのタンパク質の殆どは核ゲノムにコードされている。このため、両者のコミュニケーションが細胞機能の恒常性維持に不可欠である。細胞核からミトコンドリアへの順行性経路、ミトコンドリアから細胞核への逆行性経路の2つのシグナリングがあるが、その分子機序には不明な点が多い。本研究では、エピゲノムとミトコンドリアの相互作用に着目し、両向性シグナリングの機構を明らかにすることを目的とした。具体的には、上記のエピゲノム・転写因子の解析から、順行性経路を明らかにする。また、ミトコンドリアストレスによる逆行性経路、標的遺伝子座とエピゲノム制御の解明に挑む。生命現象における両向性シグナリングの生物学的な意義について理解を目指した。とくに、LSD1リジン脱メチル化酵素の骨格筋特異的なKOマウスの解析から、LSD1はグルココルチコイドや持久運動などの環境刺激への応答を適正化することを報告した。ミトコンドリアストレスによる逆行性経路において、amphiregulin(AREG)やthrombospondin 1 (THBS1) などの分泌表現型が誘導されること、c-JUNおよびYAP1のシグナリングを介してAREG遺伝子やTHBS1遺伝子のエンハンサーが活性化されることを報告した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

エピゲノムとミトコンドリアを機能的に連結する因子について、新知見を得ている。とくに、LSD1脱メチル化酵素が骨格筋の環境適応に働くこと、ミトコンドリアストレスによる分泌表現型の分子機序という最先端の研究成果が出ているため。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、当初の計画以上に進展してきたため、最終年度に向けて研究を推進する。

  • Research Products

    (20 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学
  • [Int'l Joint Research] Cologne大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Cologne大学
  • [Int'l Joint Research] 国立衛生学研究所NIH/Texas大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      国立衛生学研究所NIH/Texas大学
  • [Int'l Joint Research] Khon Kaen大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Khon Kaen大学
  • [Int'l Joint Research] Paris大学(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Paris大学
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      2
  • [Journal Article] Lactic acidosis induces metabolic and phenotypic reprogramming in cholangiocarcinoma cells via the upregulation of thrombospondin‐12023

    • Author(s)
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Kuribayashi Kanji、Araki Hirotaka、Hino Yuko、Koga Tomoaki、Seubwai Wunchana、Wongkham Sopit、Nakao Mitsuyoshi、Hino Shinjiro
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Pages: 1541~1555

    • DOI

      10.1111/cas.15699

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] LSD1 defines the fiber type-selective responsiveness to environmental stress in skeletal muscle2023

    • Author(s)
      Araki Hirotaka、Hino Shinjiro、Anan Kotaro、Kuribayashi Kanji、Etoh Kan、Seko Daiki、Takase Ryuta、Kohrogi Kensaku、Hino Yuko、Ono Yusuke、Araki Eiichi、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 12 Pages: e84618

    • DOI

      10.7554/eLife.84618

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mitochondrial stress induces AREG expression and epigenomic remodeling through c-JUN and YAP-mediated enhancer activation2022

    • Author(s)
      Hino Yuko、Nagaoka Katsuya、Oki Shinya、Etoh Kan、Hino Shinjiro、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 50 Pages: 9765~9779

    • DOI

      10.1093/nar/gkac735

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lactic acidosis promotes aggressive features of cholangiocarcinoma cells via upregulating ALDH1A3 expression through EGFR axis2022

    • Author(s)
      Thamrongwaranggoon Ubonrat、Detarya Marutpong、Seubwai Wunchana、Saengboonmee Charupong、Hino Shinjiro、Koga Tomoaki、Nakao Mitsuyoshi、Wongkham Sopit
    • Journal Title

      Life Sciences

      Volume: 302 Pages: 120648~120648

    • DOI

      10.1016/j.lfs.2022.120648

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq) for Detecting Histone Modifications and Modifiers2022

    • Author(s)
      Hino Shinjiro、Sato Tetsuya、Nakao Mitsuyoshi
    • Journal Title

      Methods Mol. Biol. (In book: Epigenomics)

      Volume: 2577 Pages: 55~64

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2724-2_4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Biosynthesis of S-adenosyl-methionine enhances aging-related defects in Drosophila oogenesis2022

    • Author(s)
      Hayashi Yoshiki、Kashio Soshiro、Murotomi Kazutoshi、Hino Shinjiro、Kang Woojin、Miyado Kenji、Nakao Mitsuyoshi、Miura Masayuki、Kobayashi Satoru、Namihira Masakazu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 5593

    • DOI

      10.1038/s41598-022-09424-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 細胞老化とミトコンドリアストレスによる分泌表現型のエピジェネティック制御2022

    • Author(s)
      中尾光善、日野裕子、衛藤貫、田中宏、日野信次朗
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Invited
  • [Presentation] リジン脱メチル化酵素LSD1は骨格筋において環境ストレス応答性の適応限界を規定する2022

    • Author(s)
      荒木裕貴、日野信次朗、栗林寛至、阿南浩太郎、中尾光善
    • Organizer
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Invited
  • [Presentation] エピゲノム制御による表現型形成と病態の分子基盤2022

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第4回名古屋産学官・医連携研究会
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic regulation of cellular stress-induced secretory phenotypes2022

    • Author(s)
      M. Nakao
    • Organizer
      The 4th Anniversary Symposium for Double Degree Program between partner universities in Thailand and Kumamoto University, Japan
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 医学の歩み2023

    • Author(s)
      日野裕子、日野信次朗、中尾光善
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      医歯薬出版
  • [Book] 食と医療2023

    • Author(s)
      中尾光善
    • Total Pages
      89
    • Publisher
      講談社エディトリアル
  • [Book] 生体の科学(増大号)2023

    • Author(s)
      中尾光善
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      医学書院
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2023-12-25  

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