2023 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of glioma immune microenvironment heterogeneity based on immunogenomics by liquid biopsy
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21H03044
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
溝口 昌弘 九州大学, 医学研究院, 共同研究員 (50380621)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
藤岡 寛 九州大学, 大学病院, 助教 (10914252)
秦 暢宏 大分大学, 医学部, 准教授 (10596034)
空閑 太亮 九州大学, 大学病院, 助教 (40759932)
三月田 祐平 九州大学, 大学病院, 助教 (00848640)
加藤 隆弘 九州大学, 医学研究院, 准教授 (70546465)
扇谷 昌宏 旭川医科大学, 医学部, 講師 (60636455)
中溝 玲 九州大学, 医学研究院, 准教授 (80529800)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | グリオーマ / リキッドバイオプシー / エクソソーム / 免疫微小環境 / 直接誘導ミクログリア様細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
新型digital PCRシステム導入：digital PCRの更なる精度向上を目的にQuantStudio Absolute QデジタルPCRシステムを導入しglioma患者における血中/髄液中cfDNAの解析を行った。九州大学脳神経外科で保存していたサンプルを用いて検討を進めた。従来型のdigital PCRでは変異を検出することができなかったEGFRvIII、HIST1 H3B、H3Cの検出を目的にprimer/probe設計をおこなった。
微量cfDNA収量に関する検討：従来のcfDNA抽出法ではエクソソーム内のcfDNA収量は不十分であり、その解析が困難であった。採取、抽出、解析の過程を再検討した。採取に関してcfDNA の収量向上を目的にSTRECK Cell-Free BCT （採血管）を導入した。
digital PCRの再検証：採取、抽出、解析の過程を再検討することにより、これまで同定することができていなかったpilocytic astrocytoma(WHO grade1)症例において初めて髄液cfDNAからBRAF V600E変異の検出を行うことができた。一方で、血中cfDNAに関しては、同様の改良を進めIDH変異などの解析を試みているが、腫瘍と同一の変異検出には至っていない。血液より腫瘍の微小環境を推測する方法としてiMGが有用であり、現時点では血中cfDNAを対象にしたliquid biopsyでは腫瘍内の異常を同定することが困難であった。 digital PCRに関するこれまでの報告をまとめ、これまでの我々の取り組みを総括し報告した。<Liquid Biopsy for Glioma Using Cell-Free DNA in Cerebrospinal Fluid: Otsuji, et al Cancers 2024, 16(5), 1009; https://doi.org/10.3390/cancers16051009>
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| Research Progress Status |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Angiogenic and inflammatory responses in human induced microglia-like (iMG) cells from patients with Moyamoya disease2023
Author(s)
Shirozu N,Ohgidani M,Hata N,Tanaka S,Inamine S,Sagata N,Kimura T,Inoue I,Arimura K,Nakamizo A,Nishimura A,Maehara N,Takagishi S,Iwaki K,Nakao T,Masuda K,Sakai Y, Mizoguchi M,Yoshimoto K,Kato TA.
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Journal Title
Scientific Reports
Volume: 13
Pages: 14842
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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