• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

Whlole genome analysis in exosome from dilated cardiomyopathy occurred by aging

Research Project

Project/Area Number 21H03358
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

水上 洋一  山口大学, 大学研究推進機構, 教授 (80274158)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 諌山 慧士朗  山口大学, 大学研究推進機構, 助教 (30780887)
森本 幸生  国際医療福祉大学, 福岡保健医療学部, 教授 (50202362)
渡邉 健司  山口大学, 大学研究推進機構, 助教 (50711264)
大塚 正人  東海大学, 医学部, 教授 (90372945)
小林 茂樹  山口大学, 医学部, 教授(連携講座) (90397993)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords拡張型心筋症 / ゲノム解析 / ゲノム編集マウス / エクソソーム
Outline of Annual Research Achievements

これまでに心筋症や不整脈など心臓疾患を発症することが報告されている57遺伝子の2987領域に対する独自のカスタムパネルを作製した。このマルチプレックスPCRで既知心筋症変異の57 遺伝子全領域(2987産物)98.3% をカバーする。精製したゲノム DNA50ngおよびカスタムパネル(プライマーmix)を用いてIon Ampliseq Library Preparation キットでPCR増幅およびライブラリー作製を行った。Ion S5 Sequencing 200 Kit v2及び318 チップを用いて解析を行う。リファレンスはヒトゲノム(hg19)を用いてマッピングを行った。さらにこのデータを確認するため、PCRベースでの全エクソン配列を増幅させ、次世代シーケンサーNext-seq500(現有)で全エクソン解析を行った。 次世代シーケンスデータはPartek Flow、Variant Caller、Genomics Work Bench(全て現有)を用いて解析した結果、12名の孤発性拡張型心筋症のサンプルから3種類の遺伝子で未知の遺伝子変異が検出された。研究分担者によって開発されたGONAD法を用いて、ノックインマウスを作製した。実験は発情期にあるマウスを交配させ、翌日にプラグを確認した後、プラグ確認日にチオペンタール麻酔下、背中側から卵巣を引き出し、卵管にキャピラリーを通してハイブリダイズしたtracrRNA/crRNAとCAS9タンパク質を注入する。注入直後にin vivoでの電気穿孔法(現有)で卵管内に存在している受精卵に直接ゲノム編集を行った。その結果、1種類の遺伝子で患者さんと同じ遺伝子変異を有する拡張型心筋症の再現に成功した。現在、血清におけるエクソソームを分離し、全miRNAの解析を行うと同時に薬剤を投与し拡張型心筋症の治療を検討している。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (19 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Detection and identification of factors in the atrium responsible for blood pressure regulation in patients with hypertension2024

    • Author(s)
      Yoshimura Kenshi、Mengyan Wei、Kume Shinichiro、Kurokawa Tatsuki、Miyamoto Shinji、Mizukami Yoichi、Ono Katsushige
    • Journal Title

      Heart and Vessels

      Volume: 39 Pages: 464~474

    • DOI

      10.1007/s00380-024-02362-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Jo-1 Antibodies From Myositis Induce Complement-Dependent Cytotoxicity and TREM-1 Upregulation in Muscle Endothelial Cells2023

    • Author(s)
      Honda Masaya、Shimizu Fumitaka、Sato Ryota、Mizukami Yoichi、Watanabe Kenji、Takeshita Yukio、Maeda Toshihiko、Koga Michiaki、Kanda Takashi
    • Journal Title

      Neurology Neuroimmunology & Neuroinflammation

      Volume: 10 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1212/NXI.0000000000200116

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] G-protein-coupled estrogen receptor prevents nuclear factor-kappa B promoter activation by Helicobacter pylori cytotoxin-associated gene A in gastric cancer cells2023

    • Author(s)
      OKAMOTO Mariko、MIURA Atsushi、ITO Ryota、KAMADA Toshiki、MIZUKAMI Yoichi、KAWAMOTO Keiko
    • Journal Title

      Journal of Veterinary Medical Science

      Volume: 85 Pages: 1348~1354

    • DOI

      10.1292/jvms.23-0054

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Xylobiose treatment strengthens intestinal barrier function by regulating claudin 2 and heat shock protein 27 expression in human Caco‐2 cells2023

    • Author(s)
      Rini Dina Mustika、Nakamichi Yusuke、Morita Tomotake、Inoue Hiroyuki、Mizukami Yoichi、Yamamoto Yoshinari、Suzuki Takuya
    • Journal Title

      Journal of the Science of Food and Agriculture

      Volume: 104 Pages: 2518~2525

    • DOI

      10.1002/jsfa.13111

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of candidate genes for the chemical components responsible for dark green coloration in bunching onion using QTL analysis2023

    • Author(s)
      Nakajima, T., R. Nakata, Y. Shimomi, K. Fuji, K. Watanabe, Y. Mizukami, M. Bamba, S. Sato and M. Shigyo
    • Organizer
      第4回アジア園芸化学会
  • [Presentation] イヌ腫瘍における低酸素環境により誘導される代謝関連遺伝子の同定2023

    • Author(s)
      加藤大樹、櫻井優、渡邊健司、水上洋一、中川貴之、水野拓也、伊賀瀬雅也
    • Organizer
      第82回日本癌学会
  • [Presentation] Bardoxolone methylは炎症性細胞の浸潤を阻害することで非アルコール性脂肪性肝炎を改善2023

    • Author(s)
      大沼和弘、渡邊健司、諌山慧士朗、中川真喜子、小木彩矢佳、水上洋一
    • Organizer
      第64回日本生化学会中四国支部例会
  • [Presentation] 乳癌患者から検出したミトコンドリアDNAの体細胞変異はエネルギー代謝経路を変化させる2023

    • Author(s)
      渡邉 健司、山本 滋、前田 訓子、西村 愛代、諌山 慧士朗、八木 美佳子、康 東天、岡 正朗、永野浩昭、水上 洋一
    • Organizer
      第64回日本生化学会中四国支部例会
  • [Presentation] ALK陽性未分化大細胞リンパ腫における 微小播種性病変に関わる原因遺伝子の解明2023

    • Author(s)
      深野玲司 飯島友加 川口浩史 中山秀樹 小林良二 岩淵英人 関水匡大 水上洋一 森鉄也 堀部敬三
    • Organizer
      第65回日本小児血液・がん学会学術集会
  • [Presentation] 次世代シーケンス解析の医学生物学への展開 -NGSコアファシリティ施設とその研究-2023

    • Author(s)
      水上洋一 中村昇太
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
  • [Presentation] 難治性疾患の原因遺伝子解析のための中国地方バイオネットワークの利用2023

    • Author(s)
      水上洋一、渡邊健司、諫山慧士郎
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会
  • [Presentation] 分裂酵母におけるアンキャップドテロメアの制御に関わる因子の解析2023

    • Author(s)
      侯 陳、水上 洋一、上野 勝、
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 染色体工学を適用した脆弱X症候群に関連した家系からのX染色体のクローニング2023

    • Author(s)
      中山祐二、石川瑞樹、太田伊政、水上洋一、久郷裕之
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 難治性疾患ゲノム検査のための新技術のご紹介2023

    • Author(s)
      水上 洋一
    • Organizer
      第35回化学工学研究会
    • Invited
  • [Presentation] 5-アミノレブリン酸が猫のリンパ球に及ぼす影響の検討2023

    • Author(s)
      千々和 愛花, 西堀 翔真, 諌山 慧士朗, 水上 洋一, 酒井 和紀, 岩谷 直, 水野 拓也, 伊賀瀬 雅也
    • Organizer
      第20回日本獣医学内科アカデミー
  • [Presentation] 効率的な骨再生を可能とする成熟骨芽細胞表面マーカーの検索2023

    • Author(s)
      奈良井 節, 中山祐二, 水上洋一, 小谷勇
    • Organizer
      第23回再生医療学会
  • [Presentation] 遺伝および環境要因による腸内細菌叢の変化と自閉症への関与2023

    • Author(s)
      飯野 幸恵、中川 直、水上 洋一、細井 徹
    • Organizer
      日本薬学会第144年会
  • [Presentation] Trehalose prevents IL-4/IL-13-induced skin barrier impairment by suppressing IL-33 expression and increasing Nrf2 activation in keratinocytes.2023

    • Author(s)
      Xiuju Dai, Yoichi Mizukami, Kenji Watanabe, Teruko Tsuda, Ken Shiraishi, Hideki Mori, Ryosuke Kawakami, Takeshi Imamura, Yasuhiro Fujisawa and Jun Muto
    • Organizer
      53rd Annual Europian Society for Dermatological Research Meeting
  • [Remarks] 山口大学遺伝子実験施設

    • URL

      http://gene.yamaguchi-u.ac.jp

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi