2023 Fiscal Year Final Research Report

"Shin" Paleogenomics Creates New Perspectives on the Utilization of Museum Materials

Research Project

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Project/Area Number	21H04358
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Section	一般
Review Section	Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
Research Institution	Kanazawa University
Principal Investigator	Gakuhari Takashi 金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 助教 (70749530)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	松前ひろみ東海大学, 医学部, 助教 (00735681) 金原正明奈良教育大学, ESD・SDGsセンター, 研究部員 (10335466) 本橋慶一東京農業大学, 国際食料情報学部, 教授 (10527542) 岡崎健治鳥取大学, 医学部, 助教 (10632937) 中込滋樹金沢大学, 古代文明・文化資源学研究所, 客員准教授 (40625208) 石谷孔司国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (40826062) 細川正人早稲田大学, 理工学術院, 准教授(任期付) (60722981) 和久大介東京農業大学, 国際食料情報学部, 助教 (60793578)
Project Period (FY)	2021-04-05 – 2024-03-31
Keywords	パレオゲノミクス / 微量サンプリング / 古人骨 / 絶滅哺乳類 / 植物病理標本 / 寄生虫卵
Outline of Final Research Achievements	This study was conducted with the aim of applying the analytical methods of paleogenomics (ancient genome analysis) that have been accumulated so far to various biological materials in the museum collection. In particular, as a new development of genome analysis for various specimens with a high degree of degradation, we attempted to apply paleogenomics by micro-sampling to acquire genome data from "difficult-to-analyze genome materials" that have been difficult to analyze, and to conduct comparative genome analysis using the acquired genome data. Paleogenomics was conducted on paleohuman bones, extinct mammals in museums, fungal specimens, plant pathology specimens, and parasite eggs, demonstrating that paleogenomics can be applied to materials that have been difficult to analyze in the past.
Free Research Field	パレオゲノミクス
Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements	これまでのパレオゲノミクス研究は、DNA分子の保存環境が良好な資料を対象にした研究が中心的であったが、既存のパレオゲノミクスの手法では分析が困難な「難ゲノム解析資料群」が膨大な数存在している。これらの資料からゲノムデータを取得することが可能になれば、今まではDNAが保存されやすい地域や時代だけの点々としたデータを比較解析していた研究の制約状況を改善することができ、これまで以上に膨大な資料群のゲノムデータを用いた新しいパレオゲノミクスの研究が可能になると期待される。新たな分析手法を応用することで、生物学だけでなく、農学や法医学などの他分野の研究領域に対しても、有益な情報を提示できる考えられる。