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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Comprehensive search for autophagy-selective substrates and elucidation of their degradation mechanisms

Research Project

Project/Area Number 21H04771
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

小松 雅明  順天堂大学, 大学院医学研究科, 教授 (90356254)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三浦 芳樹  順天堂大学, 大学院医学研究科, 准教授 (90279240)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2024-03-31
Keywordsオートファジー / 選択的オートファジー / ユビキチン / p62 / 液―液相分離 / KEAP1
Outline of Annual Research Achievements

1. 選択的オートファジー基質の網羅的探索-1
オートファジーの対象となるミスフォールドや変性したタンパク質は、ユビキチン化されp62と結合、液―液相分離(LLPS)によって液滴となる。この液滴は、さらに分解性のタンパク質ゲルへと相転移し、オートファジーにより分解される。しかし、p62液滴・ゲルに含まれるユビキチン化タンパク質はほとんど不明である。今回、p62液滴・ゲルの精製方法を確立、トリプシン消化した精製p62液滴・ゲルをユビキチン化リジンのみを免疫沈降するPTMScan法により精製、質量分析によりp62液滴・ゲルに含まれるユビキチン化タンパク質を同定した。
2. 選択的オートファジー基質の網羅的探索-2
国外共同研究者であるJin-A Lee博士(韓南大学)は、オートファゴソームに局在し選択的オートファジーに寄与するAtg8ファミリータンパク質に結合する人工プローブHyD-LIR(TP)を開発した(EMBO J, 2017)。このプローブを過剰発現させることで、オートファゴソーム形成には影響を与えず、選択的マクロオートファジーを各臓器で阻害できるマウスを開発した(Nat Comm 2021)。このマウスを利用し、肝臓特異的選択的オートファジー不全マウス肝臓、及びコントロールマウス肝臓のtandem mass tagによる相対定量プロテオミクス分析を行い、選択的オートファジー不全マウス肝臓組織に蓄積しているタンパク質群を同定した。
3. p62液滴・ゲルの生理的意義
p62の液―液相分離に必須な7番目のリジン残基をアラニンに置換した液滴形成不全p62ノックインマウス(p62K7A/K7Aマウス)を作製した。また、p62とKeap1との結合を強める、あるいは弱める、351番目のセリン残基をグルタミン酸に置換、あるいはアラニンに置換したp62ノックインマウス(p62S351E/S351E, p62 S351A/1S351Aマウス)を作製した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

革新的なp62液滴・ゲル精製方法と世界初の選択的オートファジー特異的阻害マウスにユビキチン化タンパク質の同定方法を組み合わせることで新規オートファジー基質群の同定を行った。今後、新規基質の詳細な解析により新しい選択的オートファジーの生理機能の知見が得られることが期待される。

Strategy for Future Research Activity

(1)新規選択的オートファジー基質群の解析-1
同定したp62液滴・ゲルに含まれるユビキチン化タンパク質群の解析を進める。具体的には、ユビキチン化されるのか否か、p62液滴・ゲルに局在するのか否か、オートファジーにより分解されるのか否かを検証する。
(2)新規選択的オートファジー基質群の解析-2
同定した選択的オートファジー不全マウスに蓄積するタンパク質群の解析を進める。具体的には、選択的オートファジー不全マウスでは転写因子Nrf2が活性化されることが判明していることから、肝臓特異的Keap1欠損マウス肝臓(恒常的Nrf2活性化マウス)に蓄積するタンパク質群との差分解析を行う。絞り込んだ基質候補タンパク質に関しては、オートファジーにより分解されるのか否かを検証する。
(3)p62液滴・ゲルの生理的意義
作製したp62K7A/K7A、p62S351E/S351E、p62 S351A/S351Aマウスの表現型解析を行う。

  • Research Products

    (19 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 5 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Massachusetts General Hospital(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Massachusetts General Hospital
  • [Int'l Joint Research] University of Turku(フィンランド)

    • Country Name
      FINLAND
    • Counterpart Institution
      University of Turku
  • [Journal Article] Deficient Autophagy in Microglia Aggravates Repeated Social Defeat Stress-Induced Social Avoidance2022

    • Author(s)
      Sakai Mai、Yu Zhiqian、Hirayama Ryo、Nakasato Masa、Kikuchi Yoshie、Ono Chiaki、Komatsu Hiroshi、Nakanishi Miharu、Yoshii Hatsumi、Stellwagen David、Furuyashiki Tomoyuki、Komatsu Masaaki、Tomita Hiroaki
    • Journal Title

      Neural Plasticity

      Volume: 2022 Pages: 1~13

    • DOI

      10.1155/2022/7503553

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Loss of Atg2b and Gskip Impairs the Maintenance of the Hematopoietic Stem Cell Pool Size2022

    • Author(s)
      Sakai Shun-suke、Hasegawa Atsushi、Ishimura Ryosuke、Tamura Naoki、Kageyama Shun、Komatsu-Hirota Satoko、Abe Manabu、Ling Yiwei、Okuda Shujiro、Funayama Manabu、Kikkawa Mika、Miura Yoshiki、Sakimura Kenji、Narita Ichiei、Waguri Satoshi、Shimizu Ritsuko、Komatsu Masaaki
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 42 Pages: e00024-21

    • DOI

      10.1128/MCB.00024-21

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] USP10 inhibits the dopamine-induced reactive oxygen species?dependent apoptosis of neuronal cells by stimulating the antioxidant Nrf2 activity2022

    • Author(s)
      Sango Junya、Kakihana Taichi、Takahashi Masahiko、Katsuragi Yoshinori、Anisimov Sergei、Komatsu Masaaki、Fujii Masahiro
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 101448~101448

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101448

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] USP10 Inhibits Aberrant Cytoplasmic Aggregation of TDP-43 by Promoting Stress Granule Clearance2022

    • Author(s)
      Takahashi Masahiko、Kitaura Hiroki、Kakita Akiyoshi、Kakihana Taichi、Katsuragi Yoshinori、Onodera Osamu、Iwakura Yuriko、Nawa Hiroyuki、Komatsu Masaaki、Fujii Masahiro
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 42 Pages: e00393-21

    • DOI

      10.1128/MCB.00393-21

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A description of novel variants and review of phenotypic spectrum in UBA5-related early epileptic encephalopathy2021

    • Author(s)
      Briere Lauren C.、...Komatsu Masaaki、Sweetser David A.、Undiagnosed Diseases Network
    • Journal Title

      Molecular Case Studies

      Volume: 7 Pages: a005827~a005827

    • DOI

      10.1101/mcs.a005827

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] p62/SQSTM1 droplets initiate autophagosome biogenesis and oxidative stress control2021

    • Author(s)
      Eskelinen Eeva-Liisa、Kageyama Shun、Komatsu Masaaki
    • Journal Title

      Molecular & Cellular Oncology

      Volume: 8 Pages: 1890990~1890990

    • DOI

      10.1080/23723556.2021.1890990

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Membrane perturbation by lipidated Atg8 underlies autophagosome biogenesis2021

    • Author(s)
      Maruyama Tatsuro、Alam Jahangir Md.、Fukuda Tomoyuki、Kageyama Shun、Kirisako Hiromi、Ishii Yuki、Shimada Ichio、Ohsumi Yoshinori、Komatsu Masaaki、Kanki Tomotake、Nakatogawa Hitoshi、Noda Nobuo N.
    • Journal Title

      Nature Structural & Molecular Biology

      Volume: 28 Pages: 583~593

    • DOI

      10.1038/s41594-021-00614-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Selective autophagy2021

    • Author(s)
      Faruk Mohammad Omar、Ichimura Yoshinobu、Komatsu Masaaki
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 112 Pages: 3972~3978

    • DOI

      10.1111/cas.15112

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mitochondrial reactive oxygen species trigger metformin-dependent antitumor immunity via activation of Nrf2/mTORC1/p62 axis in tumor-infiltrating CD8T lymphocytes2021

    • Author(s)
      Nishida Mikako、Yamashita Nahoko、Ogawa Taisaku、Koseki Keita、Warabi Eiji、Ohue Tomoyuki、Komatsu Masaaki、Matsushita Hirokazu、Kakimi Kazuhiro、Kawakami Eiryo、Shiroguchi Katsuyuki、Udono Heiichiro
    • Journal Title

      Journal for ImmunoTherapy of Cancer

      Volume: 9 Pages: e002954~e002954

    • DOI

      10.1136/jitc-2021-002954

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phase-separated protein droplets of amyotrophic lateral sclerosis-associated p62/SQSTM1 mutants show reduced inner fluidity2021

    • Author(s)
      Faruk Mohammad Omar、Ichimura Yoshinobu、Kageyama Shun、Komatsu-Hirota Satoko、El-Gowily Afnan H.、Sou Yu-shin、Koike Masato、Noda Nobuo N.、Komatsu Masaaki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 297 Pages: 101405~101405

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.101405

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 「選択的オートファジー:狙われる理由の解明が進む」2021

    • Author(s)
      小松雅明
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 39 Pages: 2030~2038

  • [Presentation] Vault-phagy: selective autophagy of large cytoplasmic ribonucleoprotein particles, Vault2022

    • Author(s)
      Masaaki Komatsu
    • Organizer
      JSPS 日中韓フォーサイト事業A3 conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 選択的オートファジー:狙われるには理由がある2022

    • Author(s)
      小松雅明
    • Organizer
      愛知県がんセンター研究所招聘セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 新局面を迎えるオートファジー研究2021

    • Author(s)
      小松雅明
    • Organizer
      第17回日本病理学会カンファレンス特別講演
    • Invited
  • [Presentation] p62液滴介在性オートファジーによる超分子複合体の分解機構2021

    • Author(s)
      小松雅明
    • Organizer
      第94回日本生化学会シンポジウム
    • Invited
  • [Remarks] 順天堂大学大学院医学研究科 器官・細胞生理学(生理学2)

    • URL

      https://www.juntendo.ac.jp/graduate/laboratory/labo/kikan_saibou/

  • [Remarks] 文部科学省科学研究費助成事業 新学術領域研究 マルチモードオートファジー

    • URL

      https://proteolysis.jp/multimode_autophagy/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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