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2021 Fiscal Year Annual Research Report

熱帯の多様性創出における急速な性染色体置換の役割

Research Project

Project/Area Number 21H04782
Research InstitutionUniversity of the Ryukyus

Principal Investigator

山平 寿智  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (20322589)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 北野 潤  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (80346105)
安齋 賢  東北大学, 生命科学研究科, 助教 (20779467)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2024-03-31
Keywords種分化 / 多様性 / 性淘汰 / 性染色体 / メダカ
Outline of Annual Research Achievements

種多様性の緯度勾配を説明する仮説として,熱帯は種分化速度が速いとする”種分化仮説”が近年注目を集めている.熱帯では,強い性淘汰圧がオスの二次性徴形質の多様化を促進する推進力になっているという実証研究が蓄積しつつある.しかし,二次性徴形質を異なる方向に進化させる遺伝機構は不明である.二次性徴形質に関わる遺伝子が性染色体と連鎖することで性特異的発現が達成されているなら,性染色体の置換は二次性徴形質の質的な変化をもたらすと考えられる.本研究は,メダカ科魚類をモデル系に,性染色体の置換と分化が,熱帯における二次性徴形質の多様化に果たす役割を検証することを目的とする.

本年度はまず,メダカ科魚類全種の性染色体の同定を目標に,スラウェシ産で性染色体が未同定である種を対象に,ゲノムワイド性連鎖解析を行った.野生個体および室内飼育系統から得られた雌雄をPool-seqにかけたところ,9種について新たに性染色体が同定された.その多くは,日本のメダカの連鎖群24番が性染色体に相当していたが,中央スラウェシの古代湖群に分布する種のいくつかは,異なる連鎖群(LG4,LG16など)が性染色体として機能してることがわかり,島内での多様化の過程で性染色体が置換していることが確認された.また,スラウェシ島のマリリ種群4種6集団を対象に,WGSによる性染色体の同定を行ったところ,種群内で性染色体の置換が確認された一方で,メジャーな性決定遺伝子座の特定に至らなかった集団も存在した.さらに,二次性徴形質の原因遺伝子が性染色体に集積しているかの検証するため,マリリ種群で同じ湖(Towuti湖)に同所的に生息している2種のメダカ(プロファンディコラとロキソレピス)を対象にGWASを行うべく,湖内でランダムに採集した多数のオス個体(約200個体)それぞれについて二次性徴形質(鰭の長さ,体色,体型など)の測定も行った.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

コロナ禍で採集調査が延期になったが,過去に採集したサンプルを使って解析を進めることができた.

Strategy for Future Research Activity

新たに採集調査を計画しており,計画に大きな変更が強いられることはないと思われる.

  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (7 results) Presentation (4 results)

  • [Int'l Joint Research] サムラトゥランギ大学/ハルオレオ大学(インドネシア)

    • Country Name
      INDONESIA
    • Counterpart Institution
      サムラトゥランギ大学/ハルオレオ大学
  • [Int'l Joint Research] ケララ水産海洋大学(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      ケララ水産海洋大学
  • [Int'l Joint Research] ハノイ教育大学(ベトナム)

    • Country Name
      VIET NAM
    • Counterpart Institution
      ハノイ教育大学
  • [Journal Article] Discovery of a genetically distinct lineage in medaka species within Lake Towuti in central Sulawesi2022

    • Author(s)
      Yamahira Kazunori、Mokodongan Daniel F.、Konishi Maki、Mandagi Ixchel F.、Masengi Kawilarang W. A.、Lawelle Sjamsu A.、Kusumi Junko、Inomata Nobuyuki
    • Journal Title

      Ichthyological Research

      Volume: 70 Pages: 185~189

    • DOI

      10.1007/s10228-021-00856-9

  • [Journal Article] Earth and life evolve together from something ancestral - reply to Britz et al.2022

    • Author(s)
      Yamahira Kazunori、Fujimoto Shingo、Takami Yasuoki
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 18 Pages: 20220010

    • DOI

      10.1098/rsbl.2022.0010

  • [Journal Article] Mitochondrial introgression by ancient admixture between two distant lacustrine fishes in Sulawesi Island2021

    • Author(s)
      Horoiwa Mizuki、Mandagi Ixchel F.、Sutra Nobu、Montenegro Javier、Tantu Fadly Y.、Masengi Kawilarang W. A.、Nagano Atsushi J.、Kusumi Junko、Yasuda Nina、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16 Pages: e0245316

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0245316

  • [Journal Article] Resource partitioning is not coupled with assortative mating in sympatrically divergent ricefish in a Wallacean ancient lake2021

    • Author(s)
      Kakioka Ryo、Sutra Nobu、Kobayashi Hirozumi、Ansai Satoshi、Masengi Kawilarang W. A.、Nagano Atsushi J.、Okuda Noboru、Tanaka Rieko、Sato Masahiro、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      Journal of Evolutionary Biology

      Volume: 34 Pages: 1133~1143

    • DOI

      10.1111/jeb.13874

  • [Journal Article] Mesozoic origin and ‘out-of-India’ radiation of ricefishes (Adrianichthyidae)2021

    • Author(s)
      Yamahira Kazunori、Ansai Satoshi、Kakioka Ryo、et al.
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 17 Pages: 20210212

    • DOI

      10.1098/rsbl.2021.0212

  • [Journal Article] Species divergence and repeated ancient hybridization in a Sulawesian lake system2021

    • Author(s)
      Mandagi Ixchel F.、Kakioka Ryo、Montenegro Javier、Kobayashi Hirozumi、Masengi Kawilarang W. A.、Inomata Nobuyuki、Nagano Atsushi J.、Toyoda Atsushi、Ansai Satoshi、Matsunami Masatoshi、Kimura Ryosuke、Kitano Jun、Kusumi Junko、Yamahira Kazunori
    • Journal Title

      Journal of Evolutionary Biology

      Volume: 34 Pages: 1767~1780

    • DOI

      10.1111/jeb.13932

  • [Journal Article] Diversity of lateral line patterns and neuromast numbers in the genus <i>Oryzias</i>2021

    • Author(s)
      Seleit Ali、Ansai Satoshi、Yamahira Kazunori、Masengi Kawilarang W. A.、Naruse Kiyoshi、Centanin L?zaro
    • Journal Title

      Journal of Experimental Biology

      Volume: 224 Pages: jeb242490

    • DOI

      10.1242/jeb.242490

  • [Presentation] スラウェシ島の古代湖におけるメダカ属魚類の集団遺伝構造2022

    • Author(s)
      袰岩美月・山平寿智
    • Organizer
      第69回日本生態学会大会
  • [Presentation] Deeply divergent freshwater fish species within a single river system in central Sulawesi2022

    • Author(s)
      Utama IV, Yamahira K
    • Organizer
      第69回日本生態学会大会
  • [Presentation] 琉球列島におけるホシマダラハゼ属魚類の系統および分類学的再検討2021

    • Author(s)
      小林大純・山川宇宙・佐藤真央・前田 健・山平寿智
    • Organizer
      沖縄生物学会第58回大会
  • [Presentation] インドネシア・ポソ湖で同所的に種分化したメダカ属魚類間でのゲノム分化2021

    • Author(s)
      柿岡諒・Masengi KWA・木村亮介・山平寿智
    • Organizer
      第55回日本魚類学会年会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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