Tailer made-dual directed immunotherapy for pancreatic cancer

2021 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21H04833
• Research Institution: Wakayama Medical University
• Principal Investigator: 山上 裕機 和歌山県立医科大学, 医学部, 教授 (20191190)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 尾島 敏康 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (60448785) ; 勝田 将裕 和歌山県立医科大学, 医学部, 准教授 (50464673) ; 宮澤 基樹 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (90549734) ; 川井 学 和歌山県立医科大学, 医学部, 准教授 (40398459) ; 廣野 誠子 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (60468288) ; 岡田 健一 和歌山県立医科大学, 医学部, 講師 (50407988)
• Project Period (FY): 2021-04-05 – 2025-03-31
• Keywords: がんワクチン / iPS細胞 / 樹状細胞 / ネオアンチゲン / ペプチド / 膵癌

Outline of Annual Research Achievements

膵癌cell line樹立とNeoantigen同定
42例の膵癌患者からの切除組織で解析した。切除した膵癌組織からCTOS法を用いた3次元培養を行った。ついで、膵癌細胞のCTOS cell line化を行った。つぎに初代培養から安定したCTOS cell lineを樹立した。42例中CTOS cell lineは3例に可能であった (Donor A, B, C)。cell lineが樹立できた3例の末梢血を採取し、単核球を凍結保存し、CTLのソースとした。続いて膵癌患者のCTOSの変異遺伝子をWhole-exome sequencing法で確認した。正常細胞として凍結保存している末梢血単核球を、膵癌細胞はCTOS cell lineを用いて行った。それらの細胞を自動核酸抽出装置 QIA symphony SP system (QIAGEN 社) にてシリカゲルによる精製と磁性粒子による操作でDNA抽出を行った。同時に患者血液から正常DNAの抽出を行った。核酸抽出後、ライブラリー構築・Whole-exome sequencing法によるシーケンスを行った。解析は外部委託 (Onvotherapy社) で行った。正常細胞および膵癌細胞のWES、膵癌細胞はRNAシーケンス解析を行い、膵癌細胞でのみ起きている遺伝子変異を同定するとともに、各遺伝子の膵癌細胞での発現量を解析中である。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

今年度は膵癌患者のCTOS cell line化とNeoantigen候補遺伝子の選定であったが，前半のライン化には成功しているが，Neoantigenの同定には至っていない。MSI-Hの膵癌患者はNeoantigenの同定が容易と考えるが，Donor A, B, CともMSI-Lであったのが一番の原因であろう。

Strategy for Future Research Activity

MSI-Hの膵癌患者より再度CTOS cell lineを作成し，Neoantigen解析を行う予定にしている。

Research Products

• [Journal Article] Tumor RNA transfected DCs derived from iPS cells elicit cytotoxicity against cancer cells induced from colorectal cancer patients in vitro. (2022)
  • Author(s): Maruoka S, Ojima T, Iwamoto H, Kitadani J, Tabata H, Tominaga S, Katsuda M, Hayata K, Takeuchi A, Yamaue H.
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: 12 Pages: 3295
  • DOI: 10.1038/s41598-022-07305-1.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Kras Gene Analysis Using Liquid-Based Cytology Specimens Predicts Therapeutic Responses and Prognosis in Patients with Pancreatic Cancer. (2022)
  • Author(s): Itonaga M, Ashida R, Murata SI, Yamashita Y, Hatamaru K, Tamura T, Kawaji Y, Kayama Y, Emori T, Kawai M, Yamaue H
  • Journal Title: Cancers (Basel). Volume: 14 Pages: 551
  • DOI: 10.3390/cancers14030551.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Randomized phase III trial of intravenous and intraperitoneal paclitaxel with S-1 versus gemcitabine plus nab-paclitaxel for pancreatic ductal adenocarcinoma with peritoneal metastasis (SP study). (2022)
  • Author(s): Yamamoto T, Fujii T, Hirano S, Motoi F, Honda G, Uemura K, Kitayama J, Unno M, Kodera Y, Yamaue H
  • Journal Title: Trials. Volume: 23 Pages: 119
  • DOI: 10.1186/s13063-022-06049-7.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Pancreatectomy With Artery En-bloc Resection for Pancreatic Neck/Body Cancer: A Single-arm Pilot Study. (2022)
  • Author(s): Okada KI, Kawai M, Hirono S, Hayami S, Miyazawa M, Kitahata Y, Ueno M, Kobayashi R, Miyamoto A, Wada Y, Asamura S, Yamaue H.
  • Journal Title: Anticancer Res. Volume: 42 Pages: 217-227
  • DOI: 10.21873/anticanres.15476.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Comprehensive Genomic Profiling of Neuroendocrine Carcinomas of the Gastrointestinal System. (2022)
  • Author(s): Yachida S, Totoki Y, Nakatani Y, Horie M, Kawasaki K, Nakamura H, Saito-Adachi M, Suzuki M, Takai E, Hama N, Higuchi R, Hirono S, Shiba S, Kato M, Furukawa E, Arai Y, Rokutan H, Hashimoto T, Mitsunaga S, Kanda M, Tanaka H, Takata S, Shimomura A, Oshima M, Hackeng WM, Okumura T, Okano K, Yamamoto M, Yamaue H
  • Journal Title: Cancer Discov. Volume: 12 Pages: 692-711
  • DOI: 10.1158/2159-8290.CD-21-0669.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Circulating Tumor DNA as a Potential Prognostic Marker in Patients with Borderline-Resectable Pancreatic Cancer Undergoing Neoadjuvant Chemotherapy Followed by Pancreatectomy. (2022)
  • Author(s): Kitahata Y, Kawai M, Hirono S, Okada KI, Miyazawa M, Motobayashi H, Ueno M, Hayami S, Miyamoto A, Yamaue H.
  • Journal Title: Ann Surg Oncol. Volume: 29 Pages: 1596-1605
  • DOI: 10.1245/s10434-021-10985-0.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Aberrant integration of Hepatitis B virus DNA promotes major restructuring of human hepatocellular carcinoma genome architecture. (2021)
  • Author(s): Ueno M, Hayami S, Yamaue H, et al,
  • Journal Title: Nat Commun. Volume: 12 Pages: 6910
  • DOI: 10.1038/s41467-021-26805-8.
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Complete circumferential lymphadenectomy around the superior mesenteric artery with preservation of nerve plexus reduces locoregional recurrence after pancreatoduodenectomy for resectable pancreatic ductal adenocarcinoma. (2021)
  • Author(s): Hirono S, Kawai M, Okada KI, Miyazawa M, Kitahata Y, Kobayashi R, Hayami S, Ueno M, Yamaue H.
  • Journal Title: Eur J Surg Oncol. Volume: 47 Pages: 2586-2594
  • DOI: 10.1016/j.ejso.2021.06.005.
  • Peer Reviewed