Estimating aquatic plant diversity in freshwater sediments using environmental DNA metabarcoding

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K05642
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related
• Research Institution: National Institute for Environmental Studies
• Principal Investigator: Fukumori Kayoko 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 特別研究員 (00644535)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 今藤 夏子 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (10414369) ; 角谷 拓 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40451843)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: メタバーコーディング / 水生植物 / 環境DNA / 淡水 / ため池

Outline of Final Research Achievements

We investigated aquatic plant diversity in freshwater sediments and waters in pools using environmental DNA (eDNA) metabarcoding. We collected sediments and surface waters in pools and extracted total eDNA. DNA metabarcoding of the rbcL gene sequences indicated that genus diversity of aquatic plants in the study area were higher in sediments than in waters. The result suggested that some aquatic plant species which are not distributed in water columns were present in sediments as seed bank or small pieces of plant material.

Free Research Field

動物生態学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究は、直接野外で生育を確認することが難しい水生植物を環境DNAメタバーコーディングによって検出することで、精度よく種多様性を評価することができる。この方法を用いれば、外来水生植物による漁業被害を事前に防止するための生育調査や希少種の保全などに役立つことが期待される。