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2023 Fiscal Year Research-status Report

肺腺癌multi-omicsデータを用いた、ミトコンドリアの分子病理学的意義探索

Research Project

Project/Area Number 21K06899
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

坂下 信悟  国立研究開発法人国立がん研究センター, 先端医療開発センター, ユニット長 (40620638)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Keywordsミトコンドリア / アルゴリズム
Outline of Annual Research Achievements

癌細胞のミトコンドリアを病理組織において免疫組織化学で評価する場合、ミトコンドリアは正常細胞を含めて様々な組織で発現しているために、陽性/陰性などのカットオフ値を設定することが困難である。このため従来のように陽性/陰性といった評価方法ではなく、一細胞当たりの陽性数を定量化する必要がある。一般的に、免疫組織化学の評価には染色強度と染色された面積が使われることが多い(H-scoreやHER2 scoreなど)。一方、DISH/FISHや電顕では、陽性細胞数を定量することは可能であるが、数個~数十個といった少ない細胞数で判断しなくてはならず、全体像を定量化することが困難である。このため、ミトコンドリアを免疫組織化学で評価するためには、新たな評価方法(定量化方法)を構築することが必要である。今回我々は、免疫染色をHSVに変換し、核と免疫染色の色を分離し、Watershed法を用いて核の数をカウントし、COX4陽性細胞数を1細胞当たりの核の数で除したMitoScoreというものを算出するアルゴリズムを開発した。本測定法は、肺がん細胞株、正常組織を用いてValidationされた。免疫染色では腫瘍細胞密度は考慮されたないため、ミトコンドリアがどのくらい含まれているのかよくわからないが、Mito-scoreをヒートマップで表わすことによって、周辺のlepidic部分にミトコンドリアが多く含まれ、中心部の浸潤部でミトコンドリアが少ないことがわかった。Mitoscoreの分布をみると、高いものから低いものまで様々なものがある事がわかった。肺腺癌や肺扁平上皮癌においては、予後の差は認められなかったが、肺癌では、Mito-scoreは小細胞癌において、腺癌・扁平上皮癌と比較して優位に低いという傾向が認められた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

上記の内容はJournal of Cancer Research and Clinical Oncology誌へ掲載された。

Strategy for Future Research Activity

今後は、このMitoScoreを他臓器(食道、乳腺など)に展開してミトコンドリアの量が様々な腫瘍において、臨床病理学的因子とどの様な相関を持っているかを見ていく予定である。

Causes of Carryover

論文投稿の為の、追加実験、英文校正、掲載料について、次年度におよぶ可能性があったから

  • Research Products

    (5 results)

All 2024 2023

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] An algorithm-based technique for counting mitochondria in cells using immunohistochemical staining of formalin-fixed and paraffin-embedded sections2024

    • Author(s)
      Sakashita Mai、Motoi Noriko、Yamamoto Gaku、Gambe Emi、Suzuki Masanori、Yoshida Yukihiro、Watanabe Shun-ichi、Takazawa Yutaka、Aoki Kazunori、Ochiai Atsushi、Sakashita Shingo
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 150 Pages: -

    • DOI

      10.1007/s00432-024-05653-1

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Extracting interpretable features for pathologists using weakly supervised learning to predict p16 expression in oropharyngeal cancer2024

    • Author(s)
      Adachi Masahiro、Taki Tetsuro、Sakamoto Naoya、Kojima Motohiro、Hirao Akihiko、Matsuura Kazuto、Hayashi Ryuichi、Tabuchi Keiji、Ishikawa Shumpei、Ishii Genichiro、Sakashita Shingo
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-024-55288-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Immunohistochemistry and oxygen saturation endoscopic imaging reveal hypoxia in submucosal invasive esophageal squamous cell carcinoma2023

    • Author(s)
      Minakata Nobuhisa、Sakashita Shingo、Wakabayashi Masashi、Nakamura Yuka、Sunakawa Hironori、Yoda Yusuke、Ishii Genichiro、Yano Tomonori
    • Journal Title

      Cancer Medicine

      Volume: 12 Pages: 15809~15819

    • DOI

      10.1002/cam4.6217

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Requirement of image standardization for AI-based macroscopic diagnosis for surgical specimens of gastric cancer2023

    • Author(s)
      Sakashita Shingo、Sakamoto Naoya、Kojima Motohiro、Taki Tetsuro、Miyazaki Saori、Minakata Nobuhisa、Sasabe Maasa、Kinoshita Takahiro、Ishii Genichiro、Ochiai Atsushi
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 149 Pages: 6467~6477

    • DOI

      10.1007/s00432-022-04570-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] パラフィン包埋永久標本を用いた免疫染色標本における  機械的なミトコンドリア数計測システムの構築2024

    • Author(s)
      坂下麻衣
    • Organizer
      第113回 日本病理学会総会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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