2023 Fiscal Year Annual Research Report
Characterization of immune responses in tumor microenvironment of patients with clonal hematopoiesis
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21K07152
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
磯部 大地 九州大学, 医学研究院, 助教 (30838727)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菊繁 吉謙 九州大学, 大学病院, 講師 (40619706)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | クローン性造血 / 大腸がん / 腫瘍免疫 / エピゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
固形がんにおいて加齢に伴うクローン性造血（CHIP：Clonal hematopoiesis of indeterminate potential）の合併は予後不良因子である。その原因として、クローン性造血に由来した遺伝子変異を有する免疫担当細胞が免疫応答を抑制し、がんの進展に有利ながん微小環境を生み出していると想定される。しかしながら、その機序は未だ明確ではない。本研究では、血中循環白血球とがん浸潤白血球のリンパ球、骨髄球の各画分の遺伝子変異をそれぞれ解析し、クローン性造血とがん微小環境における免疫応答との関連を詳らかにすることを目的としている。
2022年度までに15例の大腸がん手術検体から細胞を単離し、蛍光標識した各種抗体を用いて細胞を標識した。セルソーターにより各白血球画分を分けて回収し、DNAシークエンスのために各画分からDNAの抽出を行なった。回収できる細胞数の少ないCD14陽性細胞などの白血球画分は、DNAの増幅を行なった後にライブラリ調整を行なった。DNA増幅を行うにあたり、事前に至適な増幅条件（試薬、鋳型DNA量、増幅反応時間）についても検討した。ライブラリ調整の終了した検体から適宜DNAシークエンスを行い、腫瘍組織中に存在する免疫細胞の一部に末梢血細胞と同じ遺伝子変異を認めることを確認した。
2023年度は認めたエピゲノム調節遺伝子の機能欠失性変異について解析を進めた。遺伝子ノックダウンを用いin vitroで細胞分化、免疫細胞機能について機能解析を試みた。
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