Construction of DNA Methylation Markers for liqid biopsy of Pancreatic Cancer.

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K07222
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: Yokoyama Seiya 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 谷本 昭英 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151) ; 濱田 大治 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (30771480) ; 東 美智代 鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 准教授 (60315405) ; 杉本 知之 滋賀大学, データサイエンス学部, 教授 (70324829) ; 赤羽 俊章 鹿児島大学, 医歯学総合研究科, 特任研究員 (70754480)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 膵臓癌 / 胆管癌 / DNAメチル化 / バイオマーカー / 予後予測 / 機械学習

Outline of Final Research Achievements

To overcome the bottlenecks of traditional methylation-specific electrophoresis, we developed a bisulfite amplicon sequencing (BSAS) panel using NGS. This panel enabled DNA methylation analysis in FFPE, LBC, and frozen samples, proving effective for predicting pancreatic cancer malignancy. Additionally, methylation analysis of the MUC1 promoter region was confirmed to be a useful prognostic indicator for pancreaticobiliary cancers.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

従来のメチル化特異的電気泳動法のボトルネックを解消するため、NGSを用いたバイサルファイトアンプリコンシークエンス（BSAS）パネルを開発しました。これにより、FFPE、LBC、凍結検体でのDNAメチル化解析が可能となり、膵臓癌の悪性度予測に有効であることが示されました。MUC1プロモーター領域のメチル化解析が、膵胆道癌の予後指標として有用であることも確認されました。この研究は、膵臓癌の早期診断と治療戦略に革新をもたらし、社会的意義として、患者の生存率向上と治療コストの削減に貢献する可能性があります。