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2021 Fiscal Year Research-status Report

A study on Purkinje cell-specific gene expression in SCA31 model mice

Research Project

Project/Area Number 21K07432
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

石川 欽也  東京医科歯科大学, 東京医科歯科大学病院, 教授 (30313240)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 柳原 大  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (90252725)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords脊髄小脳変性症 / RNA / RNA結合蛋白 / 動物モデル / プルキンエ細胞
Outline of Annual Research Achievements

本研究では脊髄小脳失調症31型(SCA31)の病態を明らかにすることを最終目的として、代表研究者が開発したモデルマウスにおける異常遺伝子および異常タンパクを解明することである。
モデルマウスは、患者の遺伝子異常を有する染色体領域を完全に包含するBAC (bacterial artificial chromosome)をマウスに導入して作製したBAC transgenic mouseであり、高齢になると歩行障害出現するなどの神経障害がみられるモデルマウスである。このモデルマウスにおいて、初年度は歩行などの行動異常が出現する時期における複数の個体から、sacrifice後に小脳を取り出し、RNAを抽出した。併行して同年齢の野生型で遺伝的背景が同じマウスからも同様に小脳を取り出してRNAを抽出した。これらの2種類のRNAを150base-pairのpair-end法でRNA-seqを行い、初年度までにその結果を得た。そのうえで、プルキンエ細胞に特異的に発現する遺伝子に関しての遺伝子発現の変動を検索している。その結果、いくつかのRNAにおいて発現変動を認めた。
また、タンパクに関しては、当初予定したプルキンエ細胞特異的なmRNAをenrichするマウスとの掛け合わせが困難であったため、我々が有するBAC TgマウスのRNA-seq解析から得られたデータをもとに異常RNAに対応する蛋白を検索することに方針を変換し、研究を進めることとした。
これまでの成果としては、同モデルマウスにおける歩行異常を捉えることができ、その時期を明らかにしたうえで、その時期のマウス小脳に発現するいくつかのRNAにおいて発現変動を認めた点が挙げられる。最終的には異常発現RNAを検索しつくし、定量的RT-PCR法などで異常変動を確認する。そのうえで、それらについて可能な分子についてはタンパクレベルでも検証する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

RNA発現異常が初めて明らかになった所見があり、おおむね順調に成果を上げていると考えられる。

Strategy for Future Research Activity

2年目は初年度に引き続きRNAの異常発現を明らかにし、そのうえでRT-PCR法などで検証実験を行う。検証できたものの内、タンパクレベルでの検証を行い、SCA31に関する病態として論文誌上発表などへと進める計画である。

Causes of Carryover

次年度においてマウスの飼育費用や研究解析費用が、当初お予定より多く見積もる必要が生じたため。

  • Research Products

    (3 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results)

  • [Journal Article] Thymidine Kinase 2 and Mitochondrial Protein COX I in the Cerebellum of Patients with Spinocerebellar Ataxia Type 31 Caused by Penta-nucleotide Repeats (TTCCA) n2022

    • Author(s)
      Aoki H, Higashi M, Okita M, Ando N, Murayama S, Ishikawa K, Yokota T.
    • Journal Title

      The Cerebellum

      Volume: Jan 17 Pages: -

    • DOI

      10.1007/s12311-021-01364-2.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Insight Into Spinocerebellar Ataxia Type 31 (SCA31) From Drosophila Model.2021

    • Author(s)
      Ishiguro T, Nagai Y, Ishikawa K.
    • Journal Title

      Front Neurosci.

      Volume: May 25;15 Pages: 648133

    • DOI

      10.3389/fnins.2021.648133.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Neuropathology of SCA34 showing widespread oligodendroglial pathology with vacuolar white matter degeneration: a case study2021

    • Author(s)
      Ozaki K, Irioka T, Uchihara T, Yamada A, Nakamura A, Majima T, Igarashi S, Shintaku H, Yakeishi M, Tsuura Y, Okazaki Y, Ishikawa K, Yokota T.
    • Journal Title

      Acta Neuropathol Commun .

      Volume: 172 (Oct 24) Pages: -

    • DOI

      10.1186/s40478-021-01272-w.

    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2022-12-28  

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