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2022 Fiscal Year Research-status Report

遺伝性不整脈症候群の病原性遺伝子変異の決定とそれに基づく個別化医療の実現

Research Project

Project/Area Number 21K08075
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

林 研至  金沢大学, 保健学系, 准教授 (00422642)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉田 昌平  金沢大学, 附属病院, 助教 (30623657)
野村 章洋  金沢大学, 附属病院, 特任准教授 (30707542)
藤野 陽  金沢大学, 保健学系, 教授 (40361993)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsゼブラフィッシュ / VUS / 遺伝性不整脈症候群
Outline of Annual Research Achievements

R4年度はまず拡張型心筋症(DCM)50症例の網羅的遺伝子解析を行った。DCMの約20~30%は家族性と考えられており、約50種類の遺伝子バリアントが関連遺伝子として報告されている。そのうち、タイチン遺伝子(TTN)truncating variantやラミンA/C遺伝子(LMNA)変異は病的意義が高いと考えられる。網羅的遺伝子解析の結果、10種類のTTN truncating variantsを見出し、1種類のLMNA変異(ナンセンス変異)を見出した。その他、上記以外のDCM既知関連遺伝子のtruncating variants10種類と新規関連遺伝子のtruncating variants14種類を見出した。TTNとLMNA以外の遺伝子のtruncating variantsの多くはVUSと考えられた。
次に肥大型心筋症(HCM)60症例の網羅的遺伝子解析を行った。HCMの約25~40%の症例がサルコメア遺伝子の変異によって発症するとされている。HCMの主要原因遺伝子は11種類であり、MYH7、MYBPC3の変異が多数を占めており、ついでTNNT2、TNNI3、TPM1、MYL3などのサルコメア遺伝子変異が続く。網羅的遺伝子解析の結果、HCM60症例において、MYBPC3の病的バリアント10種類、MYH7の病的バリアント8種類、その他の主要サルコメア関連遺伝子の病的バリアント9種類を見出した。さらに主要サルコメア関連遺伝子以外の20遺伝子に25種類のtruncating variantsを見出した。
現在、心筋症の新規関連遺伝子あるいは発生機序不明の既知関連遺伝子のtruncating variantsの病的意義を明らかにするため、ゼブラフィッシュを用いて機能解析を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

LQTSの原因遺伝子であるKCNQ1のゼブラフィッシュのホモログ遺伝子のホモ接合性変異体を作成し、これを用いてヒトで見つかったKCNQ1のVUSを評価して論文報告した。現在、先天性QT延長症候群の原因遺伝子のひとつであるKCNH2のホモ接合性変異体を作成中である。また、心筋症(DCMおよびHCM)で見いだされた新規関連遺伝子、あるいは発生機序不明既知関連遺伝子のtruncating variants5種類について、ホモ接合性変異体を作成中である。このように本研究はおおむね順調に進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

LQT1で見いだされたVUSの意義を明らかにするため、本研究で作成したゼブラフィッシュkcnq1ホモ接合性変異体を用いて機能解析を行う。

LQT2で見いだされたVUSの意義を明らかにするため、ゼブラフィッシュkcnh2ホモ接合性変異体を作成する。

心筋症(DCMおよびHCM)で見いだされた新規関連遺伝子、あるいは発生機序不明既知関連遺伝子のtruncating variants5種類について、ホモ接合性変異体を作成する。作成した変異体の心電図測定、心臓の活動電位測定、光学顕微鏡下での心房・心室の拍動観察(心拍数、規則性などを評価)および心機能評価(心内径、心内径短縮率など)、光学マッピング(刺激伝導速度を測定)を行う。さらに、ゼブラフィッシュホモ接合性変異体の心臓よりRNAサンプルを抽出しRNA-Seq解析を行い、トランスクリプトーム解析を行う。パスウェイ解析による包括的な解析を行い、発症機序をもとに治療標的分子を探索し、変異遺伝子の機能を調節する薬剤を決定する。

Causes of Carryover

購入希望の物品費が予算額を上回っており、翌年度の研究経費と併せて使用することにしたため。

  • Research Products

    (18 results)

All 2023 2022

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] The utility of zebrafish cardiac arrhythmia model to predict the pathogenicity of KCNQ1 variants2023

    • Author(s)
      Cui Shihe、Hayashi Kenshi、et. al.
    • Journal Title

      Journal of Molecular and Cellular Cardiology

      Volume: 177 Pages: 50~61

    • DOI

      10.1016/j.yjmcc.2023.03.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prediction of atrioventricular conduction disturbance after ablation of persistent atrial fibrillation2023

    • Author(s)
      Chikata Akio、Kato Takeshi、Usuda Kazuo、Fujita Shuhei、Maruyama Michiro、Otowa Kanichi、Tsuda Toyonobu、Hayashi Kenshi、Takamura Masayuki
    • Journal Title

      Journal of Electrocardiology

      Volume: 79 Pages: 30~34

    • DOI

      10.1016/j.jelectrocard.2023.03.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Attainment of the low-density lipoprotein cholesterol treatment target and prognosis of heterozygous familial hypercholesterolemia2023

    • Author(s)
      Tada Hayato、Nomura Akihiro、Nohara Atsushi、Usui Soichiro、Sakata Kenji、Hayashi Kenshi、Fujino Noboru、Takamura Masayuki、Kawashiri Masa-aki
    • Journal Title

      Atherosclerosis

      Volume: 371 Pages: 61~66

    • DOI

      10.1016/j.atherosclerosis.2023.03.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of variants of uncertain significance of LDL receptor on phenotypes of familial hypercholesterolemia2022

    • Author(s)
      Tada Hayato、Kojima Nobuko、Yamagami Kan、Nomura Akihiro、Nohara Atsushi、Usui Soichiro、Sakata Kenji、Hayashi Kenshi、Fujino Noboru、Takamura Masayuki、Kawashiri Masa-aki
    • Journal Title

      Journal of Clinical Lipidology

      Volume: 16 Pages: 863~869

    • DOI

      10.1016/j.jacl.2022.09.007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical Characteristics, Outcomes, and Risk Factors for Adverse Events in Elderly and Non-Elderly Japanese Patients With Non-Valvular Atrial Fibrillation ― Competing Risk Analysis From the Hokuriku-Plus AF Registry ―2022

    • Author(s)
      Tsuda Toyonobu、Hayashi Kenshi、Kato Takeshi、Usuda Keisuke、Kusayama Takashi、Nomura Akihiro、Tada Hayato、Usui Soichiro、Sakata Kenji、Kawashiri Masa-aki、Fujino Noboru、Yamagishi Masakazu、Takamura Masayuki、for the Hokuriku-Plus AF Registry Investigators
    • Journal Title

      Circulation Reports

      Volume: 4 Pages: 298~307

    • DOI

      10.1253/circrep.CR-22-0012

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Targeted deep sequencing analyses of long QT syndrome in a Japanese population2022

    • Author(s)
      Nagata Yuki、Hayashi Kenshi、et al.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0277242

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0277242

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Impact of baseline blood pressure on adverse outcomes in Japanese patients with non-valvular atrial fibrillation: the J-RISK AF2022

    • Author(s)
      Kodani Eitaro、Hayashi Kenshi、et al.
    • Journal Title

      European Heart Journal Open

      Volume: 2 Pages: oeac081

    • DOI

      10.1093/ehjopen/oeac081

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ablation index-guided high-power vs. moderate-power cavotricuspid isthmus ablation2022

    • Author(s)
      Chikata Akio、Kato Takeshi、Usuda Kazuo、Fujita Shuhei、Maruyama Michiro、Otowa Kanichi、Usuda Keisuke、Kusayama Takashi、Tsuda Toyonobu、Hayashi Kenshi、Takamura Masayuki
    • Journal Title

      Heart and Vessels

      Volume: 38 Pages: 90~95

    • DOI

      10.1007/s00380-022-02125-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of baseline clinical factors associated with incident worsening kidney function in patients with non-valvular atrial fibrillation: the Hokuriku-Plus AF Registry2022

    • Author(s)
      Hayashi Kenshi、et al.
    • Journal Title

      Heart and Vessels

      Volume: 38 Pages: 402~411

    • DOI

      10.1007/s00380-022-02178-w

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mechanisms of fever-induced QT prolongation and torsades de pointes in patient with KCNH2 T613M mutation2023

    • Author(s)
      Keisuke Usuda, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      The 87th Annual Scientific Meeting of the Japanese Circulation Society
  • [Presentation] Response of Skin Sympathetic Nerve Activity by Handgrip Exercise in Patients with Long QT Syndrome Type 1 and Type 22023

    • Author(s)
      Shuhei Iwaisako, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      The 87th Annual Scientific Meeting of the Japanese Circulation Society
  • [Presentation] A case of Danon disease presenting with slowly progressive cardiomyopathy and harboring a novel missense mutation in the lysosome-associated membrane protein type 2 (LAMP-2) gene2023

    • Author(s)
      Yoichiro Nakagawa, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      The 87th Annual Scientific Meeting of the Japanese Circulation Society
  • [Presentation] Utility of in vivo zebrafish cardiac assay to predict the functional impact of KCNQ1 variants2022

    • Author(s)
      Shihe Cui, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      ESC Congress 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Case 1: LQTS_Reassessment of KCNQ1 variant of uncertain significance by additional variant classification approach2022

    • Author(s)
      Kenshi Hayashi, et al
    • Organizer
      APHRS 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Management of inherited long QT syndrome: Impact of fever on QT prolongation and torsades de pointes2022

    • Author(s)
      Kenshi Hayashi, et al
    • Organizer
      APHRS 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Utility of in vivo zebrafish cardiac assay to predict the functional impact of KCNQ1 variants2022

    • Author(s)
      Shihe Cui, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      APHRS 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A novel SCN5A variant suggested to be pathogenic by functional analysis in sick sinus syndrome2022

    • Author(s)
      Keisuke Usuda, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      The 68th Annual Meeting of the Japanese Heart Rhythm Society
  • [Presentation] Utility of in vivo zebrafish cardiac assay to predict the functional impact of KCNQ1 variants2022

    • Author(s)
      Shihe Cui, Kenshi Hayashi, et al.
    • Organizer
      The 68th Annual Meeting of the Japanese Heart Rhythm Society

URL: 

Published: 2023-12-25  

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