2021 Fiscal Year Research-status Report
IgG4関連疾患におけるRNA-Seqを用いた遺伝子発現解析と新規治療標的の開発
| Project/Area Number |
21K08471
|
|---|
| Research Institution | University of Tsukuba |
|---|
Principal Investigator |
坪井 洋人 筑波大学, 医学医療系, 講師 (80580505)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
| Keywords | IgG4関連疾患 / RNA-Seq / 主成分分析 / パスウェイ解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
無治療のIgG4関連疾患（IgG4-RD）確診例（2011年IgG4-RD包括診断基準）（N=3）から、組織学的基準を満たす顎下腺、末梢血単核球（PBMC）を採取し、magnetic-activated cell sorting（MACS）でCD3+T細胞、CD19+B細胞を分離した。顎下腺とPBMCの間で、1）CD3+T細胞、2）CD19+B細胞の遺伝子発現をRNA-Seqで比較し、主成分分析（principal component analysis: PCA）によるクラスタリング、発現変動遺伝子に関してIngenuity Pathway Analysis（IPA）を用いてパスウェイ解析を行った。
1）PCAでは末梢血CD3+T細胞と顎下腺CD3+T細胞の遺伝子発現パターンは異なり、顎下腺CD3+T細胞で発現増加した遺伝子は214個、減少した遺伝子は50個であった。IPAでは、顎下腺におけるTh2、Th1、Toll-like receptor（TLR）、SLE in T cell pathway、IL-17シグナルの亢進が認められた。
2）PCAでは末梢血CD19+B細胞と顎下腺CD19+B細胞の遺伝子発現パターンは異なり、顎下腺CD19+B細胞で発現増加した遺伝子は630個、減少した遺伝子は109個であった。IPAでは、顎下腺におけるSLE in B cell pathway、補体、IL-15産生、IL-8シグナルの亢進が認められた。
以上の結果から、RNA-SeqによりIgG4-RD病変局所のT細胞、B細胞で発現変動した遺伝子が同定され、病態への関与が示唆されるパスウェイが抽出された。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
RNA-Seqを用いて、IgG4関連疾患（IgG4-RD）病変局所のT細胞、B細胞で発現変動した遺伝子を同定し、さらに病態への関与が示唆されるパスウェイを抽出できたため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
RNA-Seqで同定された発現変動遺伝子に関して、定量PCRによるvalidationとタンパクレベルでの発現解析をすすめる。
|
Research Products
(2 results)
