Genomics analysis of immune microenvironmental changes in hepatocarcinogenesis after cure of hepatitis C

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K08745
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 55020:Digestive surgery-related
• Research Institution: National Hospital Organization, Kyushu Cancer Center
• Principal Investigator: Sugimachi Keishi 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他 部局等, 肝胆膵外科部長 (90452763)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 間野 洋平 独立行政法人国立病院機構(九州がんセンター臨床研究センター), その他部局等, 肝胆膵外科医師 (10792244) ; 増田 隆明 九州大学, 大学病院, 准教授 (50463493) ; 荒木 啓充 九州大学, 経済学研究院, 助教 (60572823) ; 吉住 朋晴 九州大学, 医学研究院, 教授 (80363373)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 肝細胞癌 / エピゲノム / 転写因子 / C型肝炎治癒

Outline of Final Research Achievements

We conducted research aimed at elucidating the molecular mechanisms underlying the development of hepatocellular carcinoma (HCC) after treatment for hepatitis C virus (HCV) infection. Analyses were performed based on whole-genome methylation sequencing and RNA sequencing. We obtained important insights that epigenome abnormalities in the HCC caused by HCV infection are retained and remained unnormalized even after virological cure of HCV by antiviral therapy. Furthermore, through analysis of transcription factors and their target genes, we revealed that sustained epigenetic abnormalities induce abnormalities in apoptosis and inflammatory signaling pathways, which are associated with the development of HCC.

Free Research Field

消化器外科学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究により、C型肝炎が治癒した後もC型肝炎ウイルス(HCV)によって引き起こされたメチル化異常が肝臓で保持されているという重要な知見を得ることができた。さらに、HCV排除後も維持されているメチル化・エピゲノム異常に起因する転写因子と標的遺伝子の発現変化が、SVR肝発癌に関与していることが分かった。本研究成果によりメチル化変動転写因子は、肝癌発生の予測や早期発見のバイオマーカーとして有望であると考えられた。