増加している口腔癌を含むHPV関連疾患の予防に向けた感染HPVの型と細菌叢の解析

2022 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 21K10244
• Research Institution: Aichi Gakuin University
• Principal Investigator: 吉田 和加 愛知学院大学, 歯学部, 講師 (10513210)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: HPV / 病理学 / 感染症

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、これまでにベトナム、モンゴルにて採取した1,800名以上の口腔粘膜試料のうち、HPV陽性試料について、16S rRNA PCR産物をもとに細菌叢解析を行い、約40種の粘膜指向性HPVの型と細菌叢の関連を検討し、年々増加している口腔癌を含むHPV関連疾患の予防に向けた基礎データを得ることを目的としている。
当講座にて、これまでに採取した口腔粘膜擦過試料より、HPV感染の有無と感染HPVの型の検出を行っている。潜伏感染中の少量のウイルスも検出し得ると思われる感度の高い検出法として、ある程度断片化された鋳型DNAからも検出し得るPCR産物の小さな改良コンセンサスプライマー（MGP）セットを用いたPCRと、約40種類にのぼる粘膜指向性HPV型特異的プローブを用いたReverse Line Blot法を組み合せる方法により、HPV感染の検出と感染HPVの型の同定を行っている。
また、検体採取の際に収集した疫学データ（喫煙、飲酒、口腔粘膜疾患の有無と種類、口腔内補綴修復物の有無など）を整理し、本研究のデータベースへの登録を行っている。
2021、2022年度は、当初の計画より大幅に遅れた。16S rRNA PCR産物をもとにした細菌叢解析（16S rRNA領域特異的ライブラリーの作成、16S rRNA PCR産物の解析、16S rRNAデータベースに対する相同性検索および系統分類解析）には至らなかった。在庫の試薬等を使用したため、本研究費からの支出はなかった。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

他の業務（学内業務、学会の学術雑誌の編集業務など）に時間を要したため、研究計画より大幅に遅れた。
2023年度で遅れを取り戻したいと考えている。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、これまでに採取した口腔粘膜擦過試料より、HPV感染の有無と感染HPVの型の検出を行う。改良コンセンサスプライマー（MGP）を用いたPCRと、粘膜指向性の40種類にのぼるHPV型のプローブを用いたReverse Line Blot Hybridization法を組合せる方法を用いる。
HPV陽性試料について、16S rRNA PCR産物をもとにした細菌叢解析を行う（業者へ委託）。
高速シーケンス解析用アダプター配列を付加した16S rRNA領域特異的プライマー(V3-V4領域)を用いてPCR増幅、生成を行い、ライブラリーを作成する。
高速シーケンス解析用アダプター配列を付加しPCR産物を用いて、次世代シーケンサーによる配列取得を行う。得られた配列を用いて16S rRNAデータベースに対する相同性検索および系統分類解析を実施し、菌種組成などを明らかにする。
当講座にて、感染HPVの型、菌叢組成の他、検体採取の際に収集した疫学データ（喫煙、飲酒、口腔粘膜疾患の有無と種類、口腔内補綴修復物の有無など）を合わせて解析し、それらの関連を検討する。

Causes of Carryover

2021、2022年度は、当初の計画より大幅に遅れた。16S rRNA PCR産物をもとにした細菌叢解析に多くの予算を使用する予定であったが、その段階まで研究が進まなかったため、次年度使用額が生じた。現在、その前段階の解析を行っているが、当研究室の在庫の試薬などを用いており、本研究費からの支出はなかった。
2023年度から遅れを取り戻す予定であり、予算も使用する予定である。