2022 Fiscal Year Research-status Report
AIを応用した膵癌患者体液中miRNA診断パネルの作製および体液間移行の解析
Project/Area Number |
21K16436
|
Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
Principal Investigator |
石毛 文隆 千葉県がんセンター(研究所), 肝胆膵外科, 医長 (60815801)
|
Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
Keywords | miRNA / 膵癌 / バイオマーカー |
Outline of Annual Research Achievements |
当院内各所と連携し、研究に必要な検体を院内でスムーズに確保できるような仕組みを構築した。
膵がん及びIPMC(n=15),胆管がん(n=3)などの難治性消化器悪性疾患症例と、健常control群としての良性疾患症例(IPMN、慢性胆嚢炎、胆嚢腺筋症など; n=12)を合わせて30症例の血液を採取した。それらの血液からマイクロRNAを抽出し、QIAseq miRNA Library Kit を用いてsmall RNA libraryの構築を行い、次世代シーケンサー (Ion PGM&8482; System)を用いてmicroRNAの網羅的プロファイリングを行った。 膵がん症例 vs その他症例での有意な発現差異を呈するマイクロRNAは認められなかった。 膵がん症例 vs 健常症例では有意と思われる発現差異を有するマイクロRNAが複数認められた。 今後はひきつづきサンプル数を増やし、マーカー候補となるようなマイクロRNAの絞り込み・多検体での検証やAIを用いた統合的な解析、パネル化に向けて研究を進めていきたい。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
院内各所との連携により症例の検体確保は容易になってきたが、まだ必要十分な症例数には達していないと考える。 しかし、検体採取からmiRNAの抽出まで短時間で行えるようになり、次世代シーケンサーでの発現プロファイリングに十分なQualityのmiRNA Libraryを構築できるようになっている。
|
Strategy for Future Research Activity |
残りの研究資金と期間から逆算し、膵がん症例サンプルを30例にまで増やしてデータの比較検討、解析を行いたい。
|
Causes of Carryover |
主に実験器具・キットの購入です。そのほか学会参加費、諸経費です。
|