Mutagenesis of non-coding regions via excisional genome editing

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K19178
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 42:Veterinary medical science, animal science, and related fields
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: Mizuno Seiya 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (10633141)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 綾部 信哉 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 専任研究員 (10633563) ; 久野 朗広 筑波大学, 医学医療系, 助教 (60830122)
• Project Period (FY): 2021-07-09 – 2023-03-31
• Keywords: 遺伝子改変マウス / ゲノム編集

Outline of Final Research Achievements

Proteins expressed from genes encoded on chromosomes are the basis of various biological activities and life events. Although the effects of gene deletion have often been studied in life science and medical research using model animals such as laboratory mice, functional analysis of the chromosomal sequences that control the timing, location, and amount of gene expression has not been conducted.
In this study, we developed a method to determine the chromosomal regions that control gene expression patterns, and in mouse Embryonic Stem (ES) cells, we succeeded in developing a method that contributes to the identification of a wide range of candidate genomic regions that might control gene expression patterns.

Free Research Field

実験動物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

一般的な遺伝子は各種の生命活動や生命イベントを制御するタンパク質をコードしている。遺伝子およびそれにコードされたタンパク質の機能を知るためには、その遺伝子が存在する染色体領域を欠落させたモデル動物を作出すればよい。このノックアウト動物の作出と解析により、各種遺伝子の機能が続々と明らかとなってきているが、それらの遺伝子が機能すべき時間や細胞種、そしてそれらの遺伝子およびタンパクの量を規定する染色体領域の解析はほとんど進んでいない。我々が新たなに開発した大規模かつ半ランダム染色体領域を欠落させることができる今回の手法は、遺伝子の発現パターンの理解に貢献する。