Analysis of molecular characteristics and metastatic mechanism of Pancreatic neuroendocrine neoplasm.

2023 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21KK0146
• Research Institution: Tokyo Medical and Dental University
• Principal Investigator: 伊藤 剛 東京医科歯科大学, 高等研究院, 特任助教 (20733900)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小林 正典 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 助教 (10825459) ; 工藤 篤 東京医科歯科大学, 医学部附属病院, 准教授 (20376734) ; 田邉 稔 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (50197513) ; 岡本 隆一 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (50451935)
• Project Period (FY): 2021-10-07 – 2024-03-31
• Keywords: 膵神経内分泌腫瘍 / pan-NEN / 膵オルガノイド / RNA-seq

Outline of Annual Research Achievements

2023年度は当初の研究計画にのっとりpan-NEN手術検体、EUS-FNA検体、同一症例の膵非腫瘍組織や肝転移巣等からも患者由来オルガノイドを樹立し100例を超える手術検体とオルガノイドのバイオバンクの樹立を行った。同バイオバンクよりNET症例の手術検体、原発巣25例、正常部24例、肝転移15例とオルガノイド検体、腫瘍部10例、肝転移4例、正常部10例をそれぞれRNA-seqに提出しIKMB国際共同研究先IKMBの専任Bioinformaticianとzoom会議を通して密に連携を行い、解析を行なった。正常部と比較した原発巣の遺伝学的特徴、原発巣と比較し肝転移で変動が大きい遺伝子群の解析を行い、GO解析では肝転移巣でより免疫細胞賦活に関連する経路の賦活を認めている。またG1,2,3の遺伝学的特徴についてはG1とG3でPCAプロットにおいて分別が可能であった。またNETG2手術検体のシングルセルシークエンスも行い、腫瘍を構成する細胞の不均一性も明らかとしている。腫瘍細胞だけでなく、間質や免疫細胞も多数認め新たな知見と考えている。
本年度も本グループから国際共同研究先のキールへは研究代表者と指導大学院生1名が赴き、共同研究先研究所で口演し、成果の発表を行った。また候補遺伝子の抽出や今後の方針について現地で意見交換を行うだけでなく、国際学会にも出席し発表を行なっている。今後の国際交流発展のため研究代表者所属大学とキール大学は医学部間協定を締結し、今後ますますの国際交流の発展を視野に入れている。

Research Products

• [Int'l Joint Research] IKMB, Christian Albrecht University(ドイツ)
  • Country Name: GERMANY
  • Counterpart Institution: IKMB, Christian Albrecht University
• [Journal Article] Single cell analysis revealed that two distinct, unique CD4+ T cell subsets were increased in the small intestinal intraepithelial lymphocytes of aged mice (2024)
  • Author(s): Yonemoto Yuki、Nemoto Yasuhiro、Morikawa Ryo、Shibayama Nana、Oshima Shigeru、Nagaishi Takashi、Mizutani Tomohiro、Ito Go、Fujii Satoru、Okamoto Ryuichi
  • Journal Title: Frontiers in Immunology Volume: 15 Pages: -
  • DOI: 10.3389/fimmu.2024.1340048
• [Journal Article] Serine metabolism is crucial for cGAS-STING signaling and viral defense control in the gut (2024)
  • Author(s): Becker B, Wottawa F, Bakr M, Koncina E, Mayr L, Kugler J, Yang G, Windross SJ, Neises L, Mishra N, Harris D, Tran F, Welz L, Stengel ST, Ito G, , Coleman OI, Jaeger C, Haller D, Paludan SR, Blumberg R, Kaser A, Cicin-Sain L, Schreiber S, Adolph TE, Letellier E, Rosenstiel P, Meiser J, Aden K
  • Journal Title: iScience Volume: 27 Pages: 109173～109173
  • DOI: 10.1016/j.isci.2024.109173
• [Journal Article] Discovery of non-genomic drivers of YAP signaling modulating the cell plasticity in CRC tumor lines (2024)
  • Author(s): Ogasawara N, Kano Y, Yoneyama Y, Kobayashi S, Watanabe S, Kirino S, Velez-Bravo FD, Hong Y, Ostapiuk A, Lutsik P, Onishi I, Yamauchi S, Hiraguri Y, Ito G, Kinugasa Y, Ohashi K, Watanabe M, Okamoto R, Tejpar S, Yui S
  • Journal Title: iScience Volume: 27 Pages: 109247～109247
  • DOI: 10.1016/j.isci.2024.109247
• [Journal Article] Organoids transplantation as a new modality to design epithelial signature to create a membrane-protective sulfomucin-enriched segment (2023)
  • Author(s): Watanabe Satoshi、Ogasawara Nobuhiko、Kobayashi Sakurako、Kirino Sakura、Inoue Masami、Hiraguri Yui、Nagata Sayaka、Shimizu Hiromichi、Ito Go、Mizutani Tomohiro、Nemoto Yasuhiro、Tsuchiya Kiichiro、Okamoto Ryuichi、Watanabe Mamoru、Yui Shiro
  • Journal Title: Journal of Gastroenterology Volume: 58 Pages: 379～393
  • DOI: 10.1007/s00535-023-01959-y
• [Presentation] Analysis of gene expression to elucidate the pathogenesis of pancreatic solid pseudopapillary neoplasm. (2023)
  • Author(s): Katsuda H, Ito G, Hiraguri Y, Muto T, Ishido S, Kobayashi M, Yamashita H, Ito A, Ono H, Kudo A, Watanabe M, Tanabe M, Okamoto R
  • Organizer: UEGW2023
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Delineation of the role of the Autophagy protein Atg16L1 for epithelial proliferation and cell death via type1 interferon (2023)
  • Author(s): Ito G, Mishra N, Rosenstiel P, Watanabe M
  • Organizer: GI research academy