2012 Fiscal Year Annual Research Report
世界最高レベルの瞬発系選手の全ゲノム解析による運動能力関連多型の解明
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22240072
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Geriatric Hospital and Institute of Gerontology |
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Principal Investigator |
田中 雅嗣 地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 東京都健康長寿医療センター研究所, 研究部長 (60155166)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
福 典之 地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター(東京都健康長寿医療センター研究所), 東京都健康長寿医療センター研究所, 研究員 (40392526)
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | ゲノム全領域関連解析 / エクソン全領域関連解析 / ミトコンドリアゲノム多型 / 一塩基多型 / 全エクソン塩基配列解析 / 核ゲノム多型 / 瞬発系運動能力 / 陸上短距離走 |
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| Research Abstract |
世界レベルの瞬発系運動選手の全ゲノムに存在する一塩基多型(SNP)を対象とした網羅的な関連解析を行った。最初にジャマイカの短距離選手群48人と対照群48人のDNAをIllumina社のHuman 660W-Quad BeadChipを用いて約60万個のSNPを解析した。さらにジャマイカの短距離選手群8人と対照群8人ならびに米国の短距離選手群48人と対照群48人のDNAをOmini1 BeadChipで分析した。660Wで分析した69検体とOmni1で分析した89検体と288人のDNAをOmniExpressによって分析した。これらのデータに基づいて50個のSNPを選択し、Luminex法を用いて1469検体について多型を解析したところ、1449検体において判定可能であった。筋力など運動能力に関連する表現型との関連解析をすすめているが、現在までにMAF > 0.05かつp < 1.0E-7を満たす統計学的に有意な多型は見いだされなかった。このため、より頻度の低い（MAF = 0.005～0.05）の機能的多型に注目して探索を行う必要があると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] Metabolomic profiling rationalized pyruvate efficacy in cybrid cells harboring MELAS mitochondrial DNA mutations2012
Author(s)
Kenjiro Kami, Yasunori Fujita, Saori Igarashi, Sayaka Koike, Shoko Sugawara, Satsuki Ikeda, Naomi Sato, Masafumi Ito, Masashi Tanaka, Masaru Tomita, Tomoyoshi Soga
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Journal Title
Mitochondrion
Volume: 12: 6
Pages: 644-653
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[Journal Article] Genes down-regulated in spaceflight are involved in the control of longevity in Caenorhabditis elegans2012
Author(s)
Yoko Honda, Akira Higashibata, Yohei Matsunaga, Yukiko Yonezawa, Tsuyoshi Kawano, Atsushi Higashitani, Kana Kuriyama, Toru Shimazu, Masashi Tanaka, Nathaniel J Szewczyk, Noriaki Ishioka, Shuji Honda
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Journal Title
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[Journal Article] Importance of mitochondrial haplotypes and maternal lineage in sprint performance among individuals of West African ancestry2012
Author(s)
M Deason, R Scott, L Irwin, V Macaulay, N Fuku, M Tanaka, R Irving, V Charlton, E Morrison, K Austin, Y P Pitsiladis
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Journal Title
Scand J Med Sci Sports
Volume: 22: 2
Pages: 217-223
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[Journal Article] Synergistic effects of genetic variants of APOA5 and BTN2A1 on dyslipidemia or metabolic syndrome2012
Author(s)
Mizuho Hiramatsu, Mitsutoshi Oguri, Kimihiko Kato, Hideki Horibe, Tetsuo Fujimaki, Sachiro Watanabe, Kei Satoh, Yukitoshi Aoyagi, Masashi Tanaka, Dong-Jik Shin, Jong Ho Lee, Yangsoo Jang, Yoshiji Yamada
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Journal Title
Int J Mol Med
Volume: 30
Pages: 185-192
DOI
Peer Reviewed
