2011 Fiscal Year Annual Research Report
霊長類の自然集団に注目した感覚関連遺伝子の多様性の探索と適応進化の検証
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22247036
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
河村 正二 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授 (40282727)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今井 啓雄 京都大学, 霊長類研究所, 准教授 (60314176)
松本 晶子 琉球大学, 観光産業科学部, 教授 (80369206)
東原 和成 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (00280925)
太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)
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| Keywords | 霊長類 / 感覚受容遺伝子 / 野生集団 / 遺伝的多型 / 適応進化 |
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| Research Abstract |
1.サンプル収集:昨年度に引き続きコスタリカのサンタロサ国立公園からオマキザルとクモザルの糞サンプルを収集した。
2.遺伝子及び化学分析:これらのサンプルからDNAを抽出した。赤-緑オプシン遺伝子、苦味受容体TAS2R1、4、9、16、40、42及び偽遺伝子pTAS2R60、中立対照としてeta-globin pseudogene、von Willebrand factor intron 11、transferrin intron 5、beta-2-microglobulin precursor introns 2&3、blue opsin intron 4、ZFY intron 7、ミトコンドリアD ループの集団配列決定を行なった。その結果、新世界ザルのTAS2R1はリガンド結合部位のアミノ酸がヒトと異なっており、リガンドがヒトと異なる可能性があること、ヒトとチンパンジーのTAS2R遺伝子群は機能制約が緩んでいると考えられているのに対し、新世界ザルでは機能制約が強いこと、オマキザルのTAS2R1とTAS2R16は群れ間で顕著な集団分化を示し、地域適応的な自然選択を受けている可能性があることを示した。また、香気成分分析に関しては313種類の化合物を検出し、成熟と未成熟の間で香気成分種類数に差が大きい果実ほどよく匂いが嗅がれる傾向があることを示した。これらのことから多型的色覚の新世界ザルは恒常的3色型の狭鼻猿類より味覚や嗅覚により依存している可能性が考えられる。
3.ホエザル赤-緑オプシンのハイブリッド遺伝子について再構成実験を行ない、それらの吸収波長が赤と緑オプシンの中間にあることを確認した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
オプシン、苦味受容体、中立対照とも集団配列決定を進展させ、果実の香気物質について一定の分析結果を得た。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の予定に従って研究を継続する。学会等で経過報告を行ない、議論を通してよりよい研究に繋げる。
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[Journal Article] Polymorphic color vision in primates : evolutionary considerations2012
Author(s)
Kawamura, S., Hiramatsu, C., Melin, A.D., Schaffner, C.M, Aureli, F., Fedigan, L.M.
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Journal Title
Post-Genome Biology of Primates, Springer, Tokyo, Japan(書籍の1章)(Hirai, H., Imai, H.and Go, Y.eds.)
Pages: 93-120
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Gene conversion and purifying selection shape nucleotide variation in gibbon L/M opsin genes2011
Author(s)
Hiwatashi, T., Mikami, A., Katsumura, T., Suryobroto, B., Perwitasari-Farajallah, D., Malaivijitnond, S., Siriaroonrat, B., Oota, H., Goto, S. and Kawamura, S.
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Journal Title
BMC Evolutionary Biology
Volume: 11
Pages: 312
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Finding a polymorphism of the L-M opsin gene in howler monkeys which have been supposed to have uniform trichromacy in New World monkeys2011
Author(s)
Matsushita, Y., Oota, H., Welker, B., Pavelka, M., Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto, Japan
Year and Date
20110726-20110730
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[Presentation] Toward understanding evolutionary force behind color vision polymorphism in humans2011
Author(s)
Ishizaki, N., Shirai, K., Fukuyo, Y., Ishida, E, Kidd. K.K., Oota, H., Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto, Japan
Year and Date
20110726-20110730
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[Presentation] Toward understanding importance of chemical sense in primates : a study of natural populations of color-vision polymorphic New World monkeys2011
Author(s)
Sakurai, K., Bergstrom, M., Shirasu, M., Imai, H., Touhara, K., Oota, H., Aureli, F., Fedigan, L., Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto, Japan
Year and Date
20110726-20110730
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[Presentation] Genetic variation in wild capuchins and spider monkeys in Costa Rica : implications for dispersal patterns2011
Author(s)
Sato, A., Campos, F., Oota, H., Jack, K., Di Fiore, A., Aureli, F., Fedigan, L., Kawamura, S.
Organizer
Annual Conference of Soceity for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE 2011)
Place of Presentation
Kyoto University (Clock Tower Centennial Hall and Shiran Kaikan) and Miyako Messe, Kyoto, Japan
Year and Date
20110726-20110730
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