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2010 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子組換え昆虫ゲノムのエピジェネティク制御

Research Project

Project/Area Number 22248004
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

日下部 宜宏  九州大学, 農学研究院, 准教授 (30253595)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 李 在萬  九州大学, 農学研究院, 助教 (50404083)
山本 公子  独立行政法人農業生物資源研究所, 昆虫科学研究領域, 主任研究員 (40370689)
Keywords遺伝子組換え昆虫 / カイコ / ヘテロクロマチン / 動原体 / エピジェネティクス / アルゴノート / ポリコーム / ヒストン修飾
Research Abstract

(1)カイコヒストンコードの解読については、ヒストンH3とそのバリアント(H3.3)を中心に解析を行い、H3K4、H3K9、H3K14、H3K18、H3K23、H3K27についてのメチル化及びアセチル化修飾の組み合わせを明らかとした。一方、アルギニン残基とリン酸化を受けるセリン、スレオニン残基の修飾についてはほとんど未修飾であることが明らかとなった。
(2)ヘテロクロマチンコア構造の解析に関しては、カイコH3K27-Polycombシステムに関与する因子の解析を行った。カイコゲノムよりシステムに関与する13遺伝子をクローニングし、RNAi法を用いた遺伝子機能阻害実験によりこれらの遺伝子がH3K27のモノメチルからトリメチルへの修飾に関わっていることを示した。また、ゲノムワイドなカイコのクロマチン構成については、カイコHP1に対する抗体を作成し、CHIP-Sequence解析を行っている。
(3)カイコヘテロクロマチン制御に関わる遺伝子群の機能解析については、既に4種のカイコArgonaute遺伝子をクローニングしており、これらの遺伝子のノックダウン時における遺伝子発現への影響をマイクロアレイで解析した。その結果、カイコSIWI及びAGO3によって制御されている反復配列群を同定した。現在、これらの反復配列の遺伝子発現制御とクロマチン構造の変化におけるArgonaute遺伝子の役割を解析している。
(4)遺伝子組換えカイコを用いた導入遺伝子の安定性制御とエピジェネティクな発現制御機構の解明については、導入したレポーターカセットの挿入部位周辺のクロマチン構造と転写活性を解析するために次世代シーケンサーを用いたChip-Seq及びRNA-Seqの準備を進めており、ヘテロクロマチン関連のHP1及びPolycombについてのデータを解析している。

  • Research Products

    (11 results)

All 2011 2010

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Molecular Characterization of Core Histones in the Silkworm, Bombyx mori.2011

    • Author(s)
      Mitsunobu, et al.
    • Journal Title

      J.Insect Biotech.Seric.

      Volume: 79 Pages: 75-83

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The telomere-specific non-LTR retrotransposons SART1 and TRAS1 are suppressed by Piwi subfamily proteins in the silkworm, Bombyx mori2010

    • Author(s)
      Tatsuke, et al.
    • Journal Title

      Cell.Mol.Biol.Lett.

      Volume: 15 Pages: 118-133

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient Soluble Protein Production on Transgenic Silkworms Expressing Cytoplasmic Chaperones using Baculovirus Expression System2010

    • Author(s)
      Hong, et al.
    • Journal Title

      Appl.Microbiol.Biotech.

      Volume: 87 Pages: 2147-2156

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glucuronyltransferase activity of KfiC from Escherichia coli strain K5 requires as sociation of KfiA : KfiC and KfiA are essential enzymes for production of K5 polysaccharide, N-acetylheparosan2010

    • Author(s)
      Sugiura, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 285 Pages: 1597-1606

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Repression of tyrosine hydroxylase is responsible for the sex-linked chocolate mutation of the silkworm, Bombyx mori2010

    • Author(s)
      Liu, et al.
    • Journal Title

      Proc.Nat.Acad.Sci.

      Volume: 107 Pages: 12980-12985

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A CD36-related transmembrane protein is coordinated with an intracellular lipid-binding protein in selective carotenoid transport for cocoon coloration2010

    • Author(s)
      Sakudoh, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 285 Pages: 7739-7751

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Yellow-e determines the color pattern of larval head and tail spots of the silkworm Bombyx mori2010

    • Author(s)
      Ito, et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 285 Pages: 5624-5629

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification and Expression Pattern Analysis of Polycomb Group Genes in the Silkworm, Bombyx mori.2010

    • Author(s)
      Li, et al.
    • Organizer
      日本分子生物学会本会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] Silkworm Argonaute2 homolog is involved in exso-siRNA and endo-siRNA pathway2010

    • Author(s)
      Masaki, et al.
    • Organizer
      日本分子生物学会本会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] Chromatin structure and function of silkworm holocentric chromosomes2010

    • Author(s)
      Kusakabe, et al.
    • Organizer
      New Silk Road : Silkworm Genome to Sustainable Agriculture
    • Place of Presentation
      Tsukuba, Japan
    • Year and Date
      2010-11-09
  • [Presentation] カイコにおけるDNA損傷修復機構ファンコニ経路の解析2010

    • Author(s)
      管原, ら
    • Organizer
      日本分子生物学会本会
    • Place of Presentation
      長野
    • Year and Date
      2010-04-03

URL: 

Published: 2012-07-19  

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