2010 Fiscal Year Annual Research Report
カキの甘渋性決定遺伝子の単離とその機能解析によるタンニン蓄積制御機構の解明
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22380023
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
米森 敬三 京都大学, 農学研究科, 教授 (10111949)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 明彦 果樹研究所, ブドウ・カキ研究チーム, 上席研究員 (30355440)
山根 久代 京都大学, 農学研究科, 助教 (80335306)
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| Keywords | 園芸学 / ゲノム / 遺伝子 / 植物 / プロアントシアニジン / タンニン |
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| Research Abstract |
日本のカキの甘渋性を決定する遺伝子(AST遺伝子)の単離を目的として、六倍体のカキ(Diospyros kaki)の二倍体近縁野生種マメガキ(D.lotus)から作製したフォスミド・ライブラリーを用い、AST遺伝子に非常に強く連鎖しているマーカー領域をプローブとしてシードクローンを単離後、そのエンドシークエンスを利用して構築したコンティグ内の塩基配列からいくつかのプライマーを作製した。次に、それらのプライマーによるカキ交雑集団約300個体での甘渋性識別の有効性を確認するとともに、その組換え価を調査することで、マメガキのコンティグ上でのAST遺伝子座の同定を試み、その遺伝子座領域をファオスミドコンティグ内で大まかに特定することが出来た。さらに、AST遺伝子単離のために、ファオスミドクローンより有効であると考えられるBACクローンによるコンティグを作製することを目指し、マメガキのBACライブラリーを作製した。
一方、これまで見出した中国の完全甘ガキ'羅田甜柿'の甘渋性を決定する遺伝子(CPCNA遺伝子)に強く連鎖するAFLPマーカー領域を利用して、二倍体の近縁野生種マメガキのゲノミックライブラリーからCPCNA遺伝子が座乗すると思われる領域と相同性をもつクローンを単離することが可能かどうかを検討した。その結果、AFLPマーカー領域のシークエンスがマメガキにも存在することをPCR分析とその増幅産物のシークエンス解析から確認でき、AFLP領域をプローブとして、フォスミドおよびBACライブラリーからクローンを単離することが可能であることが明らかとなった。今後、フォスミドおよびBACのゲノミックライブラリーをスクリーニングし、マメガキのコンティグを作製することで、'羅田甜柿'のCPCNA遺伝子が座乗すると思われる領域と相同性をもつ領域を同定していくこととした。
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