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2013 Fiscal Year Annual Research Report

放線菌の「休眠遺伝子」覚醒技術の確立と機能解析

Research Project

Project/Area Number 22380055
Research InstitutionHiroshima Institute of Technology

Principal Investigator

越智 幸三  広島工業大学, その他部局等, 教授 (70353985)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2014-03-31
Keywords微生物遺伝 / 微生物育種 / 休眠遺伝子 / 放線菌 / RNAポリメラーゼ
Research Abstract

最終年度であるため、最終目標の達成に向けて「変異型RNAポリメラーゼの利用」、「天然の変異型RNAポリメラーゼ遺伝子の利用」、「希土類元素の利用」の三つの切り口から研究を遂行した。これらの成果は、今年度J.Bacteriol.など7つの国際的有力誌に掲載の運びとなった。
1.変異型RNAポリメラーゼの利用:昨年度は特定のrpoB変異(H437Yなど)が休眠遺伝子覚醒に極めて有効であることを示した。一方、二次代謝の活性化はいわゆる「引き金」の強さのみに依存するのではなく、それに続く「生合成」が大きく関わってくる。すなわち、転写と生合成は車の両輪として働くので、理論的には転写が活性化されたRNAポリメラーゼ変異株では、生合成の活性化つまり基質供給は著しい効果を示すはずである。この概念を実証するため、緒々の抗生物質を生産する各種放線菌に、アセチルCoA利用阻害剤(ポリケチド抗生物質の場合)またはタンパク質合成阻害剤(ペプチド抗生物質の場合)を添加して培養した。予期したとおり、大半のケースで抗生物質の顕著な増大がみられた。このようにして「転写・生合成相乗効果」を実証し、微生物育種に新たな概念を構築した。
2.天然の変異型RNAポリメラーゼの利用:これまでに収集した天然の変異型rpoB遺伝子保有放線菌を培養し、目下単離・構造決定を遂行している。26年度中には新規物質発見に関する報告ができると思われる。
3.希土類元素の利用:前年度の成果を継続し、本年度は使用する希土類元素の最適濃度、その作用メカニズムについて検討した。S.griseusによるストレプトマイシン生産系においては、スカンジウムおよびランタンのいずれにおいても最適濃度は0.2-1mMであることを明らかにした。またこの生産力増強は生合成遺伝子の転写レベル上昇によるものであることをリアルタイムPCRを用いて明らかにした。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] The mthA mutation conferring low-level resistance to streptomycin enhances antibiotic priduction in Bacillus subtilis by increasing the s-adenosylmethionine pool size.2014

    • Author(s)
      Tojo, S., Ji-Y. Kim., Y. Tanaka., T. Inaoka., Y. Hiraga, and K. ochi.
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 196 Pages: 1514-1524

    • DOI

      10.1128/JB.01441-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activating the expression of bacterial cryptic gene by rpoB mutations in RNA polymerase or by rare earth elements.2014

    • Author(s)
      Ochi, K., Y. Tanaka, and S. Tojo.
    • Journal Title

      J. Ind. Microbiol. Biotechnol.

      Volume: 41 Pages: 403-414

    • DOI

      10.1007/s10295-013-1349-4.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chromosomal circularization of the model Streptomyces species, Streptomyces coelicolor A(3).2013

    • Author(s)
      Nindita, Y., T. Nishikawa, K. Arakawa, G. Wang, K. Ochi, Z. Qin, and H. Kinashi.
    • Journal Title

      FEMS Microbiol. Lett.

      Volume: 347 Pages: 149-155

    • DOI

      10.1111/1574-6968

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and biosynthesis of scabichelin, a novel tris-hydroxamate siderophore produced by the plant pathogen Streptomyces scabies 87.22.2013

    • Author(s)
      Kodani, S., J. Bicz, L. Song, RJ. Deeth, M. Ohnishi-Kameyama, M. Yoshida, K. Ochi, and GL. Challis.
    • Journal Title

      Org. Biomol. Chem.

      Volume: 11 Pages: 4686-4694

    • DOI

      10.1039/c3ob40536b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Activation and product of the cryptic secondary metabolite biosynthetic gene clusters by rifampin resistance (rpoB) mutations in actinomycetes.2013

    • Author(s)
      Tanaka, Y., K. Kasahara, Y. Hirose, K. Murakami, R. Kugimiya, and K. Ochi.
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 195 Pages: 2959-2970

    • DOI

      10.1128/JB.00147-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] rRNA(rnn)operon-engineered Bacillus subtilis as a feasible test organism for antibiotic discovery.2013

    • Author(s)
      Tanaka, Y., H. Nanamiya, K. Yano, K. Kakugawa, F. Kawamura, and K. Ochi.
    • Journal Title

      Antimicrob. Agents Chemother.

      Volume: 57 Pages: 1948-1951

    • DOI

      10.1128/AAC.02604-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] New strategies for drug discovery: activation of silent or weakly expressed microbial gene clusters.2013

    • Author(s)
      Ochi, K., and T. Hosaka.
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol.

      Volume: 97 Pages: 87-98

    • DOI

      10.1007/s00253-012-4551-9

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 休眠遺伝子覚醒技術の構築とその活用2013

    • Author(s)
      越智幸三
    • Organizer
      バイオインダストリー協会「育種の最前線」
    • Place of Presentation
      メルパルク広島
    • Year and Date
      2013-12-07
    • Invited
  • [Presentation] 休眠遺伝子とその活用2013

    • Author(s)
      越智幸三
    • Organizer
      韓国農芸化学会
    • Place of Presentation
      韓国プサン
    • Year and Date
      2013-06-26
  • [Presentation] リンコマイシンによるStreptomyces属放線菌の潜在的抗生物質生産能の活性化

    • Author(s)
      今井優 佐藤誠造 田中幸徳 越智幸三 保坂毅
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京・明治大学生田キャンパス
  • [Presentation] ハイグロマイシンBの活用による紅麹菌の潜在的二次代謝活性化

    • Author(s)
      水上智也 越智幸三 保坂毅
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京・明治大学生田キャンパス
  • [Presentation] 亜致死濃度のリンコマイシンが放線菌の二次代謝に及ぼす影響

    • Author(s)
      今井優 越智幸三 保坂毅
    • Organizer
      日本放線菌学会
    • Place of Presentation
      メルパルク広島
  • [Presentation] rRNA(rrn)オペロン改変枯草菌を被検菌とした新規RNAポリメラーゼ攻撃性抗生物質探索法の開発

    • Author(s)
      田中幸徳 河村富士夫 越智幸三
    • Organizer
      日本放線菌学会
    • Place of Presentation
      メルパルク広島
  • [Presentation] 抗生物質生産能力が向上したStreptomyces coelicolor A3(2)のrpsLK88E変異株におけるシグマ因子遺伝子の発現プロファイル解析

    • Author(s)
      藤澤知弘 岩川千紘 越智幸三 保坂毅
    • Organizer
      日本放線菌学会
    • Place of Presentation
      メルパルク広島
  • [Presentation] Acivation of silent genes in bacteria

    • Author(s)
      越智幸三
    • Organizer
      米国化学会
    • Place of Presentation
      ニューオリンズ
    • Invited

URL: 

Published: 2015-05-28  

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