日本人集団における膠原病関連遺伝子の包括的同定とゲノム医療への展開

2010 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 22390199
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 土屋 尚之 筑波大学, 大学院・人間総合科学研究科, 教授 (60231437)
• Keywords: 全身性エリテマトーデス / 全身性強皮症 / 関節リウマチ / 遺伝子多型 / 疾患感受性遺伝子 / SPI1 / BLK / miRNA

Research Abstract

1.SPI1と全身性エリテマトーデス(SLE)との関連
I型インターフェロンパスウェイ関連遺伝子であるSPI1を候補遺伝子として、SLEとの関連を検討し、3'非翻訳領域に位置する単一塩基多型(SNP)rs1057233との関連を見いだした。リスクアリルではSPI1の発現が上昇し、その機序として、リスクアリルがmiRNAのターゲット配列を置換することである可能性が想定され、リポーターアッセイにより、その仮説が実験的に支持された。
2.BLKを含む8p23.1領域における複数の遺伝因子の存在
研究代表者らは、これまでに、日本人集団におけるBLK近傍SNP rs13277113が、SLE、関節リウマチ(RA)、全身性強皮症(SSc)に共通に関連することを報告してきた。ヨーロッパ系集団では、同様に8p23.1領域に位置するXKR6,C8orf12との関連も報告されていることから、連鎖不平衡ブロックの異なる日本人集団において、本領域に複数の遺伝因子が存在するのか、一個所の原因的多型との連鎖不平衡でこれらの関連を説明しうるのかを検討した。
33個所のSNPの関連研究の結果、SLE,RA,SScのいずれにおいても、rs13277113のほかに、MTMR9-C8orf12領域に有意な関連が検出され、これら2領域は独立に関連することが示された。一方、XKR6のSNPには、日本人集団においては関連が検出されなかった。ヨーロッパ系集団ではXKR6領域とBLK領域には強い連鎖不平衡が観察された一方、日本人集団では連鎖不平衡がみられなかったことから、ヨーロッパ系集団におけるXKR6の関連は、BLKとの連鎖不平衡により説明しうると考えられた。
以上の結果、日本人集団には、8p23.1領域に、BLK周辺、C8orf12周辺の少なくとも2個所の独立した自己免疫疾患感受性アリルが存在することが明らかになった。

Research Products

• [Journal Article] The impact of natural selection on an ABCC11 SNP determining earwax (2011)
  • Author(s): Ohashi J, Naka I, Tsuchiya N.
  • Journal Title: Mol Biol Evol Volume: 28 Pages: 849-857
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] TLR7 SNPs in the 3 untranslated region and intron independentlycontribute to systemic lupus erythematosus in Japanese women : a case-control association study. (2011)
  • Author(s): Kawasaki A, Furukawa H, Kondo Y, Ito S, Hayashi T, Kusaoi M, Matsumoto I, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
  • Journal Title: Arthritis Res Ther
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Replication of association between FAM167A(C8orf13)-BLKregion and rheumatoid arthritis in a Japanese population. (2010)
  • Author(s): Ito I, Kawasaki A, Ito S, Kondo Y, Sugihara M, Horikoshi M, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Tsutsumi A, Takasaki Y, Hashimoto H, Matsuta K, Sumida, T, Tsuchiya N.
  • Journal Title: Ann Rheum Dis Volume: 69 Pages: 936-937
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Association of TNFAIP3 polymorphism with susceptibility to systemic lupus erythematosus in a Japanese population. (2010)
  • Author(s): Kawasaki A, Ito I, Ito S, Hayashi, T, Goto D, Matsumoto I, Takasaki, Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
  • Journal Title: J Biomed Biotechnol Pages: doi:10.1155/20
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Sex-specific association of X-linked Toll-like receptor 7 (TLR7) with male systemic lupus erythematosus. (2010)
  • Author(s): Shen N, Fu Q, Deng Y, Qian X, Zhao J, Kaufman KM, Wu YL, YuCY, Tang Y, Chen J-Y, Yang W, Wong M, Kawasaki A, Tsuchiya N, Sumida T, Kawaguchi Y, Howe HS, Mok MY, Bang S-Y, Liu F-L, Chang D-M, Takasaki Y, Hashimoto H, Harley JB, Guthridge JM, Grossman JM, Cantor RM, Song YW, Bae S-C, Chen S, Hahn BH, Lau YL, Tsao BP.
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci USA Volume: 107 Pages: 15838-15843
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Association of TNFAIP3 interacting protein 1, TNIP1 with systemic lupus erythematosus in a Japanese population : a case-control association study. (2010)
  • Author(s): Kawasaki A, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Kusaoi M, Ohashi J, Graham RR, Matsuta K, Behrens TW, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, SumidaT, Tsuchiya N.
  • Journal Title: Arthritis Res Ther Volume: 12 Pages: R174
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Association of a functional polymorphism in the 3 untranslated region of SPII with systemic lupus erythematosus. (2010)
  • Author(s): Hikami K, Kawasaki A, Ito I, KogaM, Ito S, Hayashi T, Matsumoto I, Tsutsumi A, Kusaoi M, Takasaki Y, Hashimoto H, Arinami T, Sumida T, Tsuchiya N.
  • Journal Title: Arthritis Rheum Volume: 63 Pages: 755-763
  • Peer Reviewed
• [Presentation] The VNTR polymorphism of the dopamine D4 receptor(DRD4)gene in Oceanic populations. (2010)
  • Author(s): Naka I, Nishida N, Kimura R, Furusawa T, Natsuhara, Yamauchi T, Nakazawa M, Ataka Y, Ishida T, Inaoka T, Matsumura Y, Ohtsuka R, Tsuchiya N, Ohashi J.
  • Organizer: The American Society of Human Genetics 60thAnnual Meeting
  • Place of Presentation: ワシントンコンベンションセンター(ワシントンDC, アメリカ合衆国)
  • Year and Date: 20101102-20101106
• [Presentation] Estimation of selection intensity of an ABCCII SNP determining earwax type. (2010)
  • Author(s): Ohashi J, Naka I, Tsuchiya N.
  • Organizer: The American Society of Human Genetics 60th Annual Meeting
  • Place of Presentation: ワシントンコンベンションセンター(ワシントンDC, アメリカ合衆国)
  • Year and Date: 20101102-20101106
• [Presentation] 全身性エリテマトーデス関連遺伝子APRIL(Z矧即13)多型と選択的スプライシングが可溶型分子の分泌に与える影響 (2010)
  • Author(s): 古谷匠、古賀農人、氷上光輝、川崎綾、土屋尚之
  • Organizer: 第55回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: 大宮ソニックシティ(埼玉県)
  • Year and Date: 20101027-20101030
• [Presentation] 全身性エリテマトーデス抵抗性APRIL(Zmm即13)ハプロタイプおよびβアイソフォームにおける可溶型APRILの減少. (2010)
  • Author(s): 古谷匠、古賀農人、氷上光輝、川崎綾、土屋尚之
  • Organizer: 第19回日本組織適合性学会
  • Place of Presentation: 東京大学(東京都)
  • Year and Date: 20100917-20100919
• [Presentation] Association of TNFAIP3 and TNIP1 SNPs with systemic lupus erythematosus in a Japanese population. (2010)
  • Author(s): Kawasaki A, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Graham RR, Behrens TW, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
  • Organizer: 9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
  • Place of Presentation: バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
  • Year and Date: 20100624-20100627
• [Presentation] An association study of 8p23.1 region encoding BLK, FAM167A, C8orf12 and XKR6with systemic lupus erythematosus in Japanese. (2010)
  • Author(s): Ito I, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Takasaki Y, Hashimoto H, Tohma S, Sumida T, Tsuchiya N.
  • Organizer: 9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
  • Place of Presentation: バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
  • Year and Date: 20100624-20100627
• [Presentation] Gender specific association of X-linked TLR7with male SLE. (2010)
  • Author(s): Shen N, Fu Q, Deng Y, Qian X, Zhao J, Kaufman KM, Tang Y, Chen J-Y, Yang W, Wong M, Kawasaki, A, Tsuchiya N, Sumida T, Kawaguchi, Y, Yu CY, Howe HS, Mok MY, Bang S-Y, Liu F-L, Chang D-M, Takasaki Y, Hashimoto H, Harley, JB, .Guthridge, JM., Grossman JM, Cantor RM, Song YW, Bae, S-C, Chen S-L, Hahn BH, Lau YL
  • Organizer: 9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
  • Place of Presentation: バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
  • Year and Date: 20100624-20100627
• [Presentation] 日本人集団におけるTLR7多型と全身性エリテマトーデスの関連 (2010)
  • Author(s): 川崎綾、伊藤聡、林太智、後藤大輔、松本功、高崎芳成、橋本博史、住田孝之、土屋尚之
  • Organizer: 第54回日本リウマチ学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 20100424-20100425
• [Presentation] 顕微鏡的多発血管炎とBLK領域多型の関連 (2010)
  • Author(s): 土屋尚之、伊東郁恵、小林茂人、橋本博史
  • Organizer: 第54回日本リウマチ学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 20100422-20100425
• [Presentation] BLK近傍8p23.1に位置するXKR6, CSorf12と日本人全身性エリテマトーデスとの関連の検討 (2010)
  • Author(s): 伊東郁恵、川崎綾、伊藤聡、林太智、後藤大輔、松本功、高崎芳成、橋本博史、住田孝之、土屋尚之
  • Organizer: 第54回日本リウマチ学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 20100422-20100425
• [Presentation] 関節リウマチにおけるSTEAP4遺伝子多型とTNF阻害薬有効性との関連 (2010)
  • Author(s): 南礼子、松本功、川崎綾、伊東郁恵、田中陽子、井上明日香、林太智、後藤大輔、伊藤聡、土屋尚之、住田孝之
  • Organizer: 第54回日本リウマチ学会
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 20100422-20100425
• [Remarks]
  • URL: http://www.md.tsukuba.ac.jp/community-med/publicmd/GE/CCPOO4.html