2010 Fiscal Year Annual Research Report
日本人集団における膠原病関連遺伝子の包括的同定とゲノム医療への展開
Project/Area Number |
22390199
|
Research Institution | University of Tsukuba |
Principal Investigator |
土屋 尚之 筑波大学, 大学院・人間総合科学研究科, 教授 (60231437)
|
Keywords | 全身性エリテマトーデス / 全身性強皮症 / 関節リウマチ / 遺伝子多型 / 疾患感受性遺伝子 / SPI1 / BLK / miRNA |
Research Abstract |
1.SPI1と全身性エリテマトーデス(SLE)との関連 I型インターフェロンパスウェイ関連遺伝子であるSPI1を候補遺伝子として、SLEとの関連を検討し、3'非翻訳領域に位置する単一塩基多型(SNP)rs1057233との関連を見いだした。リスクアリルではSPI1の発現が上昇し、その機序として、リスクアリルがmiRNAのターゲット配列を置換することである可能性が想定され、リポーターアッセイにより、その仮説が実験的に支持された。 2.BLKを含む8p23.1領域における複数の遺伝因子の存在 研究代表者らは、これまでに、日本人集団におけるBLK近傍SNP rs13277113が、SLE、関節リウマチ(RA)、全身性強皮症(SSc)に共通に関連することを報告してきた。ヨーロッパ系集団では、同様に8p23.1領域に位置するXKR6,C8orf12との関連も報告されていることから、連鎖不平衡ブロックの異なる日本人集団において、本領域に複数の遺伝因子が存在するのか、一個所の原因的多型との連鎖不平衡でこれらの関連を説明しうるのかを検討した。 33個所のSNPの関連研究の結果、SLE,RA,SScのいずれにおいても、rs13277113のほかに、MTMR9-C8orf12領域に有意な関連が検出され、これら2領域は独立に関連することが示された。一方、XKR6のSNPには、日本人集団においては関連が検出されなかった。ヨーロッパ系集団ではXKR6領域とBLK領域には強い連鎖不平衡が観察された一方、日本人集団では連鎖不平衡がみられなかったことから、ヨーロッパ系集団におけるXKR6の関連は、BLKとの連鎖不平衡により説明しうると考えられた。 以上の結果、日本人集団には、8p23.1領域に、BLK周辺、C8orf12周辺の少なくとも2個所の独立した自己免疫疾患感受性アリルが存在することが明らかになった。
|
-
-
[Journal Article] TLR7 SNPs in the 3 untranslated region and intron independentlycontribute to systemic lupus erythematosus in Japanese women : a case-control association study.2011
Author(s)
Kawasaki A, Furukawa H, Kondo Y, Ito S, Hayashi T, Kusaoi M, Matsumoto I, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
-
Journal Title
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Replication of association between FAM167A(C8orf13)-BLKregion and rheumatoid arthritis in a Japanese population.2010
Author(s)
Ito I, Kawasaki A, Ito S, Kondo Y, Sugihara M, Horikoshi M, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Tsutsumi A, Takasaki Y, Hashimoto H, Matsuta K, Sumida, T, Tsuchiya N.
-
Journal Title
Ann Rheum Dis
Volume: 69
Pages: 936-937
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Association of TNFAIP3 polymorphism with susceptibility to systemic lupus erythematosus in a Japanese population.2010
Author(s)
Kawasaki A, Ito I, Ito S, Hayashi, T, Goto D, Matsumoto I, Takasaki, Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
-
Journal Title
J Biomed Biotechnol
Pages: doi:10.1155/20
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Sex-specific association of X-linked Toll-like receptor 7 (TLR7) with male systemic lupus erythematosus.2010
Author(s)
Shen N, Fu Q, Deng Y, Qian X, Zhao J, Kaufman KM, Wu YL, YuCY, Tang Y, Chen J-Y, Yang W, Wong M, Kawasaki A, Tsuchiya N, Sumida T, Kawaguchi Y, Howe HS, Mok MY, Bang S-Y, Liu F-L, Chang D-M, Takasaki Y, Hashimoto H, Harley JB, Guthridge JM, Grossman JM, Cantor RM, Song YW, Bae S-C, Chen S, Hahn BH, Lau YL, Tsao BP.
-
Journal Title
Proc Natl Acad Sci USA
Volume: 107
Pages: 15838-15843
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Association of TNFAIP3 interacting protein 1, TNIP1 with systemic lupus erythematosus in a Japanese population : a case-control association study.2010
Author(s)
Kawasaki A, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Kusaoi M, Ohashi J, Graham RR, Matsuta K, Behrens TW, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, SumidaT, Tsuchiya N.
-
Journal Title
Arthritis Res Ther
Volume: 12
Pages: R174
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Association of a functional polymorphism in the 3 untranslated region of SPII with systemic lupus erythematosus.2010
Author(s)
Hikami K, Kawasaki A, Ito I, KogaM, Ito S, Hayashi T, Matsumoto I, Tsutsumi A, Kusaoi M, Takasaki Y, Hashimoto H, Arinami T, Sumida T, Tsuchiya N.
-
Journal Title
Arthritis Rheum
Volume: 63
Pages: 755-763
Peer Reviewed
-
[Presentation] The VNTR polymorphism of the dopamine D4 receptor(DRD4)gene in Oceanic populations.2010
Author(s)
Naka I, Nishida N, Kimura R, Furusawa T, Natsuhara, Yamauchi T, Nakazawa M, Ataka Y, Ishida T, Inaoka T, Matsumura Y, Ohtsuka R, Tsuchiya N, Ohashi J.
Organizer
The American Society of Human Genetics 60thAnnual Meeting
Place of Presentation
ワシントンコンベンションセンター(ワシントンDC, アメリカ合衆国)
Year and Date
20101102-20101106
-
-
-
-
[Presentation] Association of TNFAIP3 and TNIP1 SNPs with systemic lupus erythematosus in a Japanese population.2010
Author(s)
Kawasaki A, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Graham RR, Behrens TW, Tohma S, Takasaki Y, Hashimoto H, Sumida T, Tsuchiya N.
Organizer
9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
Place of Presentation
バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
Year and Date
20100624-20100627
-
[Presentation] An association study of 8p23.1 region encoding BLK, FAM167A, C8orf12 and XKR6with systemic lupus erythematosus in Japanese.2010
Author(s)
Ito I, Ito S, Furukawa H, Hayashi T, Goto D, Matsumoto I, Takasaki Y, Hashimoto H, Tohma S, Sumida T, Tsuchiya N.
Organizer
9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
Place of Presentation
バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
Year and Date
20100624-20100627
-
[Presentation] Gender specific association of X-linked TLR7with male SLE.2010
Author(s)
Shen N, Fu Q, Deng Y, Qian X, Zhao J, Kaufman KM, Tang Y, Chen J-Y, Yang W, Wong M, Kawasaki, A, Tsuchiya N, Sumida T, Kawaguchi, Y, Yu CY, Howe HS, Mok MY, Bang S-Y, Liu F-L, Chang D-M, Takasaki Y, Hashimoto H, Harley, JB, .Guthridge, JM., Grossman JM, Cantor RM, Song YW, Bae, S-C, Chen S-L, Hahn BH, Lau YL
Organizer
9th International Congress on Systemic Lupus Erythematosus
Place of Presentation
バンクーバーコンベンションセンター(バンクーバー、カナダ)
Year and Date
20100624-20100627
-
-
-
-
-