2010 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
22510209
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Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology |
Principal Investigator |
川島 武士 独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックスユニット, グループリーダー (10378531)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中島 啓介 独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (10422924)
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Keywords | 被嚢動物 / カタユウレイボヤ / ショートリード・シーケンサー / 遺伝子発現解析 / 被嚢細胞 |
Research Abstract |
初年度(2010年度)はホヤ被嚢細胞の採集とmRNAの回収。さらに新型DNA配列解読機による発現解析を行う予定であった。これについては予定より遅れている。被嚢細胞を採集し、mRNAを回収するところまでは簡単に行えるようになった。これは所属研究所内でのシーケンスサービスの順番待ちによるものである。ライブラリ作成からシーケンスにいたる一連の操作は、2012年の3月末には完成の予定である。かわりに2010年度と2011年度は、被嚢の光顕、電顕レベルでの観察や、配列取得後の情報処理用のデータベース作成に時間を割いた。被嚢の領域毎の繊維の密度の違いなどについて、既知データの確認などを行った。以上のように、基礎データの取得に時間を割いたために当初予定より遅れているが、配列データとその解析結果など重要なデータが2011年度中に、ひととおり揃う環境が整ったといえる。
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Research Products
(1 results)