Development of an artificial hyperthermophilic cellulase toward a hydrolysis of crystalline cellulose.

2012 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 22570128
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Structural biochemistry
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: UEGAKI Koichi 独立行政法人産業技術総合研究所, 健康工学研究部門, 研究グループ長 (00356544)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): NAKAMURA Tsutomu 産業技術総合研究所, 健康工学研究部門, 主任研究員 (10357668)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): IKEGAMI Takahisa 大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (20283939)
• Project Period (FY): 2010 – 2012
• Keywords: タンパク質

Research Abstract

The artificial hyperthermophilic cellulase was created by adding a hyperthermophilic carbohydrate-binding module (CBM) of chitinase from P. furiosus to the C-terminal region of hyperthermophilic cellulase of P. horikoshii. In this project, the effect of l

Research Products

• [Journal Article] 遺伝子探索による耐熱性キチン分解酵素の開発 (2012)
  • Author(s): 峯昇平、中村努、上垣浩一
  • Journal Title: 化学と生物 Volume: 50巻 Pages: 702-703
  • URL: http://www.jsbba.or.jp/pub/journal_kasei/kasei_contents/vol50_10_2012.html
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Expression, refolding, and purification of active diacetylchitobiose deacetylase from Pyrococcus horikoshii (2012)
  • Author(s): Mine, S., Ikegami, T., Kawasaki, K., Nakamura, T., Uegaki, K
  • Journal Title: Protein Expr Purif Volume: Vol.84, No.2 Pages: 265-269
  • DOI: DOI:10.1016/j.pep.2012.06.002
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Crystal structure of the N-terminal domain of the yeast general corepressor Tup1p and its functional implications (2012)
  • Author(s): Matsumura, H., Kusaka, N., Nakamura, T., Tanaka, N., Sagegami, K., Uegaki, K.,Inoue, T., Mukai, Y
  • Journal Title: J. Biol. Chem Volume: Vol.287, No.32 Pages: 26528-26538
  • DOI: DOI:10.1074/jbc.M112.369652
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Characterization and crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophiles (2012)
  • Author(s): Nakamura, T, Kashima, Y, Mine, S, Oku,T, Uegaki, K
  • Journal Title: J.Biosci. Bioeng Volume: Vol.114, No 2 Pages: 150-154
  • DOI: DOI:10.1016/j.jbiosc.2012.03.018
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Intrinsic Nucleic Acid-Binding Activity of Chp1 Chromodomain Is Required for Heterochromatic Gene Silencing (2012)
  • Author(s): Ishida, M., Shimojo, H., Hayashi, A., Kawaguchi R, Ohtani Y, Uegaki K, NishimuraY., Nakayama, J.I
  • Journal Title: Mol.Cell Volume: Vol.47, No.2 Pages: 228-241
  • DOI: DOI:10.1016/j.molcel.2012.05.017
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Application of a water jet system to the pretreatment of cellulose (2011)
  • Author(s): Watanabe, Y., Kitamura, S., Kawasaki, K., Kato, T., Uegaki, K., Ogura, K., Ishikawa,K
  • Journal Title: Biopolymers Volume: Vol.95, No.12 Pages: 833-839
  • DOI: DOI:10.1002/bip.21686
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a putative glucokinase/hexokinase from Thermus thermophilus (2011)
  • Author(s): Nakamura, T., Kashima, Y., Mine, S., Oku,T., Uegaki, K
  • Journal Title: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun Volume: Vol.67, Pt. 12 Pages: 1559-1562
  • DOI: DOI:10.1107/S1744309111041145
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] N-terminal phosphorylation of HP1{alpha} promotes its chromatin binding (2011)
  • Author(s): Hiragami-Hamada, K., Shinmyozu, K., Hamada, D., Tatsu, Y., Uegaki, K., Fujiwar,a S., Nakayama, J.I
  • Journal Title: Mol Cell Biol Volume: Vol.31, No.6 Pages: 1186-1200
  • DOI: DOI:10.1128/MCB.01012-10
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus-the role of conserved residues in the active site (2010)
  • Author(s): Tsuji, H.,, Nishimura 、 S., Inui1T,, Kado, Y., Ishikawa, K., Nakamuram T.,Uegaki, K
  • Journal Title: FEBS J Volume: Vol.277, No.12 Pages: 2683-2695
  • DOI: DOI:10.1111/j.1742-464X.2010.07685.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Crystal structure of the cambialistic superoxide dismutase from Aeropyrum pernix K1--insights into the enzyme mechanism and stability
  • Author(s): Nakamura, T., Torikai, K., Uegaki, K., Morita, J., Machida, K., Suzuki, A., Kawata, Y
  • Journal Title: FEBS J Volume: Vol.278, No.4 Pages: 598-609
  • DOI: DOI:10.1111/j.1742-4658.2010.07977.x
  • Peer Reviewed
• [Presentation] プロテアーゼ活性検出のための Ready-to-Go 発光試薬の高度化 (2013)
  • Author(s): 星野英人、上垣浩一
  • Organizer: LS-BT 合同研究発表会
  • Place of Presentation: 産業技術総合研究所(茨城県)
  • Year and Date: 2013-02-05
• [Presentation] 嫌気性古細菌ペルオキシレドキシンの結晶化と構造解析 (2013)
  • Author(s): 中村努、新山真由美、森愛賀、森田潤司、上垣浩一
  • Organizer: LS-BT 合同研究発表会
  • Place of Presentation: 産業技術総合研究所(茨城県)
  • Year and Date: 2013-02-03
• [Presentation] 発光蛋白質のプロテアーゼ活性検出用 Ready-to-Go 試薬への応用 (2012)
  • Author(s): 星野英人、上垣浩一
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県)
  • Year and Date: 2012-12-14
• [Presentation] Comprehensive analysis of heat-induced irreversible denaturation of IgG, Fab, scFV and VHH (2012)
  • Author(s): 赤澤陽子、高島瑞紀、Young-Ho LEE、後藤祐児、上垣浩一、萩原義久
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場(福岡県)
  • Year and Date: 2012-12-14
• [Presentation] Crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophilus (2012)
  • Author(s): 中村 努、鹿島康浩、峯昇平、奥崇、上垣浩一
  • Organizer: AsCA12
  • Place of Presentation: アデレードコンベンションセンター(オーストラリア)
  • Year and Date: 2012-12-03
• [Presentation] 基質吸着ドメイン多重化による耐熱性人工セルラーゼ創製に関する研究 (2012)
  • Author(s): 上垣浩一、中村努、峯昇平、佐藤孝明、森田順司、峯昇平、松井由香里
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知県)
  • Year and Date: 2012-06-20
• [Presentation] 耐熱性 ROK ヘキソキナーゼの基質特異性と立体構造 (2012)
  • Author(s): 中村努、鹿島康浩、峯昇平、奥崇、上垣浩一
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知県)
  • Year and Date: 2012-06-20
• [Presentation] 発光蛋白質-バイオマス素材複合マテリアルの開発 (2012)
  • Author(s): 星野 英人、上垣浩一
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知県)
  • Year and Date: 2012-06-20
• [Presentation] 不溶性セルロース分解を目指した耐熱性人工セルラーゼ創製に関する研究 (2012)
  • Author(s): 上垣 浩一、中村 努、峯 昇平、佐藤 孝明、森田潤司、山野裕子
  • Organizer: 健康工学研究部門研究発表会
  • Place of Presentation: 産総研(大阪府)
  • Year and Date: 2012-02-22
• [Presentation] 古細菌 Cambialistic SOD の金属選択性と熱安定性 (2012)
  • Author(s): 中村 努、上垣浩一
  • Organizer: 健康工学研究部門研究発表会
  • Place of Presentation: 産総研(大阪府)
  • Year and Date: 2012-02-22
• [Presentation] 耐熱性 cambialistic SOD の立体構造と金属イオン選択性 (2012)
  • Author(s): 中村 努,鳥養香澄,上垣 浩一,森田潤司
  • Organizer: LS-BT 合同研究発表会
  • Place of Presentation: 産総研(茨城県)
  • Year and Date: 2012-02-01
• [Presentation] 機能性融合タンパク質材料の開発 (2012)
  • Author(s): 星野 英人、上垣浩一
  • Organizer: 第11回 LS-BT 合同研究発表会
  • Place of Presentation: 産総研(茨城県)
  • Year and Date: 2012-01-31
• [Presentation] Development of enzymes for biomass utilization (2011)
  • Author(s): 上垣 浩一
  • Organizer: 2nd International Symposium of Advanced Energy Science
  • Place of Presentation: 京都大学(京都)
  • Year and Date: 2011-09-27
• [Presentation] Crystal Structure of Archaeal Cambialistic Superoxide Dismutase (2011)
  • Author(s): 中村 努、鳥養香澄、森田潤司、河田 康志、上垣 浩一
  • Organizer: XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • Place of Presentation: Madrid(Spain)
  • Year and Date: 2011-08-27
• [Presentation] 極限微生物の蛋白質を用いたバイオマス利用 (2011)
  • Author(s): 上垣 浩一
  • Organizer: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ホテル阪急エキスポ(大阪府)
  • Year and Date: 2011-06-08
• [Presentation] 不溶性セルロース分解を目指した耐熱性人工セルラーゼ創製に関する研究 (2011)
  • Author(s): 上垣 浩一、中村 努、峯 昇平、佐藤 孝明、森田潤司、山野裕子
  • Organizer: 第11回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ホテル阪急エキスポ(大阪府)
  • Year and Date: 2011-06-07
• [Presentation] Aeropyrum pernix K1 由来 SOD の金属イオン配位構造 (2010)
  • Author(s): 中村 努,鳥養香澄,上垣 浩一,森田潤司
  • Organizer: 日本結晶学会 2010 年度年会
  • Place of Presentation: 大阪大学(大阪府)
  • Year and Date: 2010-12-05
• [Presentation] Aeropyrum pernix K1 由来 cambialistic SODの立体構造と金属選択性 (2010)
  • Author(s): 中村 努,鳥養香澄,上垣 浩一,森田潤司
  • Organizer: 第5回産業用酵素シンポジウム
  • Place of Presentation: 長浜バイオ大学(滋賀県)
  • Year and Date: 2010-11-06
• [Presentation] 超好熱菌 Pyrococcus furiosus由来キチナーゼが有するキチン結合ドメイン ChBD1 の構造解析 (2010)
  • Author(s): 峯 昇平、中村 努、石川 一彦、池上貴久、上垣 浩一
  • Place of Presentation: 長浜バイオ大学(滋賀県)
  • Year and Date: 2010-11-06
• [Presentation] 耐熱性アーケア(Pyrococcus furiosus)由来のキチン分解酵素の構造機能とその利用 (2010)
  • Author(s): 上垣 浩一
  • Organizer: 食品酵素化学研究会
  • Place of Presentation: 大阪府立大学
  • Year and Date: 2010-09-04
• [Presentation] 超好熱菌 Pyrococcus furiosus由来キチナーゼが有するキチン結合ドメイン ChBD1 の構造解析 (2010)
  • Author(s): 峯 昇平、中村 努、石川 一彦、池上貴久、上垣 浩一
  • Organizer: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター(北海道)
  • Year and Date: 2010-06-18
• [Presentation] Aeropyrum pernix K1由来スーパーオキシドディスムターゼの立体構造解析 (2010)
  • Author(s): 中村 努,鳥養香澄,上垣 浩一,森田潤司
  • Organizer: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター(北海道)
  • Year and Date: 2010-06-17