2011 Fiscal Year Annual Research Report
若年性骨髄単球性白血病と小児骨髄異形成症候群の網羅的ゲノム・エピゲノム解析
| Project/Area Number |
22591171
|
|---|
| Research Institution | Gunma Institute of Public Health and Environmental Sciences |
|---|
Principal Investigator |
外松 学 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (70251113)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
林 泰秀 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (30238133)
朴 明子 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50450375)
大木 健太郎 群馬県衛生環境研究所, 研究企画係, 研究員 (50400966)
|
|---|
| Keywords | 遺伝子 / ゲノム / マイクロアレイ / 癌 / 臨床 |
|---|
| Research Abstract |
Juvenile myelomonocytic leukemia(JMML)と小児myelodysplastic syndrome(MDS)に対して、AffymetrixとAgilentのゲノムとエピゲノムのアレイを用いた網羅的解析により候補遺伝子を抽出し、発症、進展に関与する遺伝子をみい出す。近年、成人の急性骨髄性白血病(AML)とMDSでadditional sex combs like 1(ASXL1)、isocitrate dehydrogenase (IDH1)、IDH2、DNAメチルトランスフェラーゼ3A(DNMT3A)遺伝子等の変異がみられ、予後と相関することが報告された。今年度は、polycomb関連遺伝子のASXL1遺伝子とDNAメチル化に関与するIDH1、IDH2、DNMT3A遺伝子についてJMML40例とMDS65例、AML20例でPCR法と直接塩基決定法にて変異の有無の解析を行った。JMML40例の検討では、ASXL1遺伝子変異は1例(2.5%)にみられ、この症例はPTPN11やRAS遺伝子の変異はみられず、ASXL1遺伝子はJMMLの原因遺伝子の1つであることが示唆された。ASXL1遺伝子変異はMDSではみられなかった。またJMMLとMDSにおけるIDH1、IDH2、DNMT3A遺伝子の変異はみられなかった。ASXL1遺伝子変異は成人のAMLとMDSでは約20%に変異がみられるが、小児MDSではまれであり、JMMLで1例だけ認められ、これまでの報告と合わせるとJMMLの一部の発症と進展に関与するものと思われた。小児AMLではASXL1、IDH1、DNMT3A遺伝子の変異はみられなかったが、1例にIDH2のR140Q変異がみられ、この症例は12歳男児でt(8;21)を有し、寛解に導入されたが再発し、死亡している。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
SNPアレイでスクリーニングした候補遺伝子を次々とSanger sequenceにより検証しており、特にDNAメチル化に関与する遺伝子の関係が明らかになりJMMLの病態解明に貢献している。
|
| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、最近成人のMDSで報告されたsplicingに関与する遺伝子(U2AF35、U2AF65、SF3A1、SF3B1、SRSF2、ZRSR2、SF1、PRPF40B等)につき検討する予定である。また一部の症例でエクソーム解析の準備を行う予定である。
|
-
-
[Journal Article] DNMT3A mutations are rare in childhood acute myeloid leukaemia, myelodysplastic syndromes and juvenile myelomonocytic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Taki T, Park MJ, Shimada A, Sotomatsu M, Adachi S, Tawa A, Horibe K, Tsuchida M, Hanada R, Tsukimoto I, Arakawa H, Hayashi Y
-
Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 413-414
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] CBL mutations in infant acute lymphoblastic leukaemia2012
Author(s)
Shiba N, Park MJ, Taki T, Takita J, Hiwatari M, Kanazawa T, Sotomatsu M, Ishii E, Arakawa H, Ogawa S, Hayashi Y
-
Journal Title
Br J Haematol
Volume: 156
Pages: 672-674
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
[Journal Article] Aberrations of NEGR1 on 1p31 and MYEOV on 11q13 in neuroblastoma2011
Author(s)
Takita J, Chen Y, Okubo J, Sanada M, Adachi M, Ohki K, Nishimura R, Hanada R, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S
-
Journal Title
Cancer Sci
Volume: 102
Pages: 1645-1650
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] IDH1 and IDH2 mutations are rare in pediatric myeloid malignancies2011
Author(s)
Oki K, Takita J, Hiwatari M, Nishimura R, Sanada M, Okubo J, Adachi M, Sotomatsu M, Kikuchi A, Igarashi T, Hayashi Y, Ogawa S
-
Journal Title
Leukemia
Volume: 25
Pages: 382-384
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
