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2011 Fiscal Year Annual Research Report

On-siteプロテオミクスによるIgA腎症・膜性腎症の抗原同定と発症機序解明

Research Project

Project/Area Number 22659165
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

許 波  新潟大学, 医歯学総合研究科, 研究員 (70463982)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 格  新潟大学, 医歯学系, 教授 (30092737)
張 エイ  新潟大学, 医歯学総合研究科, 研究員 (00529472)
KeywordsOn-siteプロテオミクス / IgA腎症 / 膜性腎症
Research Abstract

IgA腎症と膜性腎症は免疫複合体の形成などに深く関わっていると考えられているが、その抗原についてはまだ不明な点が多い状況である。本研究はこれらの腎症に関連する抗原を同定し、上記の腎症の発症機序を明らかにすることを目的とした。
我々は既にIgA腎症・膜性腎症の症例1平方ミリの糸球体サンプル(特にホルマリン固定標本)を当研究室で開発したOn-siteプロテオミクス法で解析を行った。正常群糸球体MS情報と病態糸球体MS情報を解析し、差異のあるペプチドMS情報を基にターゲットMS解析を行い、同定された一部タンパク質はIgA・膜性腎症群の病因抗原物質である可能性が高いと考えられていた。糸球体組織におけるこれらのタンパク質の抗体反応状況を確認した。更にMS情報網羅性を高めるために、最新鋭のOrbitrap-MS器機で正常とIgA腎症糸球体からそれぞれ抽出されたペプチドを測定した。これまでの単一標本MSデータより2-3倍の情報量を得た、今まで各群のMS情報を補正し、新たに候補リストを捧げました。より豊富な情報を得たことにより、これからバイオインフォマテクス解析や疾患パスウェ解析に介して、発現差異のあるタンパク質群はIgA・膜性腎症の発生機序への関わりを明らかにすることが期待できる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまで「研究目的」の最初段階、正常とIgA腎症及び膜性腎症群における発現差異のあるタンパク質リストがMSデータを解析による見出した。一部ですが、そのタンパク質の発現は抗体反応で確認はできました。Human protein
ATLASへの情報確認もできました。上記の進行状況が本研究はおおむね順調に進展していると判断した根拠である。

Strategy for Future Research Activity

これまで得たMSデータを更にNature
Biotechnologyに発表した同定されたタンパク質の量的な新しい解析方法(SIN)で比較解析を行い、正常群と疾患群にそれぞれのタンパク質発現が量的な差異状況を再確認すると同時にこれまでの疾患原因候補分子のパスウェ解析を行い、IgA腎症の抗原であるかどうかを確認実験や膜性腎症の病因分子であるかどうかを確かめることは今後の推進方策と考えています。

  • Research Products

    (8 results)

All 2011

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Comparison of human glomerulus proteomic profiles obtained from low quantities of samples by different mass spectrometry with the comprehensive database2011

    • Author(s)
      Zhang Y, Yoshida Y, Xu B, Magdeldin S, Fujinaka H, Liu Z, Miyamoto M, Yaoita E, Yamamoto T
    • Journal Title

      Proteome Sci

      Volume: 9 Pages: 47

    • DOI

      doi:10.1186/1477-5956-9-47

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Comparison of on-site proteomics study on laser microdissected FFPE and frozen human glomerulus tissues2011

    • Author(s)
      Xu B, Shimada S, Zhang Y, Yamamoto T
    • Organizer
      10th Annual World Congress of Human Proteome Organization (HUPO)
    • Place of Presentation
      Room K, Geneva Palexpo, Geneva, Switzerland
    • Year and Date
      2011-09-06
  • [Presentation] Proteome research of murine liver tissues of NASH model mouse2011

    • Author(s)
      Xu B, Zhang Y, Azlina E, Yamamoto T., et al
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
    • Year and Date
      2011-07-29
  • [Presentation] Proteomics results of small FFPE rat cortex tissues treated by 3 methods2011

    • Author(s)
      Xu B, Zhang Y, Yaoita E, Yamamot T
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
    • Year and Date
      2011-07-29
  • [Presentation] Preparation of sample for proteomics research2011

    • Author(s)
      Xu B, Yoshida Y, Yamamoto T
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Room 201, Toki Messe, Niigata(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Presentation] A VBA program for extracting keratin contamination from protecome analysis results2011

    • Author(s)
      Makiguchi T, Xu B, Yoshida Y, Yamamoto T
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Presentation] Processing tool works on data of identified proteins exported by ions search engine2011

    • Author(s)
      Ikoma T,Xu B, Yamamoto T
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Presentation] Proteomic mapping oT kidney and liver endotheliai cell surface proteins2011

    • Author(s)
      Liu Z, Xu B, Zhang Y, Yoshida Y, Yamamoto T
    • Organizer
      9th Japan Human Proteomics Organization (JHUPO) Confernce
    • Place of Presentation
      Snow Hall A, Toki Messe, Niigata, Japan
    • Year and Date
      2011-07-28

URL: 

Published: 2013-06-26  

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