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2010 Fiscal Year Annual Research Report

一細胞遺伝子発現解析のためのチッププラットフォームの構築

Research Project

Project/Area Number 22710122
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

斉藤 真人  大阪大学, 工学研究科, 助教 (80457001)

Keywordsマイクロ・ナノデバイス / マイクロバイオシステム
Research Abstract

単一の細胞や遺伝子情報の解析・評価を可能にするため、微細加工技術を用いて微小反応場を作製し、これに単一細胞を分離・配置し、PCR法などを組み込んだ一細胞・一分子DNAレベルの解析手法を開発・確立させ、単一細胞評価・診断への基盤技術へと発展させることを目的とする。本年度は、微細加工技術に基づいて2種のマイクロチャンバーアレイを作製した。1チャンバーのサイズは、650×650×250μmで、容量は50nLである。PCR酵素量、プライマー濃度、反応時間、温度などオンチップPCR諸条件の検討を行ったところ、従来の酵素量の10倍を添加することで効率よくDNA増幅が行えることがわかった。また、マイクロチャンバーへの一細胞配置を、ナノピンセットを用いたマニピュレーションにより行うことで可能であった。マイクロチャンバーへのPCR溶液の導入は、ナノリッターディスペンサーを用いることで迅速、正確、均一に導入できた。チャンバーチップ上にあらかじめミネラルオイルを積層しておくことで、ディスペンサーから吐出されたPCR溶液が、オイル層を貫通してチャンバー内に導入され、蒸発を防ぐこともできる。胎児由来有核赤血球をマイクロチャンバーに配置し、血液型判定に用いられる遺伝子マーカーのRhD DNAの増幅も可能であった。オンチップRT-PCRへの適用も想定し、条件検討を行った。その結果、逆転写酵素量1倍に対してPCR酵素量を10倍にすることで、RNAからのDNA増幅の計測が行えることがわかった。また、1ステップRT-PCRだけでなく、汎用的な2ステップRT-PCRを行えるよう、2段構造のマイクロチャンバーアレイも設計作製した。

  • Research Products

    (10 results)

All 2011 2010

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (2 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Rapid detection for primary screening of influenza A virus : microfluidic RT-PCR chip and electrochemical DNA sensor2011

    • Author(s)
      K.Yamanaka, M.Saito, K.Kondoh, M.M.Hossain, R.Koketsu, T.Sasaki, N.Nagatani, K.Ikuta, E.Tamiya
    • Journal Title

      Analyst

      Volume: (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multi-chamber pcr chip with simple liquid introduction utilizing the gas permeability of polydimethylesiloxane2010

    • Author(s)
      N. B. Trung, M. Saito, H. Takabayashi, P. H. Viet, E. Tamiya, Y. Takamura
    • Journal Title

      Sensors and Actuators B : Chemical

      Volume: 149(1) Pages: 284-290

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-invasive characterization of mouse embryonic stem cell derived cardiomyocytes based on the intensity variation in digital beating video2010

    • Author(s)
      Mohammad Mosharraf Hossain, Eiich i Shimizu, Masato Saito, Sathuluri Ramachandra Rao, Yoshinori Yamaguchi and Eiichi Tamiya
    • Journal Title

      Analyst

      Volume: 135 Pages: 1624-1630

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] プラズモニックナノアレイバイオチップと解析システムの開発2010

    • Author(s)
      遠藤達郎、栗田昌昭、金子努、齊藤真人、民谷栄一
    • Journal Title

      電気学会論文誌Sec.E

      Volume: 131(12)(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nanostructured biochip for label-free and real-time optical detection of polymerase chain reaction2010

    • Author(s)
      H.M.Hiep, K.Kerman, T.Endo, M.Saito, E.Tamiya
    • Journal Title

      Analytica Chimica Acta

      Volume: 661(1) Pages: 111-116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An optimal design method for preventing air bubbles in high-temperature microfluidic devices2010

    • Author(s)
      T.Nakayama, H.M.Hiep, S.Furui, Y.Yonezawa, M.Saito, Y.Takamura, E.Tamiya
    • Journal Title

      Anal Bioanal Chem

      Volume: 396(1) Pages: 457-464

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Development and optimization of the on chip microchamber array PCR and RT-PCR2010

    • Author(s)
      M.Saito, K.Hidari, Y.Yamaguchi, E.Tamiya
    • Organizer
      2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICCHEM 2010)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2010-12-18
  • [Presentation] Quantitative imaging for beating frequency of ES-derived cardiomyocyte2010

    • Author(s)
      E.Shimizu, M.Saito, Y.Yamaguchi, E.Tamiya
    • Organizer
      2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICCHEM 2010)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2010-12-18
  • [Book] 局在プラズモン共鳴バイオデバイス(第20章)、近接場光のセンシング・イメージング技術への応用-最新のバイオ・化学・デバイス分野への展開-(監修・民谷栄一、朝日剛)2010

    • Author(s)
      山中啓一郎、斉藤真人
    • Total Pages
      213-220
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] Sensors, Advances in biochemical engineering/biotechnology, Nano/Micro Biotechnology, 119 (eds.I.Endo, T.Nagamune)2010

    • Author(s)
      M.Saito, H.M.Hiep, N.Nagatani, E.Tamiya
    • Total Pages
      231-250
    • Publisher
      Springer, Berlin

URL: 

Published: 2012-07-19  

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