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2010 Fiscal Year Annual Research Report

真正粘菌変形体にみられる遷移ダイナミクスに対する数理モデルの作成とその数理解析

Research Project

Project/Area Number 22740064
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

上田 肇一  京都大学, 数理解析研究所, 助教 (00378960)

Keywords数理モデル / 真正粘菌変形体 / 細胞運動 / 環境適応性 / 遷移ダイナミクス / 反応拡散系
Research Abstract

真正粘菌変形体は単細胞生物であり、脳のような高次機能を持たないにもかかわらず、餌のある場所に集まり、忌避物質に接した際にはその場所から離れるといった適応的な振る舞いを示すことが知られている。しかしながら、そのような環境適応性に対する数理的な理解に至っていないのが現状である。本研究の目的は、収縮弛緩運動と伸展運動によって発生する遷移ダイナミクスの数理的機構を解明するために解析手法を開発し、真正粘菌にみられる遷移ダイナミクスの発生機構を明らかにすることによって、環境適応的な振る舞いを可能にする数理的機構を明らかにすることである。本年度は真正粘菌の移動運動およびパターンダイナミクスに関する数理解析を行った。収縮弛緩運動とゾルを相互作用させた数理モデルの作成、および数値シミュレーションを行い、生物実験結果との比較を行った。移動運動の再現においては細胞先端部で起きる化学反応を考慮に入れることによって忌避物質に接した時に示す遷移ダイナミクスを定性的に再現することに成功した。この結果から、細胞先端部における化学反応の活性化が移動運動において重要であることを示すことができた。さらに、その数理モデルを改良することによって定在波、およびスパイラルパターンを再現する数理モデルの構築を試みた。定在波の再現において収縮弛緩運動にかかわる化学反応が有する非線形性が重要であることが数値シミュレーションによって明らかになった。

  • Research Products

    (7 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Pinned fronts in heterogeneous media of jump type2011

    • Author(s)
      Peter van Heijster, Arjen Doelman, Tasso J Kaper, Yasumasa Nishiura and Kei-Ichi Ueda
    • Journal Title

      Nonlinearity

      Volume: 24 Pages: 127-157

    • DOI

      DOI:10.1088/0951-7715/24/1/007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mathematical model for contemplative amoeboid locomotion2011

    • Author(s)
      Kei-Ichi Ueda
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 83 Pages: 021916-1-021916-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Numerical approach to transient dynamics of oscillatory pulses in a bistable reaction-diffusion system2010

    • Author(s)
      Masaharu Nagayama, Kei-ichi Ueda and Masaaki Yadome
    • Journal Title

      Japan Journal of Industrial and Applied Mathematics

      Volume: 27 Pages: 295-322

    • DOI

      DOI:10.1007/s13160-010-0015-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chaotic motion of propagating pulses in the Gray-Scott model

    • Author(s)
      Masaaki Yadome
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: (掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 真正粘菌変形体にみられる外部刺激に対する情報処理2010

    • Author(s)
      上田肇一
    • Organizer
      2010年度応用数学合同研究集会
    • Place of Presentation
      龍谷大学
    • Year and Date
      2010-12-18
  • [Presentation] Behavior of a true slime mold crossing an environmental barrier2010

    • Author(s)
      Kei-Ichi Ueda
    • Organizer
      Statistical Physics and Biology of Collective Motion, International Workshop
    • Place of Presentation
      Max-Planck-Institut fur Physik komplexer Systeme, Dresden, Germany
    • Year and Date
      2010-11-08
  • [Presentation] 真正粘菌変形体にみられる環境適応性2010

    • Author(s)
      上田肇一
    • Organizer
      応用数理学会
    • Place of Presentation
      明治大学
    • Year and Date
      2010-09-08

URL: 

Published: 2012-07-19  

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