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2012 Fiscal Year Final Research Report

High-throughput analysis and engineering of fungi transcription factor binding sequences.

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 22760605
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biofunction/Bioprocess
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

KOJIMA Takaaki  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (40509080)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Keywords転写因子 / プロモーター活性 / エマルジョンPCR / 糸状菌 / ハイスループットスクリーニング
Research Abstract

Bead display is a novel library construction method in which clonal DNA moleculesare displayed on a large population of microbeads. Comprehensive analysis of DNA binding regions of a fungal transcription factor, AmyR, was carried out with a random DNA library or A. nidulans genome library by using bead display. As the results, the extraction of AmyR binding motifs and the selection of various binding sites of AmyR were observed. In addition, a high-throughput screening method for promoter activity was developed by using bead display and a ligase ribozyme

  • Research Products

    (19 results)

All 2012 2011 2010

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (17 results)

  • [Journal Article] High-throughput screening method for promoter activity using bead display and a ligase ribozyme2012

    • Author(s)
      Kojima, T., Ohuchi, S., Ito, Y., Nakano, H.
    • Journal Title

      J. Biosci Bioeng.

      Volume: 114 Pages: 671-676

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiosc.2012.06.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comprehensive Analysis of the DNA-Binding Specificity of an Aspergillus nidulans Transcription Factor, AmyR, by using a Bead Display System2011

    • Author(s)
      Wang, P., Kojima, T., Kobayashi, T., and Nakano, H
    • Journal Title

      Biotechnol. Biochem

      Volume: 76 Pages: 1128-1134

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1271/bbb.110949

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法を用いたin vitroプロモーターハイスループットスクリーニング法の確立2012

    • Author(s)
      伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • Organizer
      日本農芸化学会中部支部第165回例会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20121000
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用検出システム2012

    • Author(s)
      江崎俊文、王ハン輝、兒島孝明、中野秀雄
    • Organizer
      日本農芸化学会中部支部第165回例会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20121000
  • [Presentation] Comprehensive analysis of transcription factor binding site using bead display of DNA2012

    • Author(s)
      Nakano, H.,Wang, P.W. and Kojima, T
    • Organizer
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • Place of Presentation
      Kanazawa
    • Year and Date
      20120500
  • [Presentation] In vitro high-throughput promoter screening system using a bead display and a class I ligase ribozyme2012

    • Author(s)
      Ito, Y., Kojima, T., Ohuchi, S. and Nakano, H
    • Organizer
      The 12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • Place of Presentation
      Kanazawa
    • Year and Date
      20120500
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法とクラスI リガーゼ・リボザイムを用いたハイスループットなin vitro スクリーニング法の確立2012

    • Author(s)
      伊藤祐里恵、兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • Organizer
      日本農芸化学会2012大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120300
  • [Presentation] ビーズディスプレイを用いたDNA-転写因子相互作用検出システムに関する研究2012

    • Author(s)
      王ハン暉、兒島孝明、中野秀雄
    • Organizer
      日本農芸化学会2012大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120300
  • [Presentation] エマルジョンPCRを用いた分子間相互作用ハイスループットスクリーニング系2011

    • Author(s)
      中野秀雄、兒島孝明
    • Organizer
      平成23年度生物工学技術セミナー企画
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20111100
  • [Presentation] Novel screening method for promoter activity using a bead display and a ligase ribozyme2011

    • Author(s)
      Kojima, T., Ito, Y., Ohuchi, S. and Nakano, H.
    • Organizer
      第5回GCOEリトリート
    • Place of Presentation
      長浜
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] Detections of DNA-Transcription Factor Interactions using a Microbeads Display System2011

    • Author(s)
      Wang, P., Kojima, T. and Nakano, H
    • Organizer
      第5回GCOEリトリート
    • Place of Presentation
      長浜
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法とクラスIリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitroハイスループットスクリーニング2011

    • Author(s)
      兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • Organizer
      日本生物工学会2011年63回大会
    • Place of Presentation
      小金井
    • Year and Date
      20110900
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性in vitro 選別法2011

    • Author(s)
      兒島孝明、伊藤祐里恵、大内将司、中野秀雄
    • Organizer
      生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー2011
    • Place of Presentation
      笛吹
    • Year and Date
      20110700
  • [Presentation] DNAのビーズディスプレイ法を用いたDNA-糸状菌転写因子相互作用のハイスループット検出法2011

    • Author(s)
      王 ハン輝、児島 孝明、中野 秀雄
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都→震災の為発表中止
    • Year and Date
      20110300
  • [Presentation] Beads display:A Novel High-throughput Screening Technology to Explore Functional Biomolecules2010

    • Author(s)
      Kojima, T. and Nakano, H
    • Organizer
      The Eleventh China-Japan-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • Place of Presentation
      Chengdu, China
    • Year and Date
      20101100
  • [Presentation] 無細胞蛋白質合成系を用いた1分子・1細胞由来mRNAの解析技術。2010

    • Author(s)
      中野秀雄、兒島孝明
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      20101000
  • [Presentation] ビーズディスプレイ法とリガーゼ・リボザイムを用いたプロモーター活性選別法の開発2010

    • Author(s)
      兒島孝明、大内将司、中野秀雄
    • Organizer
      日本生物工学会2010年62回大会
    • Place of Presentation
      宮崎
    • Year and Date
      20101000
  • [Presentation] High-throughput Screening of DNA Binding Sites for Fungus Transcription Factor, AmyR, Using Beads Display System of DNA2010

    • Author(s)
      Kojima, T., Hashimoto, Y., Kato, M., Kobayashi, T. and Nakano, H
    • Organizer
      グローバルCOE第4回リトリート
    • Place of Presentation
      豊橋
    • Year and Date
      20100900
  • [Presentation] etections of DNA-transcription factor interactions using a Microbeads Display System2010

    • Author(s)
      Wang, P., Kojima T. and Nakano, H
    • Organizer
      グローバルCOE第4回リトリート
    • Place of Presentation
      豊橋
    • Year and Date
      20100900

URL: 

Published: 2014-08-29  

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