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2012 Fiscal Year Annual Research Report

転写因子TFIIHサブ複合体の構造解析

Research Project

Project/Area Number 22770110
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

小森 博文  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 助教 (30382261)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2014-03-31
Keywordsタンパク質複合体 / X線結晶構造解析 / 転写因子
Research Abstract

RNAポリメラーゼIIによるDNA転写制御機構を明らかにするために、転写因子の構造をX線結晶解析によって決定することが最終的な目的である。これまでに、転写因子TFIIHサブ複合体(SSL1, TFB1, TFB2, TFB4)と転写因子TFIIEの精製を行った。TFIIHサブ複合体については、バキュロウイルスを利用して、昆虫細胞内で、4つのタンパク質(SSL1, TFB1, TFB2, TFB4)を共発現することで、サブ複合体を再構成した。Strep-tagを利用した精製により、サブ複合体の精製を行っているが、結晶化に適する試料の大量精製には至っていない。しかし、4つのタンパク質のなかで最も安定な複合体を形成するSSL1とTFB4を大腸菌内で共発現したところ、大量発現・精製することに成功した。転写因子TFIIEについては、TFIIEを構成する二つのタンパク質TFIIEalphaとTFIIEbetaを大腸菌内で共発現することにより大量発現し、グルタチオンカラムとNi-NTAカラムを利用したアフィニティークロマトグラフィーによ高純度に精製することに成功している。TFIIE単独あるいはDNA複合体の結晶化を現在進めている。さらに、鉄依存的に転写を制御する働きをする新たな酵母の転写因子Fep1-Grx4複合体の大腸菌発現系の構築を行った。今後、大量精製・結晶化を行い、その立体構造から転写制御のメカニズムを原子レベルで明らかにする予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究は、DNA転写制御機構を明らかにするために、転写因子の構造をX線結晶解析によって決定することが最終目標である。そのためには、結晶化に適する標的タンパク質の大量精製が最も重要なステップである。これまでに、TFIIHの二つのタンパク質SSLとTFb4からなるタンパク質複合体とTFIIEの精製に成功している。さらに、新たな酵母の転写因子Fep1-Grx4複合体の発現系構築にも成功している。今後、これらのタンパク質複合体の結晶化・構造解析を進める予定である。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、DNA転写制御機構を明らかにするために、転写因子の構造をX線結晶解析によって決定することが最終目標である。これまでに、転写因子複合体試料を高純度に大量精製することに成功しているので、次の課題は、幅広い結晶化スクリーニングを進めて、X線回折実験に適する単結晶を得ることである。さらに、新たな酵母の転写因子Fep1-Grx4複合体の大量精製、結晶化も進める予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2012 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] An O-centered structure of the trinuclear copper center in the Cys500Ser/Glu506Gln mutant of CueO and structural changes in low to high X-ray dose conditions.2012

    • Author(s)
      Komori H, Sugiyama R, Kataoka K, Higuchi Y, Sakurai T.
    • Journal Title

      Angew Chem Int Ed Engl.

      Volume: 51 Pages: 1861-1864

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and enzymatic characterization of BacD, an L-amino acid dipeptide ligase from Bacillus subtilis.2012

    • Author(s)
      Shomura Y, Hinokuchi E, Ikeda H, Senoo A, Takahashi Y, Saito J, Komori H, Shibata N, Yonetani Y, Higuchi Y.
    • Journal Title

      Protein Sci.

      Volume: 21 Pages: 707-716

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase2012

    • Author(s)
      Komori H, Nitta Y, Ueno H, Higuchi Y.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun.

      Volume: 68 Pages: 675-677

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural study reveals that Ser-354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase.2012

    • Author(s)
      Komori H, Nitta Y, Ueno H, Higuchi Y.
    • Journal Title

      J Biol Chem.

      Volume: 287 Pages: 29175-29183

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Domain swapping of the heme and N-terminal α-helix in Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c(552) dimer.2012

    • Author(s)
      Hayashi Y, Nagao S, Osuka H, Komori H, Higuchi Y, Hirota S.
    • Journal Title

      Biochemistry.

      Volume: 51 Pages: 8608-8616

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photosensitivity of the Ni-A state of [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with visible light.2012

    • Author(s)
      Osuka H, Shomura Y, Komori H, Shibata N, Nagao S, Higuchi Y, Hirota S.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 430 Pages: 284-288

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria constituents on recombinant human histidine decarboxylase.2012

    • Author(s)
      Nitta Y, Kikuzaki H, Azuma T, Ye Y, Sakaue M, Higuchi Y, Komori H, Ueno H.
    • Journal Title

      Food Chem.

      Volume: 138 Pages: 1551-1556

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ヒト由来ヒスチジン脱炭酸酵素の構造解析2012

    • Author(s)
      小森博文
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡(福岡県)
    • Year and Date
      20121214-20121216
  • [Presentation] Structural basis for the histamine synthesis by human histidine decarboxylase2012

    • Author(s)
      Hirofumi Komori
    • Organizer
      Asian Crystallographic Association
    • Place of Presentation
      Adelaide (Australia)
    • Year and Date
      20121202-20121206
  • [Presentation] X線照射によるマルチ銅活性中心の構造変化2012

    • Author(s)
      小森博文
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県)
    • Year and Date
      20121025-20121026
  • [Remarks] 研究内容 - 小森研究室

    • URL

      http://www.ed.kagawa-u.ac.jp/~komori/research.html

URL: 

Published: 2014-07-24  

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