Establishment of digital PCR for the determination of NUDT15 diplotype in patients with pediatric acute lymphoblastic leukemia

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 22K15944
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 52050:Embryonic medicine and pediatrics-related
• Research Institution: Yamaguchi University
• Principal Investigator: Ichimura Takuya 山口大学, 医学部附属病院, 助教 (10761900)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 急性リンパ性白血病 / 6-メルカプトプリン / NUDT15 / デジタルPCR

Outline of Final Research Achievements

For the treatment of pediatric acute lymphoblastic lekemia, 6-mercaptopurine (6-MP) is one of the essential drugs. NUDT15 variants were identified as a major determinant of 6-MP intolerance, but the method for NUDT15 variants analysis including diplotype analysis is not established.
We could identify the patient has multiple variants of NUDT15 exon1 and exon 3 as compound heterozygosity by diplotype analysis using digital PCR, and show that it was 6-MP dose at the same level as homozygosity.

Free Research Field

血液腫瘍

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまでにデジタルPCRを用いたNUDT15 多型のディプロタイプ解析が可能であった報告はなかったが、本研究ではNUDT15 多型の有無に加えてディプロタイプ解析まで必要だった1症例について、デジタルPCRを用いた解析が可能であることを示した。また、複合ヘテロ接合性多型であった場合は、既報告と同様にホモ接合性多型と同程度に6-MPの減量が必要であることを示した。
本研究ではNUDT15 多型のディプロタイプ解析まで必要だった症例が1例のみであったため、今後さらなる症例を集積し他の多型についても同じ方法で解析が可能かどうかを検討する必要がある。