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2011 Fiscal Year Annual Research Report

アンプリコミクス解析のための実験技術基盤の構築

Research Project

Project/Area Number 23241064
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

仙波 憲太郎  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (70206663)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伊藤 恵美  福島県立医科大学, 医学部, 助教 (50540796)
今井 順一  福島県立医科大学, 医学部, 准教授 (70376739)
Keywords分子腫瘍学 / ゲノム発現 / 婦人科腫瘍学
Research Abstract

遺伝子の質的・量的変異はさまざまな疾患を発症させる。点変異や染色体転座によって変異した遺伝子は次世代シークエンス技術の進歩により確定できるようになったが、複数の遺伝子が増幅する遺伝子増幅では、配列情報だけで疾患の原因遺伝子を確定することは不可能である。我々は、遺伝子増幅が最も顕著に見られる「癌」に着目し、これまでに収集した「2000例以上におよぶ癌組織の遺伝子発現情報」および「ヒト完全長cDNAライブラリー」という独自の研究資源を利用したアンプリコンの体系的機能解析システム(systematic functional analysis of amplicomes)を提案し、癌におけるamplicemeの生物学的意義を明らかにする。
平成23年度は、異なる3種の細胞を用いる実験系でトランスフォーメーションと浸潤能の促進を指標とした遺伝子機能評価系を立ち上げ、乳癌の25%に見られる代表的な17q12-21のアンプリコン(ErbB2アンプリコン)を中心として、発癌に関わる遺伝子のスクリーニングを行った。その結果、ErbB2アンプリコンにはこれまでに知られていた癌遺伝子ERBB2以外に少なくとも2種類の発癌に関与・する遺伝子(HNF-18とGRB7)と少なくとも1種類の浸潤能の促進に関わる遺伝子(RARA)が存在することを明らかにした。このうち、GRB7はそれ自身ではNIH3T3細胞をトランスフォームする活性を持たないが、ERBB2と協調的にトランスフォーメーションを促進するcontext-dependent oncogene(サポーター遺伝子)であることがわかった。
以上の成果の一部は、日本癌学会学術総会などで発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

23年度は、ErbB2増幅乳癌にみられるErbB2アンプリコンに、トランスフォーム活性のある遺伝子を2種、浸潤能を促進する遺伝子を1種、新たに見いだしたアンプリコンからもトランスフォーム活性のある遺伝子を1種同定し、一部の成果は論文投稿中である。また、浸潤能を検証する機能アッセイを立ち上げ、新たな遺伝子を同定することにも成功した。

Strategy for Future Research Activity

平成23年度にはあらたに浸潤能を検証する実験系を確立した関係で、乳癌のアンプリコン23カ所の包括的な解析は終了していない。これについては24年度以降も引き続いて解析していく。

  • Research Products

    (8 results)

All 2011

All Presentation (8 results)

  • [Presentation] Identification of a novel oncogene by systematic screening using NMuMG immortalized epithelial cells and a full-length cDNA expression library2011

    • Author(s)
      Atsuka Matsui
    • Organizer
      Advances in breast cancer research : genetics, biology, and clinical applications
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ(アメリカ)
    • Year and Date
      2011-10-14
  • [Presentation] GSC promotes tumorigenecity of ERBB2-expressing cells2011

    • Author(s)
      Kentaro Kumazawa
    • Organizer
      Advances in breast cancer research : genetics, biology, and clinical applications
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ(アメリカ)
    • Year and Date
      2011-10-14
  • [Presentation] RARA promotes the disruption of acinal structures induced by ERBB2 within the three-dimensional culture of MCF10A2011

    • Author(s)
      Ayano Doi
    • Organizer
      Advances in breast cancer research : genetics, biology, and clinial applications
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ(アメリカ)
    • Year and Date
      2011-10-14
  • [Presentation] MCF10A三次元培養を利用した発癌の初期過程に関わる遺伝子スクリーニング系の確立2011

    • Author(s)
      土井綾乃
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] Context-dependent oncogene in the ERBB2 amplicon : Identification of GRB7 as a bona fide supporter of ERBB22011

    • Author(s)
      斉藤諒
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] ERBB2+サブタイプ乳癌の発癌におけるEMT誘導遺伝子の役割2011

    • Author(s)
      熊澤建太郎
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] 上皮系細胞と全長cDNAを用いてのスクリーニングによる新規癌遺伝子の同定と機能の解析2011

    • Author(s)
      松井貴香
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Presentation] Identification of a context-dependent oncogene in ErbB2-positive cancer2011

    • Author(s)
      Makoto Saito
    • Organizer
      Mechanisms and models of cancer
    • Place of Presentation
      サンディエゴ(アメリカ)
    • Year and Date
      2011-08-14

URL: 

Published: 2013-06-26  

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