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2012 Fiscal Year Annual Research Report

光受容体シアノバクテリオクロムと光応答現象の多様性と分子機構の統合解析

Research Project

Project/Area Number 23370014
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

池内 昌彦  東京大学, 総合文化研究科, 教授 (20159601)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywords光受容体 / 結晶構造 / シグナル伝達 / c-di-GMP / フィトクロム
Research Abstract

①好熱性シアノバクテリアThermosynechococcusに存在するシアノバクテリオクロム型光受容体ドメインをもつc-di-GMP合成酵素(diguanylate cyclase)であるTlr0911とc-di-GMP分解酵素(phosphodiesterase)であるTlr1999、Tlr0911全長を大腸菌とシアノバクテリアで発現し、大量精製し、その活性をHPLCで測定した。Tlr1999はシアン光で活性化されるc-di-GMP分解酵素を示した。一方、Tlr0911は緑光で活性化されるc-di-GMP分解酵素と青光で活性化されるc-di-GMP合成酵素を示した。なお、後者は合成・分解の複合活性であり、さらなる検討が必要である。これらの結果は、Tlr0924が青光活性化型c-di-GMP合成酵素であるという我々のこれまでの結果と合わせて、好熱性シアノバクテリアにおける光シグナルの統合的感知機構の全貌がほぼ明らかになった。走光性を調節するTePixJのGAFドメインのPg型の結晶構造を決定した。この構造から、D環が予想通りE配向であり、Pb型で重要な役割を果たしているAsp残基がD環に結合していることが明らかになった。
②珪藻Phaeodactylumのフィトクロム様光受容体を精製し、ヒスチジンキナーゼの自己リン酸化活性を測定し、赤光でその活性が大きく促進されることを見いだした。
③長波長型シアノバクテリオクロムの探索として、いくつかの候補遺伝子を発現・精製したが、今後のさらなる検討が必要である。フィトクロモビリン発現大腸菌を用いて、未知の長波長吸収型色素を結合するシアノバクテリオクロムを見いだした。その色素解析から、ビリベルジンが結合している可能性が示された。またN. azollaeのCcaS様タンパク質を単離して分光特性を明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

1.Tlr0911がデュアルセンサータンパク質であることを示す、非常にきれいな結果が得られた。このような前例はないもので、この成果は当初目的を越える成果である。
2.TePixJの結晶構造を決定できたことは、当初の予定を越える大きな成果である。

Strategy for Future Research Activity

1.TePixJのPb型、Tlr1999などの結晶解析を試みる。統合解析として、細胞レベルの光応答と複数の光受容体との関係を明らかにする。
2.珪藻フィトクロムの活性調節機構をさらに詳しく調べる。
3.長波長型シアノバクテリオクロムの性質を詳しく調べ、応用の可能性を検討する。

  • Research Products

    (15 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structures of cyanobacteriochromes from phototaxis regulators AnPixJ and TePixJ reveal general and specific photoconversion mechanism2013

    • Author(s)
      Narikawa, R.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A

      Volume: 110 Pages: 918-23

    • DOI

      doi: 10.1073/pnas.1212098110

  • [Journal Article] Green/red cyanobacteriochromes regulate complementary chromatic acclimation via a protochromic photocycle2013

    • Author(s)
      Hirose, Y.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A

      Volume: 110 Pages: 4974-79

    • DOI

      doi: 10.1073/pnas.1302909110

  • [Journal Article] Proteases are associated with a minor fucoxanthin chlorophyll a/c-binding protein from the diatom, Chaetoceros gracilis2012

    • Author(s)
      R. Nagao, T. Tomo, E. Noguchi, T. Suzuki, A. Okumura, R. Narikawa, I. Enami and M. Ikeuchi
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1817 Pages: 2110-2117

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell surface-associated proteins in the filamentous cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 71202012

    • Author(s)
      Yoshimura H, Ikeuchi M, Ohomori M.
    • Journal Title

      Microbes Environ

      Volume: 27 Pages: 538-43

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deletion of psbJ leads to accumulation of Psb27-Psb28 photosystem II complexes in Thermosynechococcus elongatus2012

    • Author(s)
      Nowaczyk MM, Krause K, Mieseler M, Sczibilanski A, Ikeuchi M, Rögner M
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta

      Volume: 1817 Pages: 1339-45

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Thiol-based photocycle of the blue and teal light–sensing cyanobacteriochrome Tlr19992012

    • Author(s)
      Enomoto, G.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 3050-3058

    • DOI

      doi: 10.1021/bi300020u

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Time-resolved tracking of interprotein signal transduction: Synechocystis PixD-PixE complex as a sensor of light intensity2012

    • Author(s)
      Tanaka, K.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc

      Volume: 134 Pages: 8336-9

    • DOI

      doi: 10.1021/ja301540r

  • [Journal Article] Cloning, expression, crystallization and preliminary X-ray studies of the ferredoxin-NAD(P)+ reductase from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus BP-12012

    • Author(s)
      Liauw, P.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun

      Volume: 68 Pages: 1048-51

    • DOI

      doi: 10.1107/S1744309112031910

  • [Presentation] シアノバクテリオクロム型光受容体によるc-di-GMPシグナリングの酵素学的考察2013

    • Author(s)
      榎本元
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      20130321-20130323
  • [Presentation] Analysis of local structure of proteins that bind to isoalloxazine ring2013

    • Author(s)
      鈴木布美子
    • Organizer
      日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(滋賀県)
    • Year and Date
      20130308-20130310
  • [Presentation] Diversity of cyanobacteriochromes and photoresponses in cyanobacteria2012

    • Author(s)
      池内昌彦
    • Organizer
      IPMB
    • Place of Presentation
      Jeju, Korea
    • Year and Date
      20121022-20121027
    • Invited
  • [Presentation] c-di-GMP Signaling in Thermophilic Cyanobacteria2012

    • Author(s)
      池内昌彦
    • Organizer
      日本フィンランド二国間セミナー
    • Place of Presentation
      Naantali, Finland
    • Year and Date
      20120908-20120913
    • Invited
  • [Presentation] Creation of chimera photoreceptors to develop various light switches for effective photosynthesis-based bioenergy production2012

    • Author(s)
      成川礼
    • Organizer
      ISPP
    • Place of Presentation
      Porto, Portgal
    • Year and Date
      20120805-20120810
  • [Presentation] Cyanobacteriochrome Tlr1999 as a teal-light-activated c-di-GMP phosphodiesterase2012

    • Author(s)
      榎本元
    • Organizer
      ISPP
    • Place of Presentation
      Porto, Portgal
    • Year and Date
      20120805-20120810
  • [Remarks] 池内・成川光合成研究室

    • URL

      http://photosynthesis.c.u-tokyo.ac.jp/indexJ.html

URL: 

Published: 2014-07-24  

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