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2012 Fiscal Year Annual Research Report

プロテアソーム構造変換による植物のストレス適応能力の解明

Research Project

Project/Area Number 23380198
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

山口 淳二  北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (10183120)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 千葉 由佳子  北海道大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (70509546)
柳川 由紀  独立行政法人理化学研究所, 植物科学センター, 研究員 (90432591)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2014-03-31
Keywordsユビキチン・プロテアソーム / 代謝 / タンパク質分解 / ストレス寛容植物 / シロイヌナズナ
Research Abstract

本研究では,植物のストレス適応に関与するプロテアソームの構造変換機能の全容解明を目指し,1)プロテオミクスを用いたプロテアソームサブユニット構造変換の解明,2)プロテアソーム相互作用ネットワークの解明,3)SCFタイプE3についての網羅的な解析,の3課題を実施した。
1)プロテアソームパラログ分子の量比が環境変化によってどのように変動していくかについて検討した結果,病原体エリシターflg22処理に伴うプロテアソームサブユニット変動についての研究を進め,サブユニットの酸化(カルボニル化)を検出した。
2)本課題に関しては,すでにまとめの段階となっていて,論文作成,投稿を進めた。
3)シロイヌナズナを用いて,ユビキチン/プロテアソーム依存的なタンパク質分解を制御するSCFタイプE3についての網羅的な解析である。これにより,シロイヌナズナでは多種類のSCFタイプ型E3が存在し,それらが各組織及び細胞内器官で特異的な役割を果たすと示唆される結果を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

3つの計画には,進展具合に差がある。2では論文をまとめる段階であるが,それ以外については,さらに進めていく予定である。

Strategy for Future Research Activity

最終年度に当たり,すでに得られた研究成果をまとめ,論文報告に結びつけるとともに,将来を見据えた布石を打ちつつ,研究を進展させたい。

  • Research Products

    (16 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Changes in mRNA stability associated with cold stress in Arabidopsis cells.2013

    • Author(s)
      Chiba Y, Mineta K, Hirai MY, Suzuki S, Kanaya S, Takahashi H, Onouchi H, Yamaguchi J, Naito S
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 54 Pages: 180-194

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs164

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Arabidopsis ubiquitin ligases ATL31 and ATL6 control the defense response as well as the carbon/nitrogen response.2012

    • Author(s)
      Maekawa S, Sato T, Asada Y, Yasuda S, Yoshida M, Chiba Y, Yamaguchi J
    • Journal Title

      Plant Molecular Biology

      Volume: 79 Pages: 217-227

    • DOI

      10.1007/s11103-012-9907-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sugar-inducible RPT2a, a subunit of 26S proteasome, participates in sugar response in Arabidopsis.2012

    • Author(s)
      Sun H, Sako K, Suzuki Y, Maekawa S, Yasuda S, Chiba Y, Sato T and Yamaguchi J
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 29 Pages: 279-284

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.12.0409a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis RPT2a, 19S proteasome subunit, regulates gene silencing via DNA methylation.2012

    • Author(s)
      Sako K, Maki Y, Kanai T, Kato E, Maekawa S, Yasuda S, Sato T, Watahiki MK, Yamaguchi J
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7 Pages: e37086

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0037086

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A comprehensive analysis of interaction and localization of Arabidopsis SKP1-LIKE (ASK) and F-Box (FBX) proteins.2012

    • Author(s)
      H. Kuroda , Y. Yanagawa, N. Takahashi, Y. Horii, M. Matsui
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7 Pages: e50009

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0050009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of gamete membrane dynamics during double fertilization of Arabidopsis.2012

    • Author(s)
      T. Igawa, Y. Yanagawa, S. Miyagishima, T. Mori
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 126 Pages: 387-394

    • DOI

      10.1007/s10265-012-0528-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ubiquitin/proteasome-mediated proteolysis is involved in the response to flooding stress in soybean roots2012

    • Author(s)
      Y. Yanagawa, S. Komatsu
    • Journal Title

      Plant Science

      Volume: 185-186 Pages: 250-258

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2011.11.014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 序論:酵母から動植物まで包括するユビキチン-プロテアソーム系の新展開2012

    • Author(s)
      山口淳二,畠山鎮次
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 84 Pages: 407-408

  • [Journal Article] 植物のRING型ユビキチンリガーゼとプロテアソームシステムの機能2012

    • Author(s)
      前川修吾,佐古香織,佐藤長緒
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 84 Pages: 416-424

  • [Journal Article] プロテオーム解析から解く植物のユビキチン-プロテアソーム研究2012

    • Author(s)
      柳川由紀
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 84 Pages: 448-454

  • [Journal Article] 植物26Sプロテアソームの多様な機能-「品質管理」にとどまらず器官サイズや遺伝子サイレンシングなど様々な現象を制御-2012

    • Author(s)
      佐古香織
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 50 Pages: 232-234

  • [Presentation] タンパク質複合体や相互作用するタンパク質の精製・解析方法2012

    • Author(s)
      柳川由紀
    • Organizer
      第165回農林交流センターワークショップ「第25回タンパク質構造解析シリーズ・生物機能解明のためのプロテオーム解析-講義と実験-」
    • Place of Presentation
      農研機構作物研究所(つくば市)
    • Year and Date
      20120924-20120926
    • Invited
  • [Presentation] ユビキチン-プロテアソームシステムによるC/N代謝制御の分子基盤-シロイヌナズナからマイクロトマトへ2012

    • Author(s)
      山口淳二
    • Organizer
      シンポジウム「遺伝子組換え技術を利用した植物の代謝制御」,日本植物細胞分子生物学会(生駒)大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      奈良先端大学院大学(生駒市)
    • Year and Date
      20120803-20120805
    • Invited
  • [Book] Frontiers in Agriculture Proteome Research (Proteomics approach to study metabolic regulation mediated by ubiquitin-proteasome system in Arabidopsis.)2013

    • Author(s)
      Yasuda S, Maekawa S, Sato T, Yamaguchi J
    • Total Pages
      39-44
    • Publisher
      NARO Institute of Crop Science
  • [Book] Frontiers in Agriculture Proteome Research (Cell wall proteomics of crops)2013

    • Author(s)
      S. Komatsu, Y. Yanagawa
    • Total Pages
      1-8
    • Publisher
      NARO Institute of Crop Science
  • [Remarks] 山口・千葉研究室

    • URL

      http://www.sci.hokudai.ac.jp/~jjyama/keitai2/Welcome.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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