2013 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンサーを用いた統合的遺伝子解析による慢性Ｃ型肝炎の病態解明
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23390195
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| Research Institution | University of Yamanashi |
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Principal Investigator |
榎本 信幸 山梨大学, 医学工学総合研究部, 教授 (20251530)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
前川 伸哉 山梨大学, 医学工学総合研究部, 講師 (70397298)
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| Project Period (FY) |
2011-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | HCV / HCC / 次世代シークエンス / プロテアーゼ阻害剤 / NS5A阻害剤 |
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| Research Abstract |
1.プロテアーゼ阻害剤、NS5A阻害剤治療反応性を規定するHCV変異体の解明
NS5A阻害剤daclatasvir未投与のgenotype 1b HCV 110症例を対象とし、NS5A領域のdaclatasvir耐性変異をdeep sequencerを用いて解析し、0.1%以上の耐性変異の混在を検出した。その結果、NS5A耐性変異の中でもY93H変異は、34/110(30.9%)もの頻度で存在し、インターフェロン感受性を規定する宿主因子IL28B SNPと有意に関連があることを明らかとした。
またプロテアーゼ阻害剤telaprevirを含む3剤併用療法を導入したgenotype１bHCV34症例を対象として、治療前後の血清を用いNS3領域のdeep sequenceを行い、治療前に一部の症例ではtelaprevir治療前から耐性変異HCVが存在するもののその頻度は低いことを明らかとした。一方、臨床的なtelaprevir耐性症例においてtelaprevir耐性変異HCVは、telaprevirを中止するとdominantなHCVは野生型に再び戻るものの、telaprevir耐性変異HCVはminor populationとして長期にわたり残存する場合があることを明らかとした。さらにプロテアーゼ阻害剤telaprevirを含む3剤併用療法におけるHCVゲノムの多様性は宿主因子IL28B SNPに有意に規定されることも明らかとした。
2.肝癌遺伝子変異の超高感度検出
東京医科歯科大学消化器内科との共同研究により、次世代シークエンス技術を用いた慢性肝炎、肝硬変組織における網羅的な癌遺伝子変異の高感度検出法の開発を行い、臨床検体を用いて解析を行った。すなわち肝癌50症例において50癌関連遺伝子2800変異部位にわたる網羅的な癌遺伝子変異の高感度検出を行ったところ、慢性肝炎から肝癌に至る過程でβカテニン変異が肝発癌において重要な役割を担っていることを明らかとした。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(14 results)
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[Journal Article] Inhibitory effects of caffeic Acid phenethyl ester derivatives on replication of hepatitis C virus.2013
Author(s)
Shen H, Yamashita A, Nakakoshi M, Yokoe H, Sudo M, Kasai H, Tanaka T, Fujimoto Y, Ikeda M, Kato N, Sakamoto N, Shindo H, Maekawa S, Enomoto N, Tsubuki M, Moriishi K.
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Journal Title
PLoS One.
Volume: 17
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Changes in plasma vascular endothelial growth factor at 8 weeks after sorafenib administration as predictors of survival for advanced hepatocellular carcinoma.2013
Author(s)
Tsuchiya K, Asahina Y, Matsuda S, Muraoka M, Nakata T, Suzuki Y, Tamaki N, Yasui Y, Suzuki S, Hosokawa T, Nishimura T, Ueda K, Kuzuya T, Nakanishi H, Itakura J, Takahashi Y, Kurosaki M, Enomoto N, Izumi N.
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Journal Title
Cancer.
Volume: 15;120(2)
Pages: 229-237
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Deep-sequencing analysis of the association between the quasispecies nature of the hepatitis C virus core region and disease progression.2013
Author(s)
Miura M, Maekawa S, Takano S, Komatsu N, Tatsumi A, Asakawa Y, Shindo K, Amemiya F, Nakayama Y, Inoue T, Sakamoto M, Yamashita A, Moriishi K, Enomoto N.
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Journal Title
J Virol.
Volume: 87(23)
Pages: 12541-12551
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genetic variation near interleukin 28B and the risk of hepatocellular carcinoma in patients with chronic hepatitis C.2013
Author(s)
Asahina Y, Tsuchiya K, Nishimura T, Muraoka M, Suzuki Y, Tamaki N, Yasui Y, Hosokawa T, Ueda K, Nakanishi H, Itakura J, Takahashi Y, Kurosaki M, Enomoto N, Nakagawa M, Kakinuma S, Watanabe M, Izumi N.
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Journal Title
J Gastroenterol.
Volume: Jul 17
Pages: -
Peer Reviewed
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[Journal Article] Impaired brain activity in cirrhotic patients with minimal hepatic encephalopathy: Evaluation by near-infrared spectroscopy.2013
Author(s)
Nakanishi H, Kurosaki M, Nakanishi K, Tsuchiya K, Noda T, Tamaki N, Yasui Y, Hosokawa T, Ueda K, Itakura J, Anami K, Asahina Y, Enomoto N, Higuchi T, Izumi N.
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Journal Title
Hepatol Res
Volume: Apr 5.
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] α-fetoprotein levels after interferon therapy and risk of hepatocarcinogenesis in chronic hepatitis C.2013
Author(s)
Asahina Y, Tsuchiya K, Nishimura T, Muraoka M, Suzuki Y, Tamaki N, Yasui Y, Hosokawa T, Ueda K, Nakanishi H, Itakura J, Takahashi Y, Kurosaki M, Enomoto N, Nakagawa M, Kakinuma S, Watanabe M, Izumi N.
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Journal Title
Hepatology
Volume: 58(4)
Pages: 1253-1262
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] IL-28B (IFN-λ3) and IFN-α synergistically inhibit HCV replication.2013
Author(s)
Shindo H, Maekawa S, Komase K, Miura M, Kadokura M, Sueki R, Komatsu N, Shindo K, Amemiya F, Nakayama Y, Inoue T, Sakamoto M, Yamashita A, Moriishi K, Enomoto N.
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Journal Title
J Viral Hepat.
Volume: 20(4)
Pages: 281-289
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Model incorporating the ITPA genotype identifies patients at high risk of anemia and treatment failure with pegylated-interferon plus ribavirin therapy for chronic hepatitis C.2013
Author(s)
Kurosaki M, Tanaka Y, Nishida N, Sakamoto N, Enomoto N, Matsuura K, Asahina Y, Nakagawa M, Watanabe M, Sakamoto M, Maekawa S, Tokunaga K, Mizokami M, Izumi N.
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Journal Title
J Med Virol.
Volume: 85(3)
Pages: 449-458
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Serum RANTES level influences the response to pegylated interferon and ribavirin therapy in chronic hepatitis C.2013
Author(s)
Komase K, Maekawa S, Miura M, Sueki R, Kadokura M, Shindo H, Shindo K, Amemiya F, Nakayama Y, Inoue T, Sakamoto M, Yamashita A, Moriishi K, Enomoto N
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Journal Title
Hepatol Res.
Volume: 43(8)
Pages: 865-875
DOI
Peer Reviewed
