2013 Fiscal Year Annual Research Report
高精度時系列プロテオミクスによるシグナル伝達攪乱機構のシステム解析
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23510254
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
尾山 大明 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (30422398)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
秦 裕子 東京大学, 医科学研究所, 技術専門職員 (80401256)
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| Keywords | プロテオミクス / シグナル伝達 / システムバイオロジー / リン酸化 / 定量生物学 |
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| Research Abstract |
近年H.pylori感染において、病原因子の一つであるCagAが胃上皮細胞内のシグナル伝達因子をチロシンリン酸化し、細胞の癌化に関与することが明らかとなってきた。本研究課題では感染による病態をシステムレベルで理解するために、H.pylori感染におけるシグナル伝達因子の時系列活性変動データを包括的に取得することを目標とする。本研究グループはこれまでにSILAC（Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture）法をベースにしたチロシンリン酸化ネットワークの相対変動解析法（Blagoev et al., Nat. Biotechnol., 22, 1139-1145, 2004）を基盤として方法論の改良に取り組み、(1)チロシンリン酸化蛋白質の包括的回収・特異的溶出法の開発、(2)溶出物の一括酵素処理によって調製されたサンプルに関するショットガン解析を行うためのnanoLC-MS/MS測定系の構築、そして(3)得られた生データから自動で相対定量を行う情報解析システムの開発を進め、サンプル調製から活性変動データの作成に至るまでスループットが非常に高い実験系を確立している（Oyama et al., Mol. Cell. Proteomics, 8: 226-231, 2009）。平成25年度は、微量蛋白質群を分子量に基づいて液中で分離・回収することが可能なGelfree 8100 system を用いて試料の前分画を行い、分画ごとにリン酸化ペプチドサンプルの調製及び測定を進めることにより、16,000を超えるリン酸化ペプチドに関するH.pylori感染後の時系列活性変動情報を取得した。
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[Journal Article] Induction of toxin-specific neutralizing immunity by molecularly uniform rice-based oral cholera toxin B subunit vaccine without plant-associated sugar modification.2013
Author(s)
Yuki Y, Mejima M, Kurokawa S, Hiroiwa T, Takahashi Y, Tokuhara D, Nochi T, Katakai Y, Kuroda M, Takeyama N, Kashima K, Abe M, Chen Y, Nakanishi U, Masumura T, Takeuchi Y, Kozuka-Hata H, Shibata H, Oyama M, Tanaka K, and Kiyono H.
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Journal Title
Plant Biotechnol J
Volume: 11
Pages: 799-808
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] MucoRice-cholera toxin B-subunit, a rice-based oral cholera vaccine, down-regulates the expression of α-amylase/trypsin inhibitor-like protein family as major rice allergens.2013
Author(s)
Kurokawa S, Nakamura R, Mejima M, Kozuka-Hata H, Kuroda M, Takeyama N, Oyama M, Satoh S, Kiyono H, Masumura T, Teshima R, and Yuki Y.
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Journal Title
J Proteome Res
Volume: 12
Pages: 3372-3382
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Rice-based oral antibody fragment prophylaxis and therapy against rotavirus infection.2013
Author(s)
Tokuhara D, Alvarez B, Mejima M, Hiroiwa T, Takahashi Y, Kurokawa S, Kuroda M, Oyama M, Kozuka-Hata H, Nochi T, Sagara H, Aladin F, Marcotte H, Frenken LG, Iturriza-Gomara M, Kiyono H, Hammarstrom L, and Yuki Y.
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Journal Title
J Clin Invest
Volume: 123
Pages: 3829-3838
DOI
Peer Reviewed
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