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2011 Fiscal Year Research-status Report

ゲノム刷り込みに基づくiPS細胞分化能の指標作成

Research Project

Project/Area Number 23659181
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

副島 英伸  佐賀大学, 医学部, 教授 (30304885)

Project Period (FY) 2011-04-28 – 2014-03-31
Keywordsエピジェネティクス / ゲノムインプリンティング / iPS細胞 / DNAメチル化 / 分化万能性
Research Abstract

マウス新生仔F1線維芽細胞から8クローンのiPS細胞(iPSC)を作製した。1クローンはセンダイウイルス(4ファクター:Sox, Klf4, Oct, Myc)で、3クローンはセンダイウイルス(3ファクター:Sox, Klf4, Oct)で、4クローンはレトロウイルス(4ファクター:Sox, Klf4, Oct, Myc)で樹立した。線維芽細胞、未分化iPSC、レチノイン酸処理にて分化誘導したiPSCのゲノム中の28ヵ所の刷り込みDMRのメチル化についてMassARRAYを用いて定量的に解析した。未分化iPSCを線維芽細胞と比べたところ、4クローン以上で低メチル化を示したDMRは20ヵ所で、高メチル化を示したDMRは1ヵ所であった。RA処理iPSCは線維芽細胞に比べ、13ヵ所で低メチル化を示し、1ヵ所が高メチル化を示した。また、RA処理iPSCは未分化iPSCに比べ、5ヵ所で高メチル化を示した。このうち4ヵ所は、RA処理iPSCと線維芽細胞でメチル化の差異がない領域であり、RA処理により正常メチル化に回復したことを示す。これらの結果から、線維芽細胞をiPS化すると大半の刷り込みDMRは低メチル化を生じること、一部の刷り込みDMRはRA処理により正常メチル化に回復することがわかった。また、健常人とBeckwith-Wiedemann症候群(BWS)患者からiPSCを樹立した。2名の健常人末梢血由来iPSCそれぞれ4クローンずつ計8クローン、KvDMR1低メチル化で発症したBWS患者1例の末梢血から4クローン、H19-DMR高メチル化で発症したBWS患者1例の末梢血から4クローンのiPSCを樹立した。現在、樹立したiPSCについてゲノム中の38ヵ所の刷り込みDMRのメチル化解析を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

H23年度研究計画の主目的であるマウスiPSCの樹立と刷り込みDMRの解析が予定通り終了し、iPSCクローン間でメチル化状態が異なることがわかった。また、異なる原因で発症した2例のBWS患者と健常人2名からヒトiPSCも樹立できた。

Strategy for Future Research Activity

樹立したヒトiPSC(患者由来および健常者由来)のゲノム中の38ヵ所の刷り込みDMRのメチル化解析を行う。マウスiPSCを含めて、メチル化異常を示したDMRについては、pyrosequencing法あるいはbisulfite sequencing法で確認する。マウスiPSCの分化能評価については、ジャームラインキメラ法あるいはテトラプロイド・レスキュー法にて評価する。得た生産仔及び致死胚について刷り込みDMRのメチル化解析を行い、メチル化の変化の有無と程度を解析する。ヒトiPSCについては、in vitro分化およびヌードマウス接種による奇形種形成実験を行い、分化能を評価する。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

次年度は、主としてpyrosequencing法あるいはbisulfite sequencing法によるメチル化解析と細胞培養に必要な消耗品に研究費を充てる。その他、成果発表のための旅費、試料の運搬費、英文校正費に使用する予定である。

  • Research Products

    (22 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (14 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Aberrant methylation of H19-DMR acquired after2012

    • Author(s)
      Higashimoto K, et al.
    • Journal Title

      Am J Med Genet A

      Volume: in press Pages: xx-xx

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Beckwith-Wiedemann Syndrome with Placental2011

    • Author(s)
      Aoki A, et al.
    • Journal Title

      J Obstet Gynaecol Res

      Volume: 37 Pages: 1872-1876

    • DOI

      10.1111/j.1447-0756.2011.01654.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methylation dynamics of IG-DMR and Gtl2-DMR2011

    • Author(s)
      Sato S, et al.
    • Journal Title

      Genomics

      Volume: 98 Pages: 120-127

    • DOI

      10.1016/j.ygeno.2011.05.003

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Methylation screening of reciprocal genome-wide2011

    • Author(s)
      Nakabayashi K, et al.
    • Journal Title

      Hum Mol Genet

      Volume: 20 Pages: 3188-3197

    • DOI

      10.1093/hmg/ddr224

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tissue-specific demethylation in CpG-poor2011

    • Author(s)
      Nagae G, et al.
    • Journal Title

      Hum Mol Genet

      Volume: 20 Pages: 2710-2721

    • DOI

      10.1093/hmg/ddr170

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Beckwith-Wiedemann症候群に間葉性異形成胎盤を合併し、2011

    • Author(s)
      三好潤也、他
    • Organizer
      第19回日本胎盤学会学術集会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011.9.30-10.1.
  • [Presentation] Clinical features and genome/epigenome analyses of2011

    • Author(s)
      Soejima H
    • Organizer
      The 9th Korean PWS Symposium(招待講演)
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2011.9.27.
  • [Presentation] Acquisition of aberrant hypermethylation after2011

    • Author(s)
      Soejima H, et al.
    • Organizer
      Idibell Cancer Conferences
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2011.9.21-23
  • [Presentation] p57KIP2(KIP2)の遺伝子変異を認めたBeckwith-Wiedermann症候群2011

    • Author(s)
      岡田純一郎、他
    • Organizer
      第34回日本小児遺伝学会学術集会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011.8.11.
  • [Presentation] 本邦Beckwith-Wiedemann症候群の臨床像とゲノム・エピゲノム解析2011

    • Author(s)
      副島英伸、他
    • Organizer
      遺伝医学合同学術集会2011
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011.6.16-19.
  • [Presentation] Beckwith-Wiedemann症候群に間葉性異形成胎盤を合併し、2011

    • Author(s)
      三好潤也、他
    • Organizer
      遺伝医学合同学術集会2011
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011.6.16-19.
  • [Presentation] Methylation screening of reciprocal genome-wide2011

    • Author(s)
      Tayama C, et al.
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011.12.13-16.
  • [Presentation] Role of Histone H3 Lys36 methylation by Ash1l2011

    • Author(s)
      Higashimoto K, et al.
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011.12.13-16.
  • [Presentation] Aberrant methylation of H19-DMR acquired after2011

    • Author(s)
      Soejima H, et al.
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011.12.13-16.
  • [Presentation] 本邦Beckwith-Wiedemann症候群の臨床像とゲノム・エピゲノム解析2011

    • Author(s)
      副島英伸、他
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会 第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      2011.11.9-12.
  • [Presentation] Hemihypertrophyにおける11番染色体短腕BWS領域の異常について2011

    • Author(s)
      蒔田芳男、副島英伸
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第56回大会 第11回東アジア人類遺伝学会
    • Place of Presentation
      幕張
    • Year and Date
      2011.11.9-12.
  • [Presentation] 本邦における間葉性異形成胎盤の臨床像2011

    • Author(s)
      岡島 翠、大場 隆、片渕秀隆、東元 健、副島英伸
    • Organizer
      第18回遺伝性疾患に関する出生前診断研究会
    • Place of Presentation
      佐賀
    • Year and Date
      2011.10.1.
  • [Presentation] Beckwith-Wiedemann症候群の臨床像と遺伝子解析2011

    • Author(s)
      副島英伸
    • Organizer
      BWS親の会勉強会(招待講演)
    • Place of Presentation
      旭川市
    • Year and Date
      2011. 7. 30.
  • [Presentation] Beckwith-Wiedemann症候群の臨床像と遺伝子解析2011

    • Author(s)
      副島英伸
    • Organizer
      BWS親の会勉強会(招待講演)
    • Place of Presentation
      鹿児島市
    • Year and Date
      2011. 4. 9.
  • [Book] 症候群ハンドブック、第XIV章先天異常・奇形、ベックウィズ・ヴィーデマン症候群2011

    • Author(s)
      副島英伸
    • Total Pages
      757
    • Publisher
      中山書店
  • [Book] 症候群ハンドブック、第XIV章先天異常・奇形、シルバー・ラッセル症候群2011

    • Author(s)
      副島英伸
    • Total Pages
      757
    • Publisher
      中山書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biomol.med.saga-u.ac.jp/mbg/index.htm

URL: 

Published: 2013-07-10  

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