2011 Fiscal Year Research-status Report
新たな遺伝学手法による未知の脊髄小脳変性症遺伝子探索
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23659456
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
川上 秀史 広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (70253060)
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| Project Period (FY) |
2011-04-28 – 2013-03-31
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| Keywords | 脊髄小脳変性症 / 原因遺伝子 |
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| Research Abstract |
研究代表者は、２０００名以上の脊髄小脳変性症の患者DNAを用いて臨床遺伝学的研究に携わってきた。優性遺伝を示す脊髄小脳変性症は、我々のデータでは、２００名程度の患者が原因遺伝子不明である。特に中四国では優性遺伝を示す患者の４０％が原因遺伝子不明である。これを明らかにするためには、連鎖解析の対象となる大家系が必要であるが、これはかなり得難いものである。これまでの脊髄小脳変性症の遺伝子研究、特にSCA3やSCA6の研究において、世界的にみても同祖(one fouder)である可能性が指摘されている。SCA6のハプロタイプを解析した我々の結果においても、2M塩基対にわたって、共通のハプロタイプを示している(Neurosci Lett 358(2004)107-110)。このことは、未知の遺伝子異常においても、家系が異なっても、同祖であれば、この領域を同定することにより、原因遺伝子を同定できることを意味している。したがって、原因遺伝子不明の脊髄小脳変性症家系において、共通するハプロタイプを検出することにより、原因遺伝子を同定することが可能である。本年度においては、家系の拡大および既知の遺伝子異常の除外をおこないつつ、１０人の全ゲノムを対象にした約９０万個の単一塩基多型を決定した。さらに、１０人を対象にハプロタイプ解析を行ったが、この範囲においては、有意に共通のハプロタイプは見いだされなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
遺伝子不明の患者の蓄積，家系の収集、既知の原因遺伝子を除外し、予定どうり１０人のSNPタイピングを行い、ハプロタイプ解析を行った。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、さらにSNPタイピングを進め、直接原因遺伝子を同定するために、エクソームを次世代シーケンサーでシークエンスし、家系に共通な変異を探し出す予定である。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
物品費 消耗品 100万円
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