2012 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンサーを活用した統合失調症のトランスクリプトーム解析
| Project/Area Number |
23659563
|
|---|
| Research Institution | Nagoya University |
|---|
Principal Investigator |
尾崎 紀夫 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40281480)
|
|---|
| Keywords | トランスクリプトーム解析 / 統合失調症 / 分子精神医学 / ゲノム医学 / バイオインフォマティックス |
|---|
| Research Abstract |
１．<研究目的> 統合失調症のリンパ芽球様細胞株を検体としたトランスクリプトーム解析を実施し、分子病態に関与し得る遺伝子・エクソン発現変化を網羅的に同定する。同定された遺伝子群の発現を制御する遺伝子座位を同定し、統合失調症との機能的な関連についてpathway解析により検討する。これらを統合し、診断・治療法の開発へ繋がりうる成果取得を目指す。
２．<研究方法> 統合失調症患者・健常者各30名よりリンパ芽球様細胞株を調製し、total RNAを抽出してExon Arrayによる遺伝子発現解析、スプライシングバリアント検索を実施した。また、統合失調症560名、健常者548名を対象とした全ゲノム関連解析を実施し、遺伝子発現を制御するSNPと統合失調症との関連を調査した。
３．<研究結果および考察> Exon Arrayでは1115遺伝子の発現および1327エクソンの発現について有意差が認められ、軸索伸長や細胞骨格系など統合失調症と関連する分子機能を有する遺伝子群が見出された。スプライシングバリアント解析では、1743遺伝子について両群間で有意な変化が認められた。クラスタリング解析では患者群と健常者群を区別するクラスターに分類され、上位45遺伝子（精度87.5%）あるは上位197エクソン（187遺伝子：精度93.3%）から成る遺伝子・エクソンセットを見出した。アレル-遺伝子発現相関解析では、9972 SNPsについて遺伝子発現制御と関連し、そのうち87 SNPsについて統合失調症との関連が示唆された。一連の遺伝子解析により得られた成果から、より有力な統合失調症候補遺伝子群を絞り込み、効率的かつ感度・特異度を最適化した確度の高い診断モデルを構築し、診断技術の向上に加え、新規治療法の開発や病因・病態解明など臨床に還元可能な更なる研究が望まれる。
|
-
[Journal Article] Association of SNPs linked to increased expression of SLC1A1 with schizophrenia2012
Author(s)
Horiuchi Y, Iida S, Koga M, Ishiguro H, Iijima Y, Inada T, Watanabe Y, Someya T, Ujike H, Iwata N, Ozaki N, Kunugi H, Tochigi M, Itokawa M, Arai M, Niizato K, Iritani S, Kakita A, Takahashi H, Nawa H, Arinami T
-
Journal Title
Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet
Volume: 159B (1)
Pages: 30-7
DOI
Peer Reviewed
-
[Presentation] Schizophrenia associated polymorphism regulates PTPRA transcript expression in lymphoblastoid cell lines2012
Author(s)
Akira Yoshimi, Nagahide Takahashi, Branko Aleksic, Itaru Kushima, Masashi Ikeda, Hiroshi Ujike, Takeshi Sakurai, Joseph D. Buxbaum, Jan Sap, Nakao Iwata, Norio Ozaki
Organizer
the 11th World Congress of Psychiatric Genetics (WCPG 2012)
Place of Presentation
Hamburg, Germany
Year and Date
20121014-20121018
-
-
