Development of monitoring method for the alteration of phosphorylation status in proteasome subunits using Phos-tag electrophoresis

2012 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 23701086
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Tumor diagnosis
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: KIMURA Yayoi 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 特任助教 (80391936)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Keywords: プロテオミクス / リン酸化, Phos-tag 親和性電気泳動 / プロテアソーム

Research Abstract

The phosphorylation of proteasome subunits is thought to play an important role in the function of proteasome. However, the relationship between the phosphorylation of proteasome subunits and the regulation of functions has not been examined, and the phosphorylated status of proteasome subunits has not been biochemically characterized in detail. To monitor the alteration of phosphorylation status in proteasome subunits, the phosphorylated forms of each subunit were investigated using Phos-tag electrophoresis followed by immunoblotting. The results indicated that Phos-tag electrophoresis enabled us to separate and detect the phosphorylated forms of two proteasome subunits. Furthermore, Phos-tag electrophoresis indicated that the phosphorylation status in these proteasome subunits was modulated in response to external stimulation with hydrogen peroxide.

Research Products

• [Journal Article] Effects of growth hormone on the salmon pituitary proteome (2012)
  • Author(s): Yoichi Kurata, Yayoi Kimura, Yuko Yamanaka, Akiyo Ishikawa, Hiroyuki Okamoto, Tetsuji Masaoka, Hiroyuki Nagoya, Kazuo Araki, Shunsuke Moriyama, Hisashi Hirano, Tsukasa Mori
  • Journal Title: J. Proteomics Volume: 75 Pages: 1718-1731
  • DOI: doi:10.1016/j.jprot.2011.12.009
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Phos-tagアガロースおよび質量分析装置を用いたリン酸化ペプチドのショットガン分析 (2012)
  • Author(s): 木村弥生, 野村文子, 井野洋子, 小原收, 平野久
  • Journal Title: 生物物理化学 Volume: 56 Pages: s25-s28
  • DOI: doi:10.2198/sbk.56.s25
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 二次元 Phos-tag 親和性電気泳動 (2012)
  • Author(s): 木村弥生, 永田佳代子,平野久, 小原收
  • Journal Title: 生物物理化学 Volume: 56 Pages: s21-s24
  • DOI: doi:10.2198/sbk.56.s21
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nα-Acetylation of yeast ribosomal proteins and its effect on protein synthesis (2010)
  • Author(s): Masahiro Kamita, Yayoi Kimura, Yoko Ino, Roza M. Kamp, Bogdan Polevoda, Fred Sherman, Hisashi Hirano
  • Journal Title: J. Proteomics Volume: 74 Pages: 431-441
  • DOI: doi:10.1016/j.jprot.2010.12.007
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 出芽酵母リボソームタンパク質の Nα-アセチル化とそれがタンパク質合成に及ぼす影響 (2012)
  • Author(s): 紙田正博, 木村弥生, 井野洋子, 倉田洋一, 山田哲司, 尾野雅哉, 平野 久
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2012年大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20120726-27
• [Presentation] サケ脳下垂体プロテオームに対する成長ホルモンの影響 (2012)
  • Author(s): 倉田洋一, 木村弥生, 紙田正博, 山中結子, 石川晃代, 岡本裕之, 正岡哲治, 名古屋博之, 荒木和男, 森山俊介, 森 司, 平野 久
  • Organizer: 日本プロテオーム学会2012年大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20120726-27
• [Presentation] GPI アンカー型タンパク質の網羅的解析法の開発 (2012)
  • Author(s): 増石有佑, 木村弥生, 平野 久
  • Organizer: 日本プロテオーム学会 2012 年大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20120726-27
• [Presentation] Phos-tag 親和性電気泳動法を用いたヒトプロテアソームサブユニットのリン酸化状態の解析 (2012)
  • Author(s): 菅原経継、木村弥生、戸田年総、平野久
  • Organizer: 日本プロテオーム学会 2012 年大会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 20120726-27
• [Presentation] 酵母プロテアソームサブユニットのN末端メチル化 (2011)
  • Author(s): 木村弥生, 永田佳代子, 石川晃代, 平野 久
  • Organizer: 日本プロテオーム学会 2011年大会
  • Place of Presentation: 新潟
  • Year and Date: 20110728-29
• [Book] LC/MS/MS による疾患プロテオーム解析 (2012)
  • Author(s): 木村弥生, 平野 久
  • Total Pages: 247-258
  • Publisher: 丸善出版
• [Book] 翻訳後修飾のプロテオミクス (2011)
  • Author(s): 木村弥生
  • Total Pages: 52-67, 91-104, 144-151, 175-178
  • Publisher: 講談社