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2012 Fiscal Year Annual Research Report

相同組換えに関わる分裂酵母Rad51‐Swi5‐Sfr1複合体の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 23770105
Research InstitutionHigh Energy Accelerator Research Organization

Principal Investigator

桑原 直之  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 研究員 (70506253)

Keywords相同組換え / DNA修復 / メディエーター
Research Abstract

本研究ではSwi5-Sfr1 複合体に注目し、この複合体および相互作用分子であるRad51 との超分子複合体の構造機能相関解析を行った。X線結晶構造解析、X線小角散乱解析など複数の解析手法を組み合わせる事で、これら複合体が行う相同組み換えによる鎖交換反応の分子機構モデルを構築した。Swi5とSfr1C末端側領域(Sfr1C)の結晶構造を明らかにした。Swi5-Sfr1Cが複合体を形成すること、この複合体がRad51の活性化に必須である事を明らかにした。さらにSfr1のN末端側領域(Sfr1N)はSwi5-Sfr1Cの機能を促進する働きをもち、DNAやRad51結合能を持つ事を明らかにした。これら結果をStrucuture誌に報告した。結晶構造解析ではSfr1NとSfr1Cを分けて解析していたため、Sfr1の全体構造は明らかにできなかった。そこでSwi5-Sfr1全長複合体のX線小角散乱解析(SAXS)を行い、その低分解能溶液構造を明らかにした。Swi5-Sfr1は細長い棒状の構造をしていたため、そのトポロジーを知るのは困難であったが、複数のモノクロナール抗体との複合体のSAXSを測定する事により、Swi5-Sfr1複合体のトポロジーを明らかにし、X線結晶構造解析では明らかにできなかったSfr1Nの構造を明らかにした。これらの結果はJBC誌に報告した。この研究の過程でSfr1Nが天然変性領域である事をSAXS、CD、NMR、MS解析により明らかにした。またSAXSとMSを組み合わせることにより天然変性領域の同定や解析を行った結果についてAnalyst誌に報告した。本研究により、Swi5-Sfr1によるRad51活性化機構メカニズムを明らかにしたとともに蛋白質複合体や天然変性領域の解析手法の確立に貢献できた。

  • Research Products

    (3 results)

All 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Structural basis for vitamin D receptor agonism by novel nonsecosteroidal ligands.2013

    • Author(s)
      Lisa Asano, Ichiaki Ito, Naoyuki Kuwabara, Tsuyoshi Waku, Junn Yanagisawa, Hiroyuki Miyachi, Toshiyuki Shimizu
    • Journal Title

      FEBS letters

      Volume: 587 Pages: 957-963

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.02.028.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5-Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering.2013

    • Author(s)
      Kazumi Saikusa, Naoyuki Kuwabara, Yuichi Kokabu, Yu Inoue, Mamoru Sato, Hiroshi Iwasaki, Toshiyuki Shimizu, Mitsunori Ikeguchi, Satoko Akashi
    • Journal Title

      The Analyst

      Volume: 138 Pages: 1141-1149

    • DOI

      10.1039/c2an35878f.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural basis of the broad carbohydrates specificity of a fungal galectin from Agrocybe cylindricea2013

    • Author(s)
      Naoyuki Kuwabara, Dan Hu, Jun Hirabayashi, Ryuichi Kato
    • Organizer
      物構研サイエンスフェスタ
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場エポカル
    • Year and Date
      20130314-20130315

URL: 

Published: 2014-07-24  

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